MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS15252 chromosome

Total Repeats: 758

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017040	ATTT	2	8	121	128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017040	ACTA	2	8	147	154	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017040	TAAA	2	8	3160	3167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017040	TTGA	2	8	3451	3458	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017040	GAAC	2	8	8785	8792	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017040	ACTA	2	8	15060	15067	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017040	TACT	2	8	16578	16585	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017040	AAAT	2	8	17021	17028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017040	ACCT	2	8	17195	17202	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017040	GTGA	2	8	17476	17483	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017040	TAAC	2	8	17559	17566	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017040	AGCG	2	8	17647	17654	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017040	TGGT	2	8	18312	18319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017040	AGCC	2	8	18529	18536	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017040	AGCG	2	8	18875	18882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017040	GTAA	2	8	19124	19131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017040	ACTA	2	8	19166	19173	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017040	GAAG	2	8	19206	19213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017040	GCGA	2	8	19280	19287	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017040	ATTC	2	8	20146	20153	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017040	CTAA	2	8	20502	20509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017040	TAGG	2	8	21157	21164	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017040	TTGG	2	8	21340	21347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017040	AATC	2	8	21349	21356	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017040	GCGT	2	8	23196	23203	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017040	TAAA	2	8	23747	23754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017040	GTTA	2	8	24097	24104	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017040	ATTC	2	8	24897	24904	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017040	AATT	2	8	25016	25023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017040	ATTA	2	8	27670	27677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017040	GGAA	2	8	30752	30759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017040	AGAA	2	8	34647	34654	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017040	TAGT	2	8	37287	37294	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017040	AAAG	2	8	38041	38048	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017040	AGAA	2	8	42466	42473	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017040	GATT	2	8	49318	49325	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017040	AAAG	2	8	52109	52116	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017040	ATTT	2	8	55162	55169	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017040	TATT	2	8	61131	61138	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017040	TAAA	2	8	64793	64800	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017040	TTAA	2	8	65033	65040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017040	TATT	2	8	69545	69552	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017040	AAAT	2	8	73633	73640	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017040	ACCT	2	8	73807	73814	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017040	GTGA	2	8	74088	74095	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017040	TAAC	2	8	74171	74178	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017040	AGCG	2	8	74259	74266	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017040	TGGT	2	8	74923	74930	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017040	AGCC	2	8	75140	75147	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017040	AGCG	2	8	75486	75493	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017040	GTAA	2	8	75735	75742	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017040	ACTA	2	8	75777	75784	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017040	GAAG	2	8	75817	75824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017040	GCGA	2	8	75891	75898	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017040	ATTC	2	8	76757	76764	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017040	CTAA	2	8	77113	77120	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017040	TAGG	2	8	77768	77775	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017040	TTGG	2	8	77951	77958	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017040	AATC	2	8	77960	77967	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017040	GCGT	2	8	79189	79196	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017040	TGAT	2	8	80530	80537	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017040	GTTC	2	8	80542	80549	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017040	AAAT	2	8	80569	80576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017040	CAAT	2	8	80704	80711	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017040	TTGC	2	8	81113	81120	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017040	AAAC	2	8	81477	81484	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017040	CAAT	2	8	91547	91554	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017040	GTTA	2	8	101867	101874	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017040	TAAG	2	8	104329	104336	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017040	AATA	2	8	109626	109633	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017040	CCAT	2	8	109828	109835	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017040	AGAA	2	8	110316	110323	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017040	GGTG	2	8	110355	110362	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017040	AGAC	2	8	110737	110744	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017040	TCTA	2	8	110982	110989	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017040	AATC	2	8	113243	113250	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017040	AAAT	2	8	114345	114352	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017040	CTTG	2	8	119680	119687	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017040	TGAT	2	8	119738	119745	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017040	AAAG	2	8	121179	121186	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017040	AAAT	2	8	121227	121234	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017040	ATCG	2	8	124907	124914	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017040	CCAG	2	8	125353	125360	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017040	CTTT	2	8	125788	125795	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017040	GTCA	2	8	131189	131196	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017040	TATC	2	8	131956	131963	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017040	TTAG	2	8	138929	138936	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017040	GCTT	2	8	142914	142921	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017040	GAAA	2	8	145185	145192	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017040	CCTG	2	8	145405	145412	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017040	TAGT	2	8	146899	146906	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017040	ACAA	2	8	148984	148991	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017040	AAAG	2	8	154119	154126	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017040	TAGC	2	8	154232	154239	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017040	AAAT	2	8	155072	155079	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017040	AAAT	2	8	155141	155148	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017040	AGCA	2	8	156658	156665	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017040	GGAT	2	8	164707	164714	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017040	AGTC	2	8	166526	166533	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017040	ATAG	2	8	174100	174107	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017040	CGTG	2	8	174581	174588	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017040	TAAA	2	8	175101	175108	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017040	ATCA	2	8	175225	175232	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017040	TTGT	2	8	175242	175249	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017040	TCTT	2	8	175268	175275	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017040	ATAA	2	8	175595	175602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017040	TTGA	2	8	178283	178290	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017040	CCAA	2	8	178334	178341	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017040	AGAC	2	8	178369	178376	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017040	TTAG	2	8	180504	180511	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017040	AACT	2	8	181600	181607	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017040	AATC	2	8	181832	181839	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017040	ATGG	2	8	183299	183306	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017040	AAGA	2	8	186733	186740	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017040	TTTA	2	8	190246	190253	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017040	AGTA	2	8	191058	191065	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017040	TAGA	2	8	191397	191404	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017040	GATT	2	8	194797	194804	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017040	AGGG	2	8	194925	194932	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017040	AGTG	2	8	196023	196030	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017040	TTTC	2	8	202355	202362	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017040	AGCA	2	8	202378	202385	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017040	GGGA	2	8	203804	203811	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017040	ACCG	2	8	205264	205271	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017040	ACAA	2	8	205979	205986	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017040	TAAA	2	8	212191	212198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017040	CAAT	2	8	212226	212233	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017040	TCAA	2	8	212241	212248	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017040	TTTG	2	8	212330	212337	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017040	TAGT	2	8	214738	214745	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017040	GTTT	2	8	214783	214790	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017040	AAAT	2	8	214918	214925	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017040	TAAA	2	8	219349	219356	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017040	ATAG	2	8	219403	219410	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017040	TTTG	2	8	219465	219472	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017040	CTAC	2	8	223019	223026	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017040	AAAG	2	8	224713	224720	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017040	CAAA	2	8	235260	235267	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017040	TCAA	2	8	235468	235475	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017040	ATTT	2	8	238005	238012	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017040	TAGG	2	8	238090	238097	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017040	AAAG	2	8	249320	249327	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017040	TAAA	2	8	253872	253879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017040	GTCA	2	8	253906	253913	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017040	AAAT	2	8	262901	262908	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017040	ACCT	2	8	263075	263082	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017040	GTGA	2	8	263356	263363	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017040	TAAC	2	8	263439	263446	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017040	AGCG	2	8	263527	263534	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017040	TGGT	2	8	264192	264199	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017040	AGCC	2	8	264409	264416	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_017040	AGCG	2	8	264755	264762	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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