MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus M013 chromosome

Total Repeats: 12464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016928	AATC	2	8	279138	279145	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_016928	AC	4	8	279175	279182	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_016928	T	6	6	279201	279206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_016928	CATA	2	8	279324	279331	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1005	NC_016928	A	6	6	280552	280557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_016928	ATTA	2	8	280564	280571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_016928	ATAA	2	8	280582	280589	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_016928	TTA	2	6	280613	280618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_016928	AAT	2	6	280771	280776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_016928	ATATAG	2	12	280780	280791	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_016928	GGA	2	6	280798	280803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_016928	TA	3	6	284260	284265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_016928	ATTTTC	2	12	286097	286108	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1014	NC_016928	GAG	2	6	286138	286143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_016928	GTC	2	6	286144	286149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_016928	CAG	2	6	286863	286868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_016928	ATT	2	6	286910	286915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_016928	TAG	2	6	286983	286988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_016928	T	7	7	286993	286999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_016928	AAT	2	6	287000	287005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_016928	TACA	2	8	287020	287027	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1022	NC_016928	TAT	2	6	287029	287034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_016928	ATAAA	2	10	287036	287045	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_016928	ATAATT	2	12	287047	287058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_016928	T	8	8	289581	289588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_016928	AGG	2	6	289676	289681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_016928	ATA	2	6	290841	290846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_016928	TTA	2	6	290863	290868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_016928	A	7	7	290873	290879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_016928	ATT	2	6	291663	291668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_016928	GTAA	2	8	291733	291740	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_016928	CTA	2	6	291754	291759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_016928	GT	3	6	292576	292581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_016928	TAT	2	6	294031	294036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_016928	GA	3	6	294213	294218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_016928	ATAA	2	8	294220	294227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_016928	A	6	6	294303	294308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_016928	ACTA	2	8	294316	294323	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1039	NC_016928	TGA	2	6	294371	294376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_016928	CTA	2	6	294378	294383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_016928	AACGAT	2	12	294387	294398	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1042	NC_016928	GAT	2	6	294410	294415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_016928	CCT	2	6	295251	295256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_016928	ATT	2	6	295268	295273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_016928	TA	3	6	295293	295298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_016928	A	6	6	295326	295331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_016928	TCA	2	6	295361	295366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_016928	ATT	2	6	295386	295391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_016928	GAT	2	6	295399	295404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_016928	A	6	6	295418	295423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_016928	TCATA	2	10	295468	295477	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1052	NC_016928	ATGC	2	8	297807	297814	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_016928	ATT	3	9	297863	297871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_016928	AAT	2	6	297887	297892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_016928	ATG	2	6	297939	297944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_016928	TAAT	2	8	298991	298998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_016928	TA	3	6	299007	299012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_016928	ATT	2	6	299017	299022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_016928	TCA	2	6	299027	299032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_016928	TGA	2	6	299049	299054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_016928	GA	3	6	299124	299129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_016928	AT	3	6	299130	299135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_016928	TGA	2	6	299194	299199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_016928	ATT	2	6	299214	299219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_016928	A	6	6	299245	299250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_016928	A	6	6	299256	299261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_016928	ATG	2	6	299271	299276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_016928	A	6	6	299297	299302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_016928	TTAA	2	8	299306	299313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_016928	AG	3	6	299330	299335	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_016928	AAT	3	9	299749	299757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_016928	GAA	2	6	299768	299773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_016928	A	6	6	299778	299783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_016928	TTC	2	6	299786	299791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_016928	TTC	2	6	299854	299859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_016928	TAT	2	6	299860	299865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1079	NC_016928	GAAT	2	8	301367	301374	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_016928	AATT	2	8	301378	301385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_016928	TGAT	2	8	301393	301400	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_016928	T	6	6	301400	301405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_016928	GATG	2	8	302503	302510	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_016928	GTT	2	6	302559	302564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_016928	GA	3	6	302602	302607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_016928	TAACTT	3	18	302764	302781	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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1088	NC_016928	T	7	7	303794	303800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_016928	CTC	2	6	306569	306574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_016928	TCC	2	6	308159	308164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_016928	ATT	2	6	308167	308172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_016928	TTA	2	6	308203	308208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_016928	TAA	2	6	308254	308259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_016928	TAA	2	6	308264	308269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_016928	TAA	2	6	308283	308288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_016928	A	6	6	308294	308299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_016928	CAT	2	6	308377	308382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_016928	ATTTA	2	10	309400	309409	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_016928	TTAA	2	8	309447	309454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_016928	AT	3	6	309457	309462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_016928	AT	3	6	309474	309479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_016928	A	7	7	309486	309492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_016928	A	6	6	309506	309511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_016928	TA	3	6	309513	309518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_016928	TAA	2	6	309526	309531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_016928	TA	3	6	309534	309539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_016928	A	6	6	309565	309570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_016928	AGG	2	6	309609	309614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_016928	T	6	6	309968	309973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_016928	AAC	2	6	309979	309984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_016928	AG	3	6	320210	320215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_016928	AAT	2	6	324084	324089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_016928	TTG	2	6	324106	324111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_016928	ATTA	2	8	324118	324125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_016928	TA	3	6	324170	324175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_016928	T	6	6	324187	324192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_016928	TAAA	2	8	324211	324218	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_016928	AAT	2	6	324230	324235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_016928	TTTG	2	8	324504	324511	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_016928	TTTA	2	8	324525	324532	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_016928	AT	3	6	326772	326777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_016928	ATA	2	6	326828	326833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_016928	AATG	2	8	326887	326894	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_016928	A	6	6	326925	326930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_016928	TAA	2	6	326973	326978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_016928	GATA	2	8	326991	326998	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_016928	ATTT	2	8	327040	327047	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_016928	TAAA	2	8	327101	327108	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_016928	TA	3	6	327132	327137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_016928	GAT	2	6	327145	327150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_016928	ATGG	2	8	327176	327183	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_016928	AT	3	6	327184	327189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_016928	AAT	2	6	327217	327222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_016928	AT	3	6	327246	327251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_016928	TTA	3	9	327254	327262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_016928	AACC	2	8	328312	328319	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1137	NC_016928	AGA	2	6	328340	328345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1139	NC_016928	CAT	2	6	328404	328409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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