MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus M013 chromosome

Total Repeats: 12464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_016928	A	6	6	2563010	2563015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_016928	AGT	2	6	2563032	2563037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_016928	TAT	2	6	2563076	2563081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_016928	AAC	2	6	2563082	2563087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11505	NC_016928	A	7	7	2563096	2563102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_016928	TAA	2	6	2563115	2563120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_016928	TAA	2	6	2563123	2563128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_016928	ATGT	2	8	2563198	2563205	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_016928	ACA	2	6	2564359	2564364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11510	NC_016928	TCAAAA	2	12	2564367	2564378	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11511	NC_016928	A	6	6	2564375	2564380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_016928	CTT	2	6	2564420	2564425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11513	NC_016928	TA	3	6	2566022	2566027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_016928	ATC	2	6	2566532	2566537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11515	NC_016928	ATTTCG	2	12	2566554	2566565	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11516	NC_016928	TA	3	6	2566574	2566579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_016928	TGAA	2	8	2566582	2566589	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_016928	TAA	2	6	2566635	2566640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_016928	GTC	2	6	2566665	2566670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11520	NC_016928	AATAG	2	10	2566709	2566718	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_016928	AATC	2	8	2566730	2566737	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11522	NC_016928	T	8	8	2567074	2567081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_016928	GAAAA	2	10	2567084	2567093	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_016928	A	6	6	2567139	2567144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_016928	AATA	2	8	2567163	2567170	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_016928	CCAA	2	8	2567179	2567186	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11527	NC_016928	AAT	2	6	2567187	2567192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_016928	GAG	2	6	2567199	2567204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_016928	TAG	2	6	2567720	2567725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_016928	AAGG	2	8	2567769	2567776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_016928	ACC	2	6	2567795	2567800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11532	NC_016928	GGT	2	6	2567811	2567816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_016928	ATTT	2	8	2567821	2567828	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11534	NC_016928	CAT	2	6	2567855	2567860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11535	NC_016928	TTA	2	6	2568778	2568783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_016928	T	6	6	2568790	2568795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_016928	T	6	6	2568834	2568839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_016928	TA	3	6	2568859	2568864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_016928	TATT	2	8	2569580	2569587	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_016928	AC	3	6	2569684	2569689	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11541	NC_016928	AT	3	6	2569719	2569724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_016928	GC	3	6	2570839	2570844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11543	NC_016928	TTTAT	2	10	2570905	2570914	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_016928	ATT	2	6	2570957	2570962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_016928	AT	3	6	2570979	2570984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_016928	TGA	2	6	2570992	2570997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_016928	GCT	2	6	2571043	2571048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11548	NC_016928	TGA	2	6	2571053	2571058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_016928	TAC	2	6	2571061	2571066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11550	NC_016928	TCC	2	6	2571873	2571878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11551	NC_016928	GTC	2	6	2571893	2571898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_016928	AT	3	6	2571979	2571984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_016928	TAA	2	6	2572155	2572160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_016928	A	6	6	2572853	2572858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_016928	ATT	2	6	2572873	2572878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_016928	CTT	2	6	2573589	2573594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11557	NC_016928	TAT	2	6	2573597	2573602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_016928	CCA	2	6	2573618	2573623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11559	NC_016928	CGT	2	6	2573630	2573635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11560	NC_016928	CAAA	2	8	2573652	2573659	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11561	NC_016928	A	6	6	2573657	2573662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_016928	AT	3	6	2573694	2573699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_016928	TAA	2	6	2574509	2574514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_016928	ATA	2	6	2575041	2575046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_016928	TAACA	2	10	2575074	2575083	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11566	NC_016928	TTTTC	2	10	2575139	2575148	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11567	NC_016928	TAG	2	6	2575204	2575209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_016928	ATA	2	6	2575250	2575255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_016928	ATG	2	6	2575306	2575311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_016928	GAT	2	6	2575323	2575328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_016928	ATC	2	6	2575344	2575349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11572	NC_016928	GCAT	2	8	2575408	2575415	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11573	NC_016928	AAG	2	6	2575451	2575456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_016928	ATCT	2	8	2575458	2575465	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11575	NC_016928	CAGA	2	8	2575479	2575486	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11576	NC_016928	CTT	2	6	2575489	2575494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11577	NC_016928	T	6	6	2575493	2575498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_016928	TTA	3	9	2575508	2575516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_016928	CT	4	8	2578173	2578180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11580	NC_016928	TTTAT	2	10	2578184	2578193	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_016928	ATCAA	2	10	2578250	2578259	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11582	NC_016928	ACT	2	6	2578318	2578323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11583	NC_016928	TGT	2	6	2578326	2578331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_016928	TG	3	6	2578377	2578382	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_016928	T	6	6	2578387	2578392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_016928	T	6	6	2578399	2578404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_016928	AGTA	2	8	2578414	2578421	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_016928	TATT	2	8	2578467	2578474	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_016928	TTA	2	6	2578525	2578530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_016928	AT	3	6	2578534	2578539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_016928	ATT	2	6	2578566	2578571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_016928	ATG	2	6	2578590	2578595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_016928	T	7	7	2578620	2578626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_016928	CATT	2	8	2578933	2578940	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11595	NC_016928	TATC	2	8	2578958	2578965	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11596	NC_016928	GAT	2	6	2578986	2578991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_016928	T	7	7	2578991	2578997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_016928	TGT	2	6	2579070	2579075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_016928	AAC	2	6	2580070	2580075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11600	NC_016928	T	6	6	2580103	2580108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_016928	GTC	2	6	2581083	2581088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11602	NC_016928	CTC	2	6	2581090	2581095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11603	NC_016928	TGA	2	6	2581098	2581103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_016928	CTA	2	6	2581107	2581112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11605	NC_016928	TTA	2	6	2581138	2581143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_016928	ATG	2	6	2581171	2581176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_016928	CTT	2	6	2581567	2581572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11608	NC_016928	ATTT	2	8	2582055	2582062	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_016928	TTA	2	6	2582063	2582068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_016928	TTA	2	6	2582100	2582105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_016928	ACATAA	2	12	2582175	2582186	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11612	NC_016928	TCA	2	6	2582227	2582232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11613	NC_016928	TTCA	2	8	2582335	2582342	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11614	NC_016928	A	6	6	2584474	2584479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_016928	AACA	2	8	2584489	2584496	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11616	NC_016928	GTT	2	6	2584516	2584521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_016928	TAT	2	6	2584572	2584577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_016928	CAA	2	6	2584599	2584604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11619	NC_016928	ATC	2	6	2584620	2584625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11620	NC_016928	ATAA	2	8	2584647	2584654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11621	NC_016928	TTG	2	6	2584675	2584680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11622	NC_016928	TTCAA	2	10	2584705	2584714	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11623	NC_016928	ATG	2	6	2587540	2587545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11624	NC_016928	GTA	3	9	2587556	2587564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11625	NC_016928	ATT	2	6	2587570	2587575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11626	NC_016928	TAT	2	6	2587635	2587640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11627	NC_016928	T	7	7	2587671	2587677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11628	NC_016928	CT	3	6	2587709	2587714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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11630	NC_016928	ATT	2	6	2587747	2587752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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