MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 1860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016912	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016912	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016912	ATTA	2	8	3317	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016912	AATT	2	8	3573	3580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016912	CTAC	2	8	12570	12577	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016912	ACGT	2	8	12734	12741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016912	TAAA	2	8	14537	14544	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016912	TGCT	2	8	23802	23809	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016912	ATCT	2	8	24136	24143	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016912	GCCT	2	8	24264	24271	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016912	ATTT	2	8	24596	24603	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016912	TTGA	2	8	30879	30886	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016912	ATCA	2	8	30939	30946	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016912	TTCA	2	8	34238	34245	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016912	ATAA	2	8	34444	34451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016912	ATAA	2	8	34454	34461	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016912	ATCA	2	8	34579	34586	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_016912	CATA	2	8	37149	37156	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_016912	TCCA	2	8	38320	38327	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016912	CATT	2	8	47475	47482	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016912	TAGT	2	8	47529	47536	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016912	GATT	2	8	47540	47547	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016912	TTGA	2	8	49062	49069	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016912	AATA	2	8	50244	50251	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016912	AGCT	2	8	54072	54079	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016912	TAAT	2	8	54217	54224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016912	AGAA	2	8	54236	54243	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016912	TTGT	2	8	55355	55362	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016912	AATC	2	8	56253	56260	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016912	AATC	2	8	57075	57082	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016912	AATC	2	8	57909	57916	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016912	ATAA	2	8	61155	61162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016912	TTAT	2	8	63946	63953	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016912	ATAA	2	8	64244	64251	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016912	CAAT	2	8	66116	66123	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016912	AGGG	2	8	69171	69178	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016912	AAAG	2	8	70753	70760	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016912	ATAA	2	8	71294	71301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016912	TATT	2	8	71332	71339	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016912	AGTA	2	8	73274	73281	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016912	TTGT	2	8	73417	73424	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016912	TGTA	2	8	74990	74997	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016912	AAAT	2	8	75090	75097	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016912	ATTG	2	8	76336	76343	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016912	GTTA	2	8	76458	76465	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016912	TAAA	2	8	91103	91110	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016912	TAAA	2	8	91141	91148	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016912	TAAA	2	8	91598	91605	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016912	TCAT	2	8	91639	91646	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_016912	TATT	2	8	91744	91751	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016912	GAAA	2	8	92431	92438	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016912	ATAA	2	8	93249	93256	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016912	TAAA	2	8	93496	93503	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016912	AAAT	2	8	99408	99415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016912	ATTA	2	8	99442	99449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016912	ATTA	2	8	100281	100288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016912	TAAA	2	8	100305	100312	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016912	GAGC	2	8	101217	101224	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_016912	TGAA	2	8	101280	101287	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016912	ATAG	2	8	102192	102199	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016912	TAAA	2	8	104469	104476	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016912	CTTT	2	8	108902	108909	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016912	CTTT	2	8	110178	110185	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016912	ATTT	2	8	110265	110272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016912	AAGA	2	8	111851	111858	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016912	GAGT	2	8	111874	111881	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016912	ACTT	2	8	113436	113443	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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69	NC_016912	GTAA	2	8	115645	115652	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016912	GAAA	2	8	115740	115747	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016912	AGTA	2	8	115799	115806	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016912	AAGG	2	8	116155	116162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016912	ATTT	2	8	116399	116406	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016912	TATT	2	8	119243	119250	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016912	ATAA	2	8	119370	119377	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016912	TAAT	2	8	119405	119412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016912	TAAA	2	8	133530	133537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016912	AATA	2	8	138754	138761	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016912	ATTA	2	8	138986	138993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016912	GTTT	2	8	139034	139041	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016912	TAAC	2	8	139134	139141	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016912	ATTT	2	8	139376	139383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016912	TTTA	2	8	140647	140654	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016912	GAGT	2	8	142398	142405	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016912	TCAT	2	8	147148	147155	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016912	TTTG	2	8	147231	147238	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016912	ATTT	2	8	148597	148604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016912	ATTT	2	8	148609	148616	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016912	ATGT	2	8	148840	148847	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016912	TTAA	2	8	148961	148968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016912	AGTA	2	8	149003	149010	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016912	AAGT	2	8	157008	157015	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016912	ATCA	2	8	157147	157154	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016912	TAAA	2	8	157872	157879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016912	ATGT	2	8	162409	162416	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016912	TTAA	2	8	163889	163896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016912	AATA	2	8	163939	163946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016912	AATA	2	8	163969	163976	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016912	TATT	2	8	168727	168734	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016912	CTTA	2	8	168815	168822	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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102	NC_016912	TTTG	2	8	168931	168938	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016912	AAAG	2	8	169112	169119	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016912	AGTT	2	8	173611	173618	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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106	NC_016912	GTAG	2	8	173912	173919	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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110	NC_016912	GTTA	2	8	177120	177127	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016912	ATGT	2	8	177243	177250	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016912	ATAA	2	8	180168	180175	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016912	TAGT	2	8	180306	180313	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016912	ATTT	2	8	180354	180361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016912	TGAA	2	8	188477	188484	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016912	ATCA	2	8	190387	190394	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_016912	GGAT	2	8	190514	190521	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016912	TTGT	2	8	199333	199340	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016912	TATT	2	8	200166	200173	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016912	GAAA	2	8	201964	201971	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016912	TTTG	2	8	205454	205461	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016912	ACAT	2	8	205780	205787	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016912	AAAG	2	8	208951	208958	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016912	TTCA	2	8	214199	214206	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_016912	ATTA	2	8	217793	217800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016912	AATT	2	8	225819	225826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016912	AAAT	2	8	225847	225854	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016912	AAAT	2	8	226329	226336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016912	AATT	2	8	227821	227828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016912	ATAA	2	8	227842	227849	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016912	ATTT	2	8	227949	227956	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016912	AAAT	2	8	228115	228122	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016912	AAAT	2	8	228173	228180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016912	ATGT	2	8	228299	228306	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_016912	ATGT	2	8	232546	232553	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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