MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 15617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017046	CGT	2	6	1308172	1308177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_017046	CGG	2	6	1308181	1308186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_017046	TC	3	6	1308458	1308463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4004	NC_017046	TGA	2	6	1308500	1308505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017046	TCC	2	6	1308563	1308568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4006	NC_017046	GAT	2	6	1308600	1308605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_017046	TCAT	2	8	1308672	1308679	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4008	NC_017046	GA	3	6	1308685	1308690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017046	ATA	2	6	1308691	1308696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017046	GTA	2	6	1308887	1308892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_017046	T	6	6	1308912	1308917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017046	CG	3	6	1308934	1308939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4013	NC_017046	TTTA	2	8	1308980	1308987	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_017046	AGA	2	6	1309092	1309097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_017046	A	6	6	1309759	1309764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_017046	GATA	2	8	1309784	1309791	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_017046	A	7	7	1309801	1309807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017046	ATA	2	6	1309832	1309837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017046	ATA	2	6	1310331	1310336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_017046	TAT	2	6	1310358	1310363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017046	ACC	2	6	1310377	1310382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_017046	GTT	2	6	1310436	1310441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_017046	CGGCG	2	10	1310461	1310470	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4024	NC_017046	A	6	6	1310482	1310487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017046	ATA	2	6	1310499	1310504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017046	GAC	2	6	1310521	1310526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_017046	GGTT	2	8	1310609	1310616	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017046	GCG	2	6	1311051	1311056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_017046	CCT	2	6	1311716	1311721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4030	NC_017046	TCA	2	6	1311797	1311802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_017046	AGGCG	2	10	1313031	1313040	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4032	NC_017046	ACT	2	6	1314364	1314369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_017046	CGC	2	6	1314485	1314490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4034	NC_017046	TTG	2	6	1314515	1314520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017046	TGA	2	6	1314568	1314573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_017046	CGT	2	6	1314580	1314585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_017046	GGGGA	2	10	1314634	1314643	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_017046	TAA	2	6	1316824	1316829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017046	AAT	2	6	1316834	1316839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_017046	AT	3	6	1316838	1316843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017046	TTAA	2	8	1316890	1316897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017046	AAAAT	2	10	1316920	1316929	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017046	TAT	2	6	1316936	1316941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017046	ATA	2	6	1316970	1316975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017046	CAA	2	6	1317021	1317026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_017046	GCTG	2	8	1317044	1317051	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4047	NC_017046	CGT	2	6	1317061	1317066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_017046	GATTTT	2	12	1317102	1317113	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_017046	T	6	6	1317110	1317115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017046	T	6	6	1317128	1317133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017046	CCT	2	6	1317172	1317177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4052	NC_017046	TAA	2	6	1317196	1317201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_017046	TAT	2	6	1317273	1317278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017046	GTA	2	6	1317283	1317288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_017046	C	6	6	1318638	1318643	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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4058	NC_017046	A	7	7	1320791	1320797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017046	AGA	2	6	1320824	1320829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017046	CTT	2	6	1320851	1320856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_017046	TCA	2	6	1320929	1320934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_017046	TGG	2	6	1320947	1320952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017046	ATC	2	6	1320985	1320990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_017046	ATC	2	6	1320996	1321001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_017046	AAT	2	6	1321006	1321011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017046	A	6	6	1322012	1322017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_017046	TAA	2	6	1322071	1322076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_017046	TTG	2	6	1322077	1322082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_017046	GCTG	2	8	1322087	1322094	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4070	NC_017046	TTC	2	6	1322131	1322136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_017046	ATG	2	6	1323375	1323380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_017046	GCC	2	6	1324325	1324330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4073	NC_017046	GGC	2	6	1324352	1324357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_017046	AAT	2	6	1325308	1325313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_017046	AAC	2	6	1325431	1325436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_017046	GGACAT	2	12	1325457	1325468	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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4078	NC_017046	A	8	8	1325570	1325577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_017046	AATC	2	8	1326714	1326721	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4080	NC_017046	GCC	2	6	1326788	1326793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4082	NC_017046	GCC	2	6	1326848	1326853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4083	NC_017046	ATT	2	6	1327388	1327393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017046	GCC	2	6	1327712	1327717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4085	NC_017046	CGG	2	6	1327721	1327726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_017046	ATT	2	6	1327846	1327851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_017046	GCCA	2	8	1327882	1327889	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4088	NC_017046	TGACG	2	10	1327961	1327970	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4089	NC_017046	GATAC	2	10	1328025	1328034	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4090	NC_017046	TCT	2	6	1328702	1328707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_017046	GTC	2	6	1328712	1328717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_017046	GGC	2	6	1329790	1329795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4094	NC_017046	TGA	2	6	1329828	1329833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_017046	AAC	2	6	1331714	1331719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_017046	CAG	2	6	1331785	1331790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_017046	CTGC	2	8	1331797	1331804	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4098	NC_017046	AATA	2	8	1331840	1331847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017046	GAC	2	6	1335554	1335559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_017046	TA	3	6	1336924	1336929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017046	A	7	7	1337012	1337018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017046	GCT	2	6	1337023	1337028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_017046	CGG	2	6	1337095	1337100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_017046	AAT	2	6	1338892	1338897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017046	GCTG	2	8	1339027	1339034	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4106	NC_017046	TGC	2	6	1339042	1339047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_017046	ATTA	2	8	1339076	1339083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017046	ATAA	2	8	1339088	1339095	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017046	GAT	2	6	1345185	1345190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017046	ATT	2	6	1345218	1345223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017046	TAA	2	6	1345242	1345247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_017046	TGC	2	6	1345252	1345257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_017046	TGT	2	6	1345292	1345297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_017046	T	7	7	1345330	1345336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017046	T	6	6	1345359	1345364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017046	GTT	2	6	1345384	1345389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_017046	ACA	2	6	1345428	1345433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_017046	AGGA	2	8	1345470	1345477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017046	CCG	2	6	1345990	1345995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4120	NC_017046	ACA	2	6	1346005	1346010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_017046	CGG	2	6	1346033	1346038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_017046	A	6	6	1346979	1346984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_017046	AG	3	6	1346995	1347000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017046	A	7	7	1347893	1347899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_017046	CGC	2	6	1347930	1347935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4126	NC_017046	ACA	2	6	1347940	1347945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_017046	ACA	2	6	1347974	1347979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_017046	T	7	7	1348482	1348488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_017046	TGCC	2	8	1348490	1348497	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4131	NC_017046	ATT	2	6	1348520	1348525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4390	NC_017046	GC	3	6	1418492	1418497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4391	NC_017046	A	6	6	1418517	1418522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4398	NC_017046	ATA	2	6	1420974	1420979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4401	NC_017046	AT	3	6	1423136	1423141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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