MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 15617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017046	GTT	3	9	347509	347517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017046	ATT	2	6	347526	347531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017046	GAG	2	6	347595	347600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017046	TCTGT	2	10	347646	347655	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1005	NC_017046	TCC	2	6	347657	347662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_017046	AAT	2	6	347672	347677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017046	AAT	2	6	347706	347711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017046	TAT	2	6	347838	347843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017046	GATG	2	8	347932	347939	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017046	T	6	6	347982	347987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017046	GAT	2	6	347993	347998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017046	CA	3	6	348015	348020	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_017046	ATG	2	6	349076	349081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017046	GTC	2	6	349120	349125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_017046	ATG	2	6	349150	349155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017046	ATA	2	6	349172	349177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017046	TCC	2	6	349316	349321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_017046	A	6	6	350170	350175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017046	A	6	6	350212	350217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017046	TCG	2	6	350250	350255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_017046	AGATGA	2	12	350353	350364	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017046	TTA	2	6	350861	350866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017046	CGC	2	6	350971	350976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_017046	GCG	2	6	350979	350984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_017046	TAC	2	6	351020	351025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_017046	GC	3	6	351044	351049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_017046	TGG	2	6	351084	351089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017046	TGCC	2	8	351114	351121	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_017046	CGC	2	6	351174	351179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_017046	CTC	2	6	351973	351978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_017046	AAT	2	6	352011	352016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017046	A	6	6	352017	352022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017046	CTTG	2	8	354531	354538	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_017046	AGG	2	6	354540	354545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017046	TGA	2	6	354558	354563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017046	T	6	6	354586	354591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017046	ACA	2	6	354615	354620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_017046	TTG	2	6	354630	354635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017046	GTTG	2	8	355367	355374	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017046	TCC	2	6	355420	355425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_017046	ATT	2	6	355449	355454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017046	AC	3	6	357053	357058	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_017046	CAC	2	6	357119	357124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_017046	GT	3	6	357146	357151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017046	CGC	2	6	357168	357173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_017046	TCG	2	6	357176	357181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_017046	GC	3	6	357226	357231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_017046	TTCTCA	2	12	358402	358413	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_017046	AGG	2	6	358424	358429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017046	TCA	2	6	358431	358436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_017046	T	6	6	358523	358528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017046	AT	3	6	358534	358539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017046	CAA	2	6	358631	358636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_017046	TA	3	6	358638	358643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017046	CTGA	2	8	358856	358863	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1056	NC_017046	GGA	2	6	358885	358890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017046	CGC	2	6	358900	358905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_017046	GCA	2	6	358909	358914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_017046	GGC	3	9	358946	358954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_017046	GCA	2	6	358972	358977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_017046	TCG	2	6	358989	358994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_017046	TTCG	2	8	359002	359009	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_017046	TTA	2	6	359036	359041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017046	CTG	2	6	359042	359047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_017046	CGT	2	6	359087	359092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_017046	CGA	2	6	359134	359139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_017046	GC	3	6	359141	359146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_017046	CG	3	6	359195	359200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1069	NC_017046	CCG	2	6	359209	359214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_017046	CG	3	6	359364	359369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_017046	GCTG	2	8	359379	359386	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1072	NC_017046	CGT	2	6	359395	359400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_017046	GAG	2	6	359405	359410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017046	GAA	2	6	359551	359556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017046	TGCC	2	8	359628	359635	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_017046	GGT	2	6	361923	361928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017046	GTA	2	6	362017	362022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017046	CAG	2	6	362615	362620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_017046	AGG	2	6	362688	362693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017046	T	8	8	364099	364106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_017046	CTG	2	6	364407	364412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_017046	A	6	6	365556	365561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017046	T	7	7	365612	365618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017046	A	7	7	365619	365625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017046	TTG	2	6	365635	365640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_017046	TAA	2	6	365644	365649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_017046	CCG	2	6	365662	365667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_017046	CAA	2	6	365688	365693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_017046	GTT	2	6	365715	365720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017046	AC	3	6	368255	368260	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_017046	AGC	2	6	368293	368298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_017046	TAT	2	6	368333	368338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_017046	ATCA	2	8	368352	368359	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1094	NC_017046	T	6	6	368392	368397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017046	GAT	2	6	368462	368467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_017046	CAT	2	6	368542	368547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_017046	GAC	2	6	368665	368670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_017046	ACG	2	6	369492	369497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_017046	GCC	2	6	369552	369557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_017046	CGGGG	2	10	369599	369608	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1101	NC_017046	T	6	6	369733	369738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017046	GTG	2	6	369772	369777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017046	GC	3	6	369885	369890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_017046	CGG	2	6	369909	369914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_017046	GAT	2	6	369981	369986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017046	A	6	6	370096	370101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017046	AAAG	2	8	370147	370154	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017046	CGG	2	6	370176	370181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_017046	TC	3	6	370206	370211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_017046	TGG	2	6	370273	370278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017046	GGC	2	6	370583	370588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_017046	TA	3	6	370654	370659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017046	AATA	2	8	370667	370674	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017046	TA	3	6	370673	370678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017046	TAC	2	6	370689	370694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_017046	GAT	2	6	370719	370724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017046	AAAAT	2	10	370769	370778	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017046	TGTT	2	8	370830	370837	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017046	GT	3	6	372130	372135	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017046	ATC	2	6	372157	372162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_017046	T	6	6	372164	372169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017046	GCGTT	2	10	377193	377202	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1123	NC_017046	CAC	2	6	377251	377256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_017046	ATT	2	6	377285	377290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017046	CA	3	6	377401	377406	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_017046	GATT	2	8	377425	377432	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017046	ACT	2	6	377438	377443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_017046	TAT	2	6	377476	377481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017046	A	6	6	377507	377512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017046	CCAT	2	8	377518	377525	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_017046	CA	3	6	377614	377619	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_017046	CTCATT	2	12	377667	377678	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_017046	AATGT	2	10	377688	377697	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017046	GCA	2	6	377730	377735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1136	NC_017046	TCT	2	6	377859	377864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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