MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS15252 chromosome

Total Repeats: 468

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017040	TC	3	6	1656	1661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017040	TA	3	6	1682	1687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017040	AT	3	6	16691	16696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017040	AG	3	6	17072	17077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017040	AT	3	6	17776	17781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017040	CT	3	6	17807	17812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017040	AC	3	6	18297	18302	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017040	AC	3	6	18466	18471	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017040	TG	3	6	18821	18826	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017040	TA	3	6	18896	18901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017040	AG	3	6	19388	19393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017040	CT	3	6	19502	19507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017040	TC	3	6	19880	19885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017040	TG	3	6	20270	20275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017040	GA	3	6	20421	20426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017040	TA	3	6	20475	20480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017040	GA	3	6	20717	20722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017040	CT	3	6	20832	20837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017040	GA	3	6	21039	21044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017040	GA	3	6	21854	21859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017040	AC	3	6	22147	22152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017040	AT	4	8	23593	23600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017040	AT	3	6	25050	25055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017040	AG	3	6	26480	26485	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017040	TA	3	6	36219	36224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017040	GA	3	6	47092	47097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017040	AT	3	6	52147	52152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017040	CA	3	6	65621	65626	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017040	GA	3	6	72898	72903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017040	AG	3	6	73684	73689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017040	AT	3	6	74388	74393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017040	CT	3	6	74419	74424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017040	AC	3	6	74908	74913	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017040	AC	3	6	75077	75082	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017040	TG	3	6	75432	75437	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017040	TA	3	6	75507	75512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017040	AG	3	6	75999	76004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017040	CT	3	6	76113	76118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017040	TC	3	6	76491	76496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017040	TG	3	6	76881	76886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017040	GA	3	6	77032	77037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017040	TA	3	6	77086	77091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017040	GA	3	6	77328	77333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017040	CT	3	6	77443	77448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017040	GA	3	6	77650	77655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017040	GA	3	6	78465	78470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017040	AC	3	6	78758	78763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017040	CT	3	6	79485	79490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017040	GA	3	6	80712	80717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017040	TG	3	6	80809	80814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017040	TG	3	6	80983	80988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017040	AT	3	6	99527	99532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017040	AG	3	6	100588	100593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017040	AT	3	6	106557	106562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017040	TA	3	6	110439	110444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017040	AG	3	6	110497	110502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017040	CT	3	6	110921	110926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017040	GA	5	10	117198	117207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017040	CA	3	6	119625	119630	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017040	CT	4	8	121094	121101	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017040	GA	4	8	121342	121349	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017040	AT	3	6	128546	128551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017040	TA	3	6	128585	128590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017040	AC	3	6	133672	133677	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017040	AT	3	6	145383	145388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017040	GT	3	6	148978	148983	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017040	GA	3	6	153110	153115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017040	TC	3	6	154266	154271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017040	TC	3	6	155062	155067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017040	AG	3	6	155496	155501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017040	GA	3	6	155540	155545	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017040	AC	3	6	155671	155676	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017040	TG	3	6	159602	159607	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017040	GT	4	8	161560	161567	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017040	AG	3	6	164719	164724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017040	TG	3	6	166552	166557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017040	GA	3	6	177987	177992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017040	CT	3	6	178100	178105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017040	AG	3	6	179066	179071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017040	AT	3	6	188462	188467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017040	GT	3	6	190164	190169	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017040	AG	3	6	193070	193075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017040	TC	3	6	194668	194673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017040	TA	3	6	194696	194701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017040	GA	3	6	194829	194834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017040	GA	3	6	195103	195108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017040	AG	3	6	198165	198170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017040	AT	3	6	206866	206871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017040	AG	3	6	208503	208508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017040	AG	3	6	212105	212110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017040	TC	5	10	212259	212268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017040	GA	4	8	214894	214901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017040	AC	3	6	216164	216169	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017040	GA	3	6	217586	217591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017040	TC	3	6	234225	234230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017040	CA	3	6	235560	235565	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017040	TA	3	6	238032	238037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017040	AG	3	6	239176	239181	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017040	GA	3	6	239367	239372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017040	AT	3	6	242010	242015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017040	TA	3	6	248000	248005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017040	GA	3	6	255279	255284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017040	GA	3	6	257507	257512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017040	AG	3	6	262952	262957	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017040	AT	3	6	263656	263661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017040	CT	3	6	263687	263692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017040	AC	3	6	264177	264182	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017040	AC	3	6	264346	264351	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017040	TG	3	6	264701	264706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017040	TA	3	6	264776	264781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017040	AG	3	6	265268	265273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017040	CT	3	6	265382	265387	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017040	TC	3	6	265760	265765	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017040	TG	3	6	266150	266155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017040	GA	3	6	266301	266306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017040	TA	3	6	266355	266360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017040	GA	3	6	266597	266602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017040	CT	3	6	266712	266717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017040	GA	3	6	266919	266924	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017040	GA	3	6	267734	267739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017040	AG	4	8	268101	268108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017040	GT	3	6	275383	275388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017040	GA	3	6	276564	276569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017040	TG	3	6	282078	282083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017040	TA	3	6	298767	298772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017040	AG	3	6	303192	303197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017040	GA	3	6	315213	315218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017040	AG	3	6	330557	330562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017040	TC	3	6	330668	330673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017040	TG	3	6	331473	331478	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017040	AT	3	6	334432	334437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017040	AG	3	6	348856	348861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017040	CT	3	6	353921	353926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017040	TC	4	8	355112	355119	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017040	GT	3	6	355472	355477	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017040	GT	3	6	356498	356503	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017040	AT	3	6	356790	356795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017040	GT	3	6	357463	357468	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017040	AG	3	6	357670	357675	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017040	AT	3	6	357760	357765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017040	AT	3	6	360346	360351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017040	GT	3	6	361935	361940	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017040	TC	3	6	363137	363142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017040	AT	3	6	363538	363543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017040	AT	3	6	363578	363583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017040	AT	3	6	364048	364053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017040	CA	3	6	366206	366211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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149	NC_017040	TA	3	6	370773	370778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017040	GA	3	6	375101	375106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017040	CT	3	6	394357	394362	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_017040	CT	3	6	394436	394441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_017040	AT	3	6	395001	395006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017040	GT	3	6	395992	395997	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017040	TG	3	6	396718	396723	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.