MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 219

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016912	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016912	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016912	TAAATC	2	12	17162	17173	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016912	ATTTAT	2	12	37085	37096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016912	AACAAA	2	12	55421	55432	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016912	AATATA	2	12	63883	63894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016912	AATGAA	2	12	63895	63906	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016912	TAACAA	2	12	76416	76427	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016912	ATTAAG	2	12	99245	99256	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016912	AATGTA	2	12	100412	100423	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016912	CTGTAA	2	12	102233	102244	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_016912	GTTTTT	2	12	113460	113471	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016912	TTTATA	2	12	162252	162263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016912	ATTAAT	2	12	162275	162286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016912	GAGTTT	2	12	176459	176470	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016912	CTTCAA	2	12	214166	214177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016912	GGAATA	2	12	223989	224000	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016912	ATATAG	2	12	245217	245228	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016912	ATTTTC	2	12	250533	250544	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_016912	ATAATT	2	12	251484	251495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016912	AACGAT	2	12	258800	258811	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_016912	TAACTT	2	12	267720	267731	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_016912	TCTTCA	2	12	272593	272604	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016912	TTATCT	2	12	272689	272700	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_016912	ATATGA	2	12	318885	318896	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016912	TTGTAA	2	12	328641	328652	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016912	AATGTA	2	12	366505	366516	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016912	AATTTG	2	12	366612	366623	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016912	TAAAGA	2	12	368585	368596	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016912	TTGAAA	2	12	389978	389989	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016912	TGTATA	2	12	405387	405398	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016912	TTTTTA	2	12	413453	413464	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016912	AAAATG	2	12	418886	418897	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016912	ACGTTG	2	12	439333	439344	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_016912	AAAATA	2	12	440057	440068	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016912	TATGGT	2	12	448195	448206	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016912	TTATAA	2	12	459369	459380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016912	AAATTT	2	12	466128	466139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016912	TTATAA	2	12	521288	521299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016912	GTTATA	2	12	521959	521970	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016912	CTTAAA	2	12	530391	530402	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_016912	ACATGT	2	12	540361	540372	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016912	ATTGCG	2	12	565867	565878	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_016912	AATGAT	2	12	569785	569796	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016912	TAGATG	2	12	569858	569869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016912	TAAAAT	2	12	585179	585190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016912	TTTTAA	2	12	597285	597296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016912	CATTAT	2	12	613596	613607	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_016912	CATCAA	2	12	624526	624537	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016912	TAATTT	2	12	628775	628786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016912	TGAATA	2	12	645253	645264	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016912	GGATTC	2	12	656604	656615	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_016912	AAATAT	2	12	659396	659407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016912	ATATCC	2	12	670238	670249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016912	TTAAAA	2	12	671329	671340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016912	TAGTTA	2	12	675765	675776	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016912	TTTTTA	2	12	694040	694051	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016912	TGAAAA	2	12	702282	702293	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016912	AATGAT	2	12	730996	731007	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016912	ACAAAA	2	12	770870	770881	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_016912	TAAAAA	2	12	790012	790023	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016912	TATCAA	2	12	796493	796504	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_016912	TATAAT	2	12	798770	798781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016912	TTTTGA	2	12	800265	800276	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016912	TCATTT	2	12	806258	806269	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_016912	TAAAAA	2	12	809345	809356	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016912	AAATTA	2	12	816370	816381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016912	AAGCAC	2	12	825101	825112	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016912	TAAAAT	2	12	832777	832788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016912	TTTAAT	2	12	905499	905510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016912	ACAATA	2	12	922896	922907	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_016912	AACGGA	2	12	937418	937429	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_016912	CATTTA	2	12	967348	967359	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_016912	ATCATA	2	12	969243	969254	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_016912	TCAAAA	2	12	975751	975762	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_016912	ATTGCA	2	12	976831	976842	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_016912	TTTTCT	2	12	989559	989570	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_016912	TTTATA	2	12	1025572	1025583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016912	GAATTA	2	12	1032145	1032156	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016912	ATTTTT	2	12	1049522	1049533	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016912	ATAATT	2	12	1050319	1050330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016912	TAATGA	2	12	1063359	1063370	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016912	ATTTAT	2	12	1082484	1082495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016912	ATTATA	2	12	1086402	1086413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016912	AAATTT	2	12	1087211	1087222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016912	AAGTAA	2	12	1108925	1108936	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016912	TCGTTT	2	12	1112052	1112063	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_016912	TTAATT	2	12	1122768	1122779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016912	AATTAA	2	12	1125504	1125515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016912	GAAATT	2	12	1170411	1170422	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016912	AATGAT	2	12	1183186	1183197	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016912	TAAAGA	2	12	1197688	1197699	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016912	TTTCAT	2	12	1213494	1213505	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_016912	TATATT	2	12	1218153	1218164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016912	CATATT	2	12	1248088	1248099	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_016912	ATGTAT	2	12	1248709	1248720	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016912	AAAGAA	2	12	1248941	1248952	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016912	TTAAAG	2	12	1254199	1254210	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016912	ATTAAA	2	12	1282805	1282816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016912	ATATAA	2	12	1290787	1290798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016912	AAAATA	2	12	1304855	1304866	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016912	GTTTTA	2	12	1320602	1320613	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016912	TAAAAT	2	12	1336177	1336188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016912	TATCTT	2	12	1359012	1359023	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_016912	TTGATT	2	12	1359075	1359086	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016912	AATAAA	2	12	1369267	1369278	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016912	TATTCT	2	12	1414040	1414051	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_016912	TACTTG	2	12	1424287	1424298	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_016912	AAAAAT	2	12	1424303	1424314	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016912	TTAATC	2	12	1437810	1437821	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_016912	TATGAT	2	12	1477737	1477748	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016912	AATAAA	2	12	1482852	1482863	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016912	ATAAAA	2	12	1486640	1486651	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016912	ACAAGA	2	12	1492217	1492228	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_016912	TAAAAA	2	12	1505119	1505130	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016912	TTATAG	2	12	1514252	1514263	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016912	AATTTA	2	12	1522287	1522298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016912	AGCCAA	2	12	1550173	1550184	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016912	TTGACT	2	12	1550192	1550203	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_016912	TTTAAC	2	12	1555077	1555088	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_016912	TTATAA	2	12	1557559	1557570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016912	ACCTTT	2	12	1567516	1567527	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016912	TTTTAT	2	12	1569984	1569995	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016912	AGTTTT	2	12	1595640	1595651	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016912	AATTAA	2	12	1596885	1596896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016912	TAAAAC	2	12	1600025	1600036	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_016912	TTAAAT	2	12	1607344	1607355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016912	AATTTA	2	12	1609834	1609845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016912	ATTTTC	2	12	1615869	1615880	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_016912	TTTTAG	2	12	1622007	1622018	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.