MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus M013 chromosome

Total Repeats: 646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016928	GAAAA	2	10	3374	3383	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016928	TGAAC	2	10	7744	7753	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_016928	GTAGG	2	10	15166	15175	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016928	TCGAT	2	10	24576	24585	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_016928	ATATT	2	10	25114	25123	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016928	CAATT	2	10	35094	35103	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016928	GAAAT	2	10	43357	43366	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016928	ATGAG	2	10	46680	46689	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016928	GCCAT	2	10	51038	51047	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_016928	TATAG	2	10	56105	56114	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016928	ATTTA	2	10	68827	68836	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016928	ACGAT	2	10	68923	68932	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_016928	GTGCT	2	10	75032	75041	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_016928	TTGAT	2	10	75262	75271	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016928	GAATG	2	10	75369	75378	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016928	GTATT	2	10	80413	80422	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016928	GTAAT	2	10	107586	107595	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016928	TTTTC	2	10	110894	110903	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_016928	ATTTT	2	10	131201	131210	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016928	TACTT	2	10	137946	137955	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_016928	TTTAG	2	10	139772	139781	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016928	TTCAA	2	10	158296	158305	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_016928	CGTTT	2	10	178745	178754	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_016928	CCCCA	2	10	183931	183940	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
25	NC_016928	TAAAT	2	10	184018	184027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016928	TATCA	2	10	185787	185796	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_016928	ATCAT	2	10	193919	193928	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_016928	CAACT	2	10	206064	206073	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_016928	GCTTT	2	10	210576	210585	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_016928	TAACA	2	10	215655	215664	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_016928	AATAT	2	10	234940	234949	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016928	TATTT	2	10	240932	240941	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016928	AACAT	2	10	249376	249385	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_016928	GATAA	2	10	253309	253318	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016928	ATAAC	2	10	257956	257965	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_016928	TGAAT	2	10	258067	258076	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016928	ATTAA	2	10	258208	258217	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016928	AAAGT	2	10	261952	261961	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016928	ATTAA	2	10	263663	263672	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016928	AAATT	2	10	264982	264991	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016928	CATGC	2	10	278955	278964	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_016928	TAAAA	2	10	279127	279136	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016928	ATAAA	2	10	287036	287045	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016928	TCATA	2	10	295468	295477	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_016928	ATTTA	2	10	309400	309409	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016928	TAAAT	2	10	340758	340767	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016928	ATTTT	2	10	346316	346325	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016928	ATAGA	2	10	352555	352564	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016928	TGACA	2	10	352741	352750	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_016928	TAATA	2	10	356918	356927	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016928	GATAA	2	10	363754	363763	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016928	TTGCA	2	10	374121	374130	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_016928	GTTGA	2	10	378480	378489	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016928	TATCA	2	10	378498	378507	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_016928	ATTCT	2	10	398482	398491	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_016928	CGCAA	2	10	400818	400827	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_016928	TTGAA	2	10	401718	401727	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016928	AGAAT	2	10	402045	402054	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016928	TAAGG	2	10	402109	402118	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016928	TAAAT	2	10	410930	410939	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016928	ACAGT	2	10	413502	413511	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_016928	TTTAT	2	10	421116	421125	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016928	TTGAT	2	10	421218	421227	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016928	GCTTT	2	10	423586	423595	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_016928	TGTAA	2	10	424670	424679	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016928	CATAA	2	10	429277	429286	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_016928	GAAAA	2	10	430497	430506	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016928	TTTGA	2	10	431230	431239	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016928	AATAT	2	10	432392	432401	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016928	TATCC	2	10	440370	440379	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_016928	TTTAT	2	10	443177	443186	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016928	AAATT	2	10	446459	446468	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016928	TAAAG	2	10	457259	457268	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016928	CAAAG	2	10	459202	459211	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_016928	AGGCA	2	10	459951	459960	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_016928	CTTAA	2	10	476878	476887	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_016928	CAACT	2	10	495262	495271	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_016928	GGTAA	2	10	495735	495744	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016928	TCGTG	2	10	496554	496563	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_016928	GATTG	2	10	498905	498914	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016928	GATTT	2	10	503558	503567	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016928	ATATA	2	10	505976	505985	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016928	CAAAG	2	10	512523	512532	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_016928	TTGAT	2	10	515682	515691	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016928	GAAAA	2	10	515733	515742	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016928	ATGAA	2	10	516494	516503	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016928	AAGTA	2	10	532832	532841	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016928	TTAAA	2	10	534956	534965	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016928	GATAA	2	10	534995	535004	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016928	GGTAA	2	10	540521	540530	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016928	TCGTG	2	10	541340	541349	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_016928	GATTG	2	10	543682	543691	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016928	ATATA	2	10	550572	550581	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016928	AAAAT	2	10	555348	555357	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016928	TTTAT	2	10	555457	555466	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016928	AAAAT	2	10	558089	558098	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016928	TTATG	2	10	558463	558472	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016928	ATTTA	2	10	558608	558617	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016928	ACAAT	2	10	560413	560422	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_016928	GTATA	2	10	564937	564946	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016928	TATAA	2	10	568654	568663	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016928	ATTTT	2	10	569165	569174	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016928	GTTTA	2	10	584816	584825	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016928	TAAAG	2	10	589009	589018	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016928	ATATT	2	10	595146	595155	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016928	AATTT	2	10	598106	598115	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016928	ATAAA	2	10	606274	606283	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016928	TTTAG	2	10	611369	611378	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016928	ATATT	2	10	616881	616890	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016928	TTATA	2	10	623086	623095	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016928	GAAAA	2	10	629498	629507	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016928	ATGAT	2	10	633271	633280	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016928	TAATT	2	10	636758	636767	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016928	ATTAT	2	10	644009	644018	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016928	TAAAT	2	10	647296	647305	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016928	AAATT	2	10	649298	649307	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016928	TAAAA	2	10	656317	656326	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016928	ATTAA	2	10	658505	658514	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016928	TTATT	2	10	658554	658563	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016928	CAATA	2	10	658620	658629	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_016928	TTAAT	2	10	661246	661255	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016928	AACAA	2	10	662951	662960	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_016928	AAATA	2	10	663511	663520	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016928	ATTTT	2	10	663533	663542	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016928	ATAAA	2	10	670224	670233	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016928	TTTTA	2	10	672490	672499	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016928	AAAGG	2	10	672811	672820	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016928	ATATA	2	10	675981	675990	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016928	AAACT	2	10	679505	679514	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_016928	TTCAC	2	10	684718	684727	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_016928	TTTGT	2	10	688626	688635	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016928	AATGA	2	10	688699	688708	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016928	GGTTG	2	10	695701	695710	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016928	TAAAC	2	10	703627	703636	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_016928	AGTAG	2	10	705410	705419	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016928	AAGTT	2	10	705859	705868	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016928	AATTG	2	10	705891	705900	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016928	AAACT	2	10	707766	707775	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_016928	ATTTA	2	10	708155	708164	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016928	TTGAT	2	10	709326	709335	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016928	AAAGT	2	10	710404	710413	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016928	AATTT	2	10	713013	713022	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016928	AGAAT	2	10	714956	714965	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016928	CATGA	2	10	715173	715182	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_016928	ATCAT	2	10	719697	719706	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_016928	AATTA	2	10	731378	731387	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016928	TAAAA	2	10	734438	734447	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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