MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Saprospira grandis str. Lewin chromosome

Total Repeats: 258

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016940	TTCGGC	2	12	5041	5052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016940	TAAATT	2	12	12734	12745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016940	TTCCCT	2	12	119909	119920	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016940	TCTATA	2	12	134875	134886	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_016940	AACCAA	2	12	135130	135141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016940	TCTATA	2	12	138658	138669	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_016940	TTATTT	2	12	158818	158829	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016940	GTTTTG	2	12	193920	193931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016940	TTTTCA	2	12	194189	194200	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_016940	GTTTTG	2	12	195654	195665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016940	GTTCTA	2	12	234461	234472	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_016940	TGCAAA	2	12	308016	308027	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_016940	TGCAAA	2	12	308098	308109	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_016940	TGCAAA	2	12	308139	308150	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_016940	TGCAAA	2	12	308180	308191	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_016940	TGCAAA	2	12	308221	308232	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_016940	TGCAAA	2	12	308262	308273	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_016940	TGCAAA	2	12	308303	308314	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_016940	CAAAAA	2	12	367196	367207	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_016940	AAATAA	2	12	375575	375586	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016940	CGAAGC	2	12	380240	380251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016940	GGAGGC	2	12	393298	393309	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_016940	GCTGCG	2	12	544306	544317	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016940	GCAAAA	2	12	600919	600930	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_016940	GGAGGC	2	12	603137	603148	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_016940	CTTTTT	2	12	652512	652523	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_016940	GATTAT	2	12	702146	702157	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016940	TTCGGC	2	12	724728	724739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016940	AGATGA	2	12	729470	729481	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016940	GCCTCC	2	12	756593	756604	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_016940	GGAGGC	2	12	759507	759518	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_016940	TTTGGG	2	12	787834	787845	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016940	ATAAAA	2	12	853559	853570	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016940	TGCAGA	2	12	858800	858811	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_016940	AAAAGC	2	12	864714	864725	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016940	ATAAAT	2	12	871266	871277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016940	TTGGCT	2	12	954843	954854	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016940	CTTAGG	2	12	963631	963642	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_016940	CAAGGC	2	12	987572	987583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016940	CCGTTA	2	12	989494	989505	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016940	AGCGCT	2	12	990080	990091	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016940	GTTGCC	2	12	991077	991088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016940	GTTGCT	2	12	991149	991160	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_016940	AAGTAT	2	12	992125	992136	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016940	CTTCTA	2	12	992386	992397	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016940	GCCACC	2	12	994103	994114	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_016940	ACCGCC	2	12	994115	994126	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_016940	GTTGGG	2	12	995537	995548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016940	GACTCA	2	12	996448	996459	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016940	AAAAGA	2	12	999851	999862	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016940	AGATTT	2	12	1000305	1000316	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016940	GCCTCC	2	12	1019593	1019604	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_016940	ATATCC	2	12	1037711	1037722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016940	TTGCAG	2	12	1052677	1052688	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_016940	AAATAC	2	12	1081102	1081113	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_016940	GCCTCC	2	12	1154071	1154082	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_016940	CCAAAC	2	12	1161078	1161089	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016940	TAAAGT	2	12	1192168	1192179	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016940	TGTTTT	2	12	1201764	1201775	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016940	AACCTT	2	12	1293424	1293435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016940	ATTTTT	2	12	1313742	1313753	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016940	TGATAG	2	12	1327989	1328000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016940	TTTGAT	2	12	1337062	1337073	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016940	TTAAAT	2	12	1349765	1349776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016940	TGCAAA	2	12	1369911	1369922	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_016940	TGCAAA	2	12	1369952	1369963	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_016940	TGCAAA	2	12	1369993	1370004	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_016940	TGCAAA	2	12	1370034	1370045	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_016940	TGCAAA	2	12	1370075	1370086	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_016940	TGCAAA	2	12	1370116	1370127	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_016940	GCCATC	2	12	1384594	1384605	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016940	ATCGAG	2	12	1385203	1385214	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_016940	GCCATC	2	12	1385368	1385379	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_016940	TAAGGA	2	12	1385559	1385570	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016940	GCCATC	2	12	1385932	1385943	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016940	CCATCG	2	12	1386161	1386172	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016940	GCCATC	2	12	1386196	1386207	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016940	GCCATC	2	12	1386283	1386294	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016940	GCCATC	2	12	1386442	1386453	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_016940	GTCGAG	2	12	1386574	1386585	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_016940	GCCATC	2	12	1386655	1386666	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_016940	ATCGGG	2	12	1386676	1386687	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_016940	CCATCG	2	12	1386962	1386973	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016940	CATCGG	2	12	1387836	1387847	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016940	CCATCG	2	12	1388234	1388245	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_016940	GCCATC	2	12	1388269	1388280	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016940	GCCATC	2	12	1389139	1389150	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
88	NC_016940	ACCATC	2	12	1389187	1389198	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_016940	ACCATC	2	12	1389316	1389327	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016940	GGAGGC	2	12	1393987	1393998	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_016940	GCCTCC	2	12	1408703	1408714	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_016940	ATTTAT	2	12	1415010	1415021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016940	AGCAAA	2	12	1438531	1438542	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_016940	AAGGTA	2	12	1448735	1448746	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016940	GCTAGC	2	12	1463624	1463635	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016940	GGCTTT	2	12	1465934	1465945	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_016940	TAGAGG	2	12	1487636	1487647	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016940	AATTAG	2	12	1539564	1539575	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016940	TAAGTA	2	12	1558409	1558420	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016940	TTCTTG	2	12	1569185	1569196	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_016940	TGGGAA	2	12	1594175	1594186	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016940	TCTGTC	2	12	1611605	1611616	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016940	CAAAAA	2	12	1638317	1638328	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_016940	TTTCTA	2	12	1663219	1663230	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_016940	GCCAAG	2	12	1673721	1673732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016940	TTCTTT	2	12	1708218	1708229	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_016940	AGGCGG	2	12	1714507	1714518	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_016940	GCCTCC	2	12	1716477	1716488	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_016940	AAAACA	2	12	1726098	1726109	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_016940	TTATTT	2	12	1727457	1727468	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016940	GAAGGG	2	12	1779449	1779460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016940	GCCGAA	2	12	1822083	1822094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016940	GGAGGC	2	12	1822225	1822236	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_016940	CGAAGC	2	12	1855189	1855200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016940	GCCTCC	2	12	1900344	1900355	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_016940	AAATAA	2	12	1901447	1901458	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016940	AATTGA	2	12	1901499	1901510	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016940	TGCAAA	2	12	1911049	1911060	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_016940	TGCAAA	2	12	1911090	1911101	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_016940	TTGCAA	2	12	1911130	1911141	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_016940	TACCGG	2	12	1935207	1935218	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016940	TGCCAT	2	12	1935621	1935632	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016940	GCTATT	2	12	1938111	1938122	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_016940	AGAAAA	2	12	1957179	1957190	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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244	NC_016940	GGAGGC	2	12	3931049	3931060	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
245	NC_016940	TAGTTA	2	12	3951229	3951240	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
246	NC_016940	TAGTTA	2	12	3951335	3951346	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
247	NC_016940	TGGCGG	2	12	3967374	3967385	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
248	NC_016940	GCCTCC	2	12	3969988	3969999	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
249	NC_016940	ATAGCC	2	12	3970928	3970939	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
250	NC_016940	AAACAA	2	12	4064540	4064551	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
251	NC_016940	TTCTAA	2	12	4066747	4066758	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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257	NC_016940	GCCTCC	2	12	4291584	4291595	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.