MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 11972

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016912	GA	3	6	267558	267563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_016912	TAACTT	2	12	267720	267731	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1003	NC_016912	GGA	2	6	267736	267741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_016912	T	6	6	268744	268749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_016912	CTC	2	6	271518	271523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_016912	T	6	6	271591	271596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_016912	GCC	2	6	271617	271622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_016912	T	7	7	271624	271630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_016912	CAC	2	6	271688	271693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_016912	ATC	2	6	271695	271700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_016912	TTC	2	6	271755	271760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_016912	T	6	6	271804	271809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_016912	TAT	2	6	271823	271828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_016912	TCG	2	6	271849	271854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_016912	TCA	2	6	271945	271950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_016912	TATT	2	8	271987	271994	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_016912	AGA	2	6	272007	272012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_016912	TCT	2	6	272098	272103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_016912	TAT	2	6	272132	272137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_016912	T	6	6	272253	272258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_016912	TTC	2	6	272292	272297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_016912	T	6	6	272304	272309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_016912	CTT	2	6	272330	272335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_016912	T	7	7	272354	272360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_016912	TCT	2	6	272428	272433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_016912	T	6	6	272433	272438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_016912	TGT	2	6	272518	272523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_016912	ATT	2	6	272532	272537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_016912	GTT	2	6	272558	272563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_016912	TCTTCA	2	12	272593	272604	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_016912	ATA	2	6	272627	272632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_016912	ATT	2	6	272640	272645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_016912	AAT	2	6	272665	272670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_016912	TTATCT	2	12	272689	272700	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1035	NC_016912	TTG	2	6	272738	272743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_016912	T	6	6	272769	272774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_016912	AAC	2	6	272814	272819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_016912	ACTTC	2	10	272918	272927	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1039	NC_016912	AAT	2	6	272948	272953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_016912	TGTT	2	8	272970	272977	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_016912	GTAT	2	8	272991	272998	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_016912	A	6	6	273015	273020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_016912	AAT	3	9	273063	273071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_016912	TCC	2	6	273108	273113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_016912	ATT	2	6	273116	273121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_016912	TTA	2	6	273152	273157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_016912	TAA	2	6	273203	273208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_016912	TAA	2	6	273213	273218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_016912	TAA	2	6	273232	273237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_016912	A	6	6	273243	273248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_016912	TAA	2	6	273291	273296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_016912	T	7	7	273303	273309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_016912	GAA	2	6	273313	273318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_016912	ATTT	2	8	273320	273327	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_016912	A	6	6	274037	274042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_016912	ATTTA	2	10	275706	275715	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_016912	TTAA	2	8	275753	275760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_016912	AT	3	6	275763	275768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_016912	AT	3	6	275780	275785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_016912	A	6	6	275793	275798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_016912	A	6	6	275812	275817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_016912	TA	3	6	275819	275824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_016912	TAA	2	6	275832	275837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_016912	TA	3	6	275840	275845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_016912	A	6	6	275871	275876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_016912	AGG	2	6	275915	275920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_016912	T	7	7	276274	276280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_016912	AAC	2	6	276286	276291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_016912	TAA	2	6	281553	281558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_016912	AGG	2	6	285830	285835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_016912	TCA	2	6	290004	290009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_016912	AAT	3	9	290010	290018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_016912	A	6	6	290098	290103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_016912	TA	4	8	290836	290843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_016912	ATT	2	6	290873	290878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_016912	ATG	2	6	290888	290893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_016912	TTTA	2	8	291593	291600	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_016912	A	6	6	291610	291615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_016912	TA	3	6	291617	291622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_016912	T	6	6	291634	291639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_016912	TAAA	2	8	291658	291665	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_016912	AAT	2	6	291677	291682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_016912	GAA	2	6	291932	291937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_016912	GTT	2	6	291958	291963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_016912	TTTA	2	8	291972	291979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_016912	AGA	2	6	294636	294641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_016912	ATT	2	6	294656	294661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_016912	CAT	2	6	294700	294705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_016912	T	6	6	294813	294818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_016912	A	7	7	294831	294837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_016912	TA	3	6	294849	294854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_016912	T	6	6	294866	294871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_016912	TAAA	2	8	294905	294912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_016912	TA	3	6	294913	294918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_016912	TAT	2	6	294978	294983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_016912	AAG	2	6	295041	295046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_016912	TAAT	2	8	295059	295066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_016912	GT	3	6	295167	295172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_016912	CTTT	2	8	295585	295592	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1100	NC_016912	AAT	2	6	295636	295641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_016912	TA	4	8	295675	295682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_016912	ATA	4	12	295706	295717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_016912	TAAA	2	8	296167	296174	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_016912	CT	3	6	296178	296183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_016912	AG	3	6	296217	296222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_016912	A	7	7	296277	296283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_016912	AAT	2	6	297229	297234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_016912	AATT	2	8	297242	297249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_016912	T	6	6	297283	297288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_016912	ATTT	2	8	297297	297304	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_016912	AAT	2	6	297308	297313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_016912	AGAC	2	8	297318	297325	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1113	NC_016912	A	6	6	297356	297361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_016912	TCCT	2	8	298721	298728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_016912	ATA	2	6	298743	298748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_016912	A	6	6	298753	298758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_016912	TAT	2	6	298812	298817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_016912	A	6	6	298823	298828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_016912	AAT	2	6	298835	298840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_016912	TAT	2	6	298851	298856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_016912	AAGT	2	8	298904	298911	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_016912	TGAG	2	8	298954	298961	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_016912	GTT	2	6	299002	299007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_016912	TTA	2	6	299107	299112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_016912	TC	4	8	299129	299136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_016912	ATA	2	6	299204	299209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_016912	TAAA	2	8	299239	299246	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_016912	ATA	2	6	300273	300278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_016912	AATT	2	8	300282	300289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_016912	GTAT	2	8	300347	300354	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_016912	ACG	2	6	300373	300378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_016912	TAG	3	9	300415	300423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_016912	GA	3	6	300425	300430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_016912	TTA	2	6	302178	302183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_016912	CAT	2	6	302192	302197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_016912	TAT	2	6	302221	302226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_016912	TAA	3	9	302250	302258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_016912	TTA	2	6	302259	302264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_016912	ATA	2	6	302292	302297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_016912	T	6	6	302298	302303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_016912	GTA	2	6	302304	302309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1144	NC_016912	T	6	6	303573	303578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1176	NC_016912	ATT	2	6	314028	314033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1263	NC_016912	TGA	2	6	347504	347509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1271	NC_016912	TAT	2	6	349901	349906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1272	NC_016912	TGC	2	6	349915	349920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1275	NC_016912	A	7	7	356245	356251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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