MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Saprospira grandis str. Lewin chromosome

Total Repeats: 15577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016940	A	6	6	46	51	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016940	T	7	7	56	62	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016940	T	7	7	70	76	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016940	GGC	2	6	1666	1671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016940	GCC	2	6	1688	1693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_016940	T	6	6	1694	1699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016940	GCC	2	6	1748	1753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_016940	GGC	2	6	1757	1762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016940	CGACC	2	10	1821	1830	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_016940	A	8	8	1849	1856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016940	TATT	2	8	1899	1906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016940	A	7	7	3232	3238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016940	AACA	2	8	3469	3476	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016940	ATT	3	9	3485	3493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016940	T	7	7	4890	4896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016940	GCGG	2	8	4913	4920	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016940	CTG	2	6	4993	4998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016940	TCG	2	6	5015	5020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016940	TTCGGC	2	12	5041	5052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016940	TCA	2	6	5074	5079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016940	ATC	2	6	5102	5107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016940	CCT	2	6	6407	6412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_016940	CAA	2	6	6484	6489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016940	TGC	2	6	6755	6760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016940	T	6	6	6785	6790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016940	TTC	2	6	6824	6829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016940	ATTAG	2	10	6896	6905	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016940	GAT	2	6	6927	6932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016940	TA	3	6	9108	9113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016940	A	7	7	9220	9226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016940	GCC	2	6	9234	9239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_016940	T	8	8	10608	10615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016940	GCC	2	6	10623	10628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_016940	GGC	2	6	10632	10637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016940	TCGCT	2	10	10734	10743	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_016940	GCG	2	6	10749	10754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016940	GCC	2	6	10760	10765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_016940	A	6	6	11154	11159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016940	AT	3	6	11711	11716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016940	CTAA	2	8	11724	11731	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_016940	T	6	6	12689	12694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016940	TAAATT	2	12	12734	12745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016940	TGC	2	6	12752	12757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016940	T	6	6	12761	12766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016940	GCTTT	2	10	12791	12800	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_016940	TTG	2	6	12839	12844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016940	CT	3	6	12859	12864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016940	A	7	7	12905	12911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016940	GAG	2	6	12912	12917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016940	CTC	3	9	12924	12932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_016940	T	6	6	13427	13432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016940	TTA	2	6	13486	13491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016940	ACAA	2	8	16179	16186	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016940	A	8	8	16217	16224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016940	AATCA	2	10	16243	16252	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_016940	TAA	2	6	16300	16305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016940	T	8	8	17760	17767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016940	GTC	2	6	17786	17791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016940	TTG	2	6	17811	17816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016940	GCG	2	6	17835	17840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016940	GTC	2	6	17859	17864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016940	TTG	2	6	17884	17889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016940	A	6	6	18049	18054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016940	A	6	6	18069	18074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016940	A	7	7	18104	18110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016940	ACT	2	6	18113	18118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016940	A	6	6	19736	19741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016940	AGCC	2	8	20831	20838	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_016940	GGCT	2	8	20846	20853	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016940	GGC	2	6	20901	20906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016940	GCC	2	6	20910	20915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_016940	CAA	2	6	20940	20945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016940	CGA	2	6	20964	20969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016940	ACA	2	6	21040	21045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016940	ACA	2	6	21113	21118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016940	CGA	2	6	21137	21142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016940	GCA	2	6	21158	21163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016940	TAA	2	6	21215	21220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016940	AGC	2	6	24164	24169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016940	GCT	2	6	24176	24181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016940	T	8	8	24183	24190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016940	ATT	2	6	24213	24218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016940	GCG	2	6	24246	24251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016940	GTC	2	6	24270	24275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016940	TTG	2	6	24295	24300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016940	TCT	2	6	24382	24387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016940	AGG	2	6	24393	24398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016940	T	9	9	24818	24826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016940	GTT	2	6	24836	24841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016940	TCAT	2	8	25212	25219	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016940	A	7	7	27407	27413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016940	TCT	2	6	27440	27445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016940	GTT	2	6	29150	29155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016940	TGT	2	6	29163	29168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016940	A	6	6	29178	29183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016940	TGA	2	6	29792	29797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016940	AGC	2	6	29823	29828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016940	A	7	7	30082	30088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016940	TGC	2	6	30111	30116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016940	T	6	6	31165	31170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016940	A	6	6	31175	31180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016940	TTATT	2	10	31264	31273	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016940	GGAT	2	8	31313	31320	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016940	GCC	2	6	31347	31352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_016940	GGC	2	6	31356	31361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016940	CCCG	2	8	31401	31408	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
107	NC_016940	GTC	2	6	33987	33992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016940	CTC	2	6	33999	34004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_016940	TA	3	6	34460	34465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016940	CAA	2	6	35162	35167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016940	GCT	2	6	35173	35178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016940	AGC	2	6	35188	35193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016940	G	6	6	36128	36133	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016940	GCGG	2	8	36223	36230	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_016940	ACA	3	9	36243	36251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_016940	A	6	6	39429	39434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016940	CTTT	2	8	39477	39484	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_016940	CAA	2	6	39488	39493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016940	ATT	2	6	39523	39528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016940	A	7	7	39564	39570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016940	A	6	6	40296	40301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016940	A	6	6	42283	42288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016940	AAG	2	6	42341	42346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016940	TTTA	2	8	42357	42364	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016940	TGCT	2	8	42620	42627	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_016940	A	6	6	42630	42635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016940	A	6	6	43040	43045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016940	TTA	2	6	43046	43051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016940	TA	3	6	43054	43059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016940	CAAT	2	8	43102	43109	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_016940	A	7	7	43113	43119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016940	A	6	6	43136	43141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016940	GAAG	2	8	43173	43180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016940	CCG	2	6	43193	43198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_016940	TAT	2	6	43710	43715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016940	A	6	6	43743	43748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016940	T	6	6	45262	45267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016940	TTA	2	6	45280	45285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016940	GCTC	2	8	47018	47025	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_016940	T	6	6	47033	47038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016940	T	7	7	47055	47061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016940	CCA	2	6	47075	47080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_016940	TATT	2	8	48573	48580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016940	T	6	6	48579	48584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016940	GCC	2	6	48592	48597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_016940	GGC	2	6	48601	48606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_016940	GCG	2	6	48642	48647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_016940	GCC	2	6	48666	48671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_016940	GGC	2	6	48677	48682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_016940	GCG	2	6	48705	48710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_016940	CGC	2	6	48715	48720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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153	NC_016940	TGA	2	6	51645	51650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_016940	GCT	2	6	56287	56292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_016940	A	8	8	56416	56423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_016940	TTTA	2	8	56465	56472	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_016940	CAG	2	6	56479	56484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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182	NC_016940	CAT	2	6	60584	60589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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184	NC_016940	CAT	2	6	60626	60631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_016940	CAT	2	6	60647	60652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_016940	CAT	2	6	60668	60673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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189	NC_016940	CAT	2	6	60731	60736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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276	NC_016940	A	6	6	87214	87219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_016940	TTTG	2	8	91966	91973	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
292	NC_016940	AGC	2	6	92003	92008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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296	NC_016940	A	6	6	93213	93218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_016940	A	7	7	93237	93243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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430	NC_016940	AACCAA	2	12	135130	135141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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432	NC_016940	CCCT	2	8	135177	135184	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
433	NC_016940	GGC	2	6	135219	135224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
434	NC_016940	T	6	6	135465	135470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_016940	CGACC	2	10	135484	135493	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
436	NC_016940	TGC	2	6	136144	136149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
437	NC_016940	GTT	2	6	136691	136696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
438	NC_016940	AAG	2	6	136707	136712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
439	NC_016940	T	6	6	136732	136737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_016940	ATA	2	6	136772	136777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_016940	T	6	6	136793	136798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_016940	CTA	2	6	137591	137596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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444	NC_016940	GCT	2	6	137614	137619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
445	NC_016940	CTG	2	6	137627	137632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
446	NC_016940	CAA	2	6	137659	137664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
447	NC_016940	CAG	2	6	138375	138380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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449	NC_016940	ACA	2	6	138645	138650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
450	NC_016940	TCTATA	2	12	138658	138669	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
451	NC_016940	GTT	2	6	138710	138715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
452	NC_016940	TTC	2	6	138717	138722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
453	NC_016940	T	7	7	138738	138744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_016940	A	6	6	138795	138800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_016940	GTT	3	9	138851	138859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
456	NC_016940	GAG	2	6	138863	138868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_016940	TAA	2	6	139036	139041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
460	NC_016940	CTGC	2	8	139048	139055	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
461	NC_016940	CTG	2	6	139057	139062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
462	NC_016940	GGC	2	6	139235	139240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
463	NC_016940	GCC	2	6	139244	139249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
464	NC_016940	A	6	6	139521	139526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_016940	GTT	2	6	139531	139536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
466	NC_016940	A	6	6	140573	140578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_016940	TTA	2	6	140658	140663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_016940	CTA	2	6	140675	140680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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470	NC_016940	A	6	6	140746	140751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_016940	GATTT	2	10	140812	140821	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
472	NC_016940	T	7	7	140883	140889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_016940	GCC	2	6	140897	140902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
474	NC_016940	CGG	2	6	140905	140910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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477	NC_016940	A	6	6	141364	141369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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480	NC_016940	CCT	2	6	141396	141401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
481	NC_016940	TAA	2	6	141432	141437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_016940	TAC	2	6	141449	141454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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491	NC_016940	TGC	2	6	141852	141857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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