MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 623

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016912	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_016912	AGGAA	2	10	14342	14351	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016912	GTAGG	2	10	14402	14411	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016912	TCGAT	2	10	23816	23825	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_016912	ATATT	2	10	24354	24363	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016912	TTTTA	2	10	36460	36469	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016912	GTGTT	2	10	42090	42099	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016912	AGAAA	2	10	49125	49134	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016912	TAAAG	2	10	49166	49175	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016912	ATTCA	2	10	49438	49447	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_016912	GTAAT	2	10	70705	70714	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016912	ATTTT	2	10	93484	93493	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016912	CAAAA	2	10	138836	138845	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_016912	AAAGC	2	10	139186	139195	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_016912	CGTTT	2	10	140405	140414	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_016912	TATCA	2	10	148981	148990	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_016912	ATCAT	2	10	157113	157122	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_016912	GCTTT	2	10	173756	173765	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_016912	TGAAG	2	10	173958	173967	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016912	AAAAT	2	10	174029	174038	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016912	TGATT	2	10	174102	174111	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016912	ATTAT	2	10	176640	176649	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016912	TAACA	2	10	180328	180337	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_016912	TAATG	2	10	188626	188635	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016912	AATAT	2	10	199509	199518	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016912	TATTT	2	10	205500	205509	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016912	AACAT	2	10	213791	213800	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_016912	GATAA	2	10	217745	217754	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016912	ATAAC	2	10	222392	222401	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_016912	TGAAT	2	10	222503	222512	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016912	ATTAA	2	10	222644	222653	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016912	AAAGT	2	10	226388	226397	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016912	TAAAA	2	10	228101	228110	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016912	AAATT	2	10	229417	229426	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016912	TAAAA	2	10	243564	243573	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016912	GAAAA	2	10	251355	251364	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016912	ATAAA	2	10	251473	251482	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016912	TCATA	2	10	259881	259890	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_016912	ACTTC	2	10	272918	272927	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_016912	ATTTA	2	10	275706	275715	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016912	TAAAT	2	10	307020	307029	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016912	AAATT	2	10	310713	310722	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016912	ATTTT	2	10	312578	312587	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016912	ATAGA	2	10	318815	318824	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016912	TGACA	2	10	319007	319016	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_016912	GATAA	2	10	331310	331319	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016912	GTAAT	2	10	366062	366071	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016912	AGAAT	2	10	367288	367297	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016912	TAAGG	2	10	367352	367361	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016912	TAAAT	2	10	374797	374806	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016912	ACAGT	2	10	377370	377379	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_016912	CATAA	2	10	387846	387855	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_016912	TAAAA	2	10	388070	388079	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016912	AATAT	2	10	390215	390224	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016912	AAAGT	2	10	402184	402193	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016912	AAATT	2	10	405374	405383	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016912	TAAAG	2	10	410584	410593	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016912	CTCAC	2	10	412489	412498	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
59	NC_016912	CAAAG	2	10	412514	412523	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_016912	TTGTA	2	10	420516	420525	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016912	ATTAT	2	10	420683	420692	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016912	CTTAA	2	10	430224	430233	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_016912	TGGTG	2	10	448041	448050	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016912	CAACT	2	10	448606	448615	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_016912	GGTAA	2	10	449078	449087	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016912	TCGTG	2	10	449897	449906	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_016912	GATTG	2	10	452231	452240	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016912	GATTT	2	10	457141	457150	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016912	ATATA	2	10	459559	459568	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016912	CAAAG	2	10	466107	466116	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_016912	TTGAT	2	10	469268	469277	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016912	AGACA	2	10	483229	483238	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_016912	AAGTA	2	10	485664	485673	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016912	TTAAA	2	10	487788	487797	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016912	GATAA	2	10	487827	487836	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016912	GGTAA	2	10	493356	493365	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016912	TCGTG	2	10	494175	494184	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_016912	GATTG	2	10	496509	496518	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016912	ATATA	2	10	503125	503134	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016912	AAAAT	2	10	507900	507909	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016912	TTTAT	2	10	508009	508018	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016912	TTATG	2	10	511015	511024	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016912	ATTTA	2	10	511160	511169	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016912	ACAAT	2	10	512965	512974	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_016912	TGAAT	2	10	517432	517441	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016912	GTATA	2	10	517489	517498	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016912	TATAA	2	10	521206	521215	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016912	GTTTA	2	10	537372	537381	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016912	TAAAG	2	10	541566	541575	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016912	ATATT	2	10	547702	547711	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016912	TTAAC	2	10	550740	550749	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_016912	AATTT	2	10	550825	550834	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016912	ATAAA	2	10	555220	555229	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016912	TTATA	2	10	569596	569605	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016912	CACAT	2	10	569992	570001	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_016912	ATGAT	2	10	579016	579025	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016912	TAATT	2	10	582503	582512	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016912	TAAGT	2	10	587488	587497	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016912	TATTG	2	10	588948	588957	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016912	ATTAT	2	10	589769	589778	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016912	AGTTC	2	10	591496	591505	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_016912	TTTAA	2	10	592044	592053	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016912	AAATT	2	10	595289	595298	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016912	TAAAT	2	10	597882	597891	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016912	AAATT	2	10	599886	599895	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016912	TAAAA	2	10	607025	607034	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016912	ATTAA	2	10	609213	609222	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016912	TTATT	2	10	609262	609271	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016912	CAATA	2	10	609328	609337	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_016912	TTAAT	2	10	611953	611962	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016912	ATTTT	2	10	614240	614249	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016912	ATATA	2	10	614296	614305	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016912	ATAAA	2	10	620932	620941	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016912	TTTTA	2	10	623198	623207	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016912	AAAGG	2	10	623519	623528	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016912	ATATA	2	10	627164	627173	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016912	AAACT	2	10	630689	630698	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_016912	TTCAC	2	10	635902	635911	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_016912	TTTGT	2	10	639810	639819	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016912	AATGA	2	10	639883	639892	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016912	GGTTG	2	10	646885	646894	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016912	AGTAG	2	10	656593	656602	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016912	AAGTT	2	10	657042	657051	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016912	AATTG	2	10	657074	657083	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016912	AAACT	2	10	658949	658958	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_016912	ATTTA	2	10	659340	659349	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016912	AAAGT	2	10	661588	661597	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016912	AATTT	2	10	664197	664206	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016912	CATGA	2	10	666357	666366	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_016912	ATCAT	2	10	670809	670818	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_016912	AATTT	2	10	675702	675711	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016912	AATTA	2	10	682504	682513	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016912	ATTTA	2	10	686685	686694	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016912	AAAGT	2	10	686778	686787	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016912	TAAAG	2	10	688613	688622	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016912	ATTTT	2	10	699165	699174	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016912	TAAGT	2	10	702187	702196	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016912	TAAAA	2	10	705002	705011	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016912	GAATA	2	10	705161	705170	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016912	AAAGT	2	10	707941	707950	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016912	TAATA	2	10	721522	721531	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016912	CATCC	2	10	724254	724263	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
143	NC_016912	AATTA	2	10	730333	730342	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016912	TTCGT	2	10	730374	730383	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_016912	AAATT	2	10	730887	730896	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016912	ATATT	2	10	733820	733829	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016912	TTAAT	2	10	737100	737109	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016912	TTTTA	2	10	738652	738661	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016912	AGTTA	2	10	738678	738687	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016912	TCATG	2	10	738857	738866	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_016912	ATGAT	2	10	744185	744194	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_016912	TGATA	2	10	761912	761921	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_016912	AATTA	2	10	846822	846831	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_016912	TGATT	2	10	854259	854268	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_016912	TTTAA	2	10	875653	875662	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_016912	TTTTA	2	10	889678	889687	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_016912	ATTAA	2	10	906209	906218	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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236	NC_016912	TTATG	2	10	1068964	1068973	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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238	NC_016912	ATGTT	2	10	1072405	1072414	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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242	NC_016912	ATATT	2	10	1077260	1077269	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_016912	CAACA	2	10	1089915	1089924	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
252	NC_016912	TAAAT	2	10	1090036	1090045	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_016912	CATCA	2	10	1090383	1090392	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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272	NC_016912	GAATT	2	10	1229670	1229679	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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