MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 15617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017046	AAAG	2	8	174970	174977	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017046	CCT	2	6	174990	174995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_017046	ATT	2	6	175033	175038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017046	T	6	6	175087	175092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017046	CCT	2	6	175117	175122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_017046	CCT	2	6	175194	175199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_017046	TCAA	2	8	175209	175216	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
508	NC_017046	T	6	6	176084	176089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017046	AGA	2	6	176107	176112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017046	TGT	2	6	176113	176118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017046	TTA	2	6	176165	176170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017046	TAGA	2	8	176221	176228	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017046	CGGC	2	8	180828	180835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
514	NC_017046	T	7	7	180836	180842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017046	TTA	2	6	180867	180872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017046	TGT	2	6	180899	180904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017046	GAT	2	6	180957	180962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017046	CCG	2	6	180983	180988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_017046	TCT	2	6	182435	182440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_017046	A	6	6	182467	182472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017046	T	7	7	182489	182495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017046	ATG	2	6	182521	182526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017046	GCA	2	6	182563	182568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_017046	TGTC	2	8	182606	182613	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
525	NC_017046	TCA	2	6	182662	182667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_017046	ATA	2	6	182692	182697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017046	TC	3	6	185468	185473	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
528	NC_017046	TGCC	2	8	185503	185510	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
529	NC_017046	T	6	6	185680	185685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017046	T	6	6	185693	185698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017046	CTA	2	6	185763	185768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_017046	ACT	2	6	185769	185774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_017046	CAA	2	6	185806	185811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_017046	GAG	2	6	185838	185843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017046	TCG	2	6	185847	185852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_017046	AGA	2	6	185857	185862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017046	TGC	2	6	185887	185892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_017046	CTATA	2	10	189360	189369	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
539	NC_017046	TAA	2	6	189377	189382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017046	TAC	2	6	189413	189418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_017046	TCT	2	6	189477	189482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_017046	T	7	7	189517	189523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017046	CT	3	6	189963	189968	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
544	NC_017046	T	6	6	190059	190064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017046	T	6	6	190077	190082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017046	TTA	2	6	190088	190093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017046	GTG	2	6	194188	194193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017046	CCT	2	6	195000	195005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_017046	A	7	7	195901	195907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017046	CAT	2	6	195916	195921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_017046	ATT	2	6	195950	195955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017046	GGA	2	6	195972	195977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017046	CGA	2	6	196378	196383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_017046	TAT	2	6	196388	196393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017046	TATTG	2	10	196421	196430	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017046	GCC	2	6	198171	198176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_017046	T	6	6	200632	200637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017046	TG	3	6	200665	200670	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017046	TCA	2	6	200675	200680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_017046	GAAT	2	8	200709	200716	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017046	GCG	2	6	200753	200758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_017046	TTA	2	6	200759	200764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017046	ATT	2	6	202126	202131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017046	AT	3	6	202138	202143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017046	AAGT	2	8	202160	202167	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017046	GCTTC	2	10	203902	203911	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
567	NC_017046	AGCGC	2	10	207576	207585	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
568	NC_017046	ATAA	2	8	207587	207594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017046	TGA	2	6	208331	208336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017046	CCA	2	6	208369	208374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_017046	GAT	2	6	209022	209027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017046	GAA	2	6	209039	209044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017046	AT	4	8	209078	209085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017046	ATT	2	6	209093	209098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017046	GTTT	2	8	209108	209115	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017046	GCT	2	6	209162	209167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_017046	AAT	2	6	209180	209185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017046	T	7	7	209191	209197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017046	A	6	6	209202	209207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017046	GT	3	6	209222	209227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017046	A	7	7	209236	209242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017046	CAT	2	6	209251	209256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_017046	GGA	2	6	209275	209280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017046	GAC	2	6	209739	209744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_017046	T	6	6	209766	209771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017046	CTT	2	6	211408	211413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_017046	TGA	2	6	212376	212381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017046	GCGCT	2	10	212394	212403	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
589	NC_017046	CGCGT	2	10	212446	212455	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
590	NC_017046	G	6	6	213326	213331	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017046	TAA	2	6	215291	215296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017046	AG	3	6	215341	215346	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017046	CAT	2	6	215368	215373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_017046	CGC	2	6	215377	215382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_017046	AACG	2	8	216381	216388	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
596	NC_017046	ACGC	2	8	216982	216989	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
597	NC_017046	TAA	2	6	217002	217007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017046	GCG	2	6	218313	218318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_017046	AAAG	2	8	218320	218327	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017046	GA	3	6	220841	220846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017046	TCT	3	9	220849	220857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_017046	GTC	2	6	220858	220863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_017046	GAA	2	6	220869	220874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017046	TCC	2	6	223548	223553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_017046	ATAA	2	8	223554	223561	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017046	TTA	2	6	223576	223581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017046	CCTT	2	8	223584	223591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
608	NC_017046	CGA	2	6	223651	223656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_017046	TGC	2	6	223671	223676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_017046	TAA	3	9	223682	223690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017046	TCA	2	6	223716	223721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_017046	CAATAT	2	12	229775	229786	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
613	NC_017046	CTGTC	2	10	229842	229851	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
614	NC_017046	AAG	2	6	229888	229893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017046	GC	3	6	229937	229942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
616	NC_017046	TGA	2	6	229995	230000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017046	AAT	2	6	230023	230028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017046	TAA	3	9	230117	230125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017046	ATA	2	6	230146	230151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017046	ATT	2	6	230156	230161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017046	T	6	6	230160	230165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017046	TAA	2	6	230173	230178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017046	A	6	6	230177	230182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017046	AAAT	2	8	230194	230201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017046	A	8	8	230220	230227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017046	T	6	6	230240	230245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017046	T	7	7	230247	230253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017046	AAAT	2	8	230271	230278	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017046	TA	3	6	230294	230299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017046	T	7	7	230321	230327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017046	T	7	7	230350	230356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017046	CTTG	2	8	230368	230375	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
633	NC_017046	TTTG	2	8	230377	230384	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017046	T	6	6	230385	230390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017046	TAT	2	6	230407	230412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017046	TAAA	2	8	230431	230438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017046	A	6	6	230436	230441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_017046	TTAT	2	8	230493	230500	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_017046	GTT	2	6	230507	230512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_017046	CTT	2	6	230515	230520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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