MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 11972

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_016912	TTTA	2	8	2572624	2572631	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_016912	AAC	2	6	2572686	2572691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11504	NC_016912	TTTA	2	8	2572724	2572731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_016912	T	7	7	2572773	2572779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_016912	TATT	2	8	2572804	2572811	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11508	NC_016912	AAC	2	6	2573421	2573426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11509	NC_016912	ATG	2	6	2573431	2573436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_016912	AATA	2	8	2573495	2573502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_016912	CAAT	2	8	2573529	2573536	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11512	NC_016912	AT	3	6	2573587	2573592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_016912	TTTA	2	8	2574331	2574338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_016912	TAA	2	6	2574342	2574347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_016912	AATA	2	8	2574392	2574399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_016912	A	6	6	2574415	2574420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_016912	ACA	2	6	2574435	2574440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11522	NC_016912	TAA	2	6	2576227	2576232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_016912	TAAC	2	8	2576258	2576265	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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11525	NC_016912	ATT	2	6	2576308	2576313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11539	NC_016912	TA	4	8	2579121	2579128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11543	NC_016912	CGTC	2	8	2579244	2579251	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11544	NC_016912	TAT	2	6	2579273	2579278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11549	NC_016912	A	7	7	2580794	2580800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_016912	T	6	6	2580803	2580808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_016912	TCCTG	2	10	2580875	2580884	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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11562	NC_016912	T	6	6	2583795	2583800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_016912	AAAC	2	8	2583821	2583828	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11564	NC_016912	TTA	2	6	2583932	2583937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11599	NC_016912	TGT	2	6	2585834	2585839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11601	NC_016912	TA	3	6	2585875	2585880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_016912	TTATC	2	10	2585933	2585942	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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11608	NC_016912	A	7	7	2588867	2588873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_016912	T	6	6	2589867	2589872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_016912	ATC	2	6	2589906	2589911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11614	NC_016912	TTCTA	2	10	2590739	2590748	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11615	NC_016912	AT	4	8	2590771	2590778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11632	NC_016912	TA	3	6	2596921	2596926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11904	NC_016912	TA	3	6	2676104	2676109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11905	NC_016912	AAT	2	6	2676113	2676118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11931	NC_016912	GA	3	6	2683659	2683664	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11964	NC_016912	TTA	2	6	2691653	2691658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11972	NC_016912	T	7	7	2692556	2692562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.