MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 11972

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016912	TA	3	6	137177	137182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_016912	ATT	2	6	137207	137212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_016912	ATG	2	6	137217	137222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016912	TAT	2	6	137235	137240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_016912	GA	3	6	137256	137261	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016912	AATA	2	8	138754	138761	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_016912	GTT	2	6	138819	138824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016912	CAAAA	2	10	138836	138845	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
509	NC_016912	TA	3	6	138846	138851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016912	ATA	2	6	138889	138894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_016912	ATC	2	6	138920	138925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_016912	CTG	2	6	138929	138934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_016912	TAT	2	6	138964	138969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_016912	GTT	2	6	138979	138984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_016912	ATTA	2	8	138986	138993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_016912	GTTT	2	8	139034	139041	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
517	NC_016912	T	6	6	139075	139080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_016912	T	6	6	139116	139121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_016912	TAAC	2	8	139134	139141	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
520	NC_016912	AAT	2	6	139144	139149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_016912	ATT	2	6	139157	139162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_016912	AAAGC	2	10	139186	139195	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
523	NC_016912	GAT	2	6	139279	139284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_016912	ATT	2	6	139341	139346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016912	ACG	2	6	139369	139374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_016912	ATTT	2	8	139376	139383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_016912	CGTTT	2	10	140405	140414	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
528	NC_016912	TA	4	8	140637	140644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_016912	TTTA	2	8	140647	140654	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016912	AT	3	6	140690	140695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_016912	A	7	7	140721	140727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_016912	T	6	6	140769	140774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_016912	AGG	2	6	140788	140793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_016912	TTA	2	6	140796	140801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_016912	ACA	2	6	141319	141324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_016912	TGA	2	6	141328	141333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_016912	AT	3	6	141335	141340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_016912	TA	3	6	141342	141347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_016912	AGT	2	6	141404	141409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_016912	GAA	2	6	141416	141421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_016912	TAG	2	6	141473	141478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_016912	CGT	2	6	141496	141501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_016912	ATC	2	6	141548	141553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_016912	TAG	2	6	141630	141635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_016912	GAGT	2	8	142398	142405	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
546	NC_016912	GA	3	6	144144	144149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
547	NC_016912	T	6	6	145201	145206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_016912	TTG	2	6	145219	145224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_016912	T	6	6	145230	145235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_016912	ATA	2	6	145239	145244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_016912	TAA	4	12	145314	145325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_016912	TAA	2	6	145347	145352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_016912	CTT	2	6	145385	145390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_016912	AAG	2	6	145397	145402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_016912	AAT	2	6	145818	145823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_016912	GGT	2	6	145831	145836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_016912	T	7	7	145853	145859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_016912	GA	3	6	145924	145929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
559	NC_016912	TA	3	6	146999	147004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_016912	ACT	2	6	147021	147026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_016912	TGT	2	6	147029	147034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_016912	AGT	2	6	147044	147049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_016912	T	7	7	147049	147055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_016912	ATT	2	6	147134	147139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_016912	TCAT	2	8	147148	147155	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
566	NC_016912	AAT	2	6	147160	147165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_016912	AT	3	6	147164	147169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_016912	T	7	7	147186	147192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_016912	TTTG	2	8	147231	147238	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
570	NC_016912	TAA	2	6	147286	147291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_016912	TA	3	6	147299	147304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_016912	GT	3	6	147312	147317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
573	NC_016912	AT	3	6	147318	147323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_016912	TTA	2	6	147340	147345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_016912	ATTT	2	8	148597	148604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_016912	ATTT	2	8	148609	148616	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_016912	TTA	2	6	148676	148681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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580	NC_016912	AAC	2	6	148794	148799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_016912	ATGT	2	8	148840	148847	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
582	NC_016912	GAT	2	6	148879	148884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_016912	AT	3	6	148907	148912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_016912	TTAA	2	8	148961	148968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_016912	TCG	2	6	148973	148978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_016912	TATCA	2	10	148981	148990	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
587	NC_016912	AGTA	2	8	149003	149010	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
588	NC_016912	TAT	2	6	149016	149021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_016912	AAG	2	6	149029	149034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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591	NC_016912	CAT	2	6	156982	156987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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593	NC_016912	ATA	2	6	157058	157063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_016912	ACG	2	6	157071	157076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_016912	ATCAT	2	10	157113	157122	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
596	NC_016912	TAA	2	6	157129	157134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_016912	ATCA	2	8	157147	157154	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
598	NC_016912	GAT	2	6	157167	157172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_016912	CTC	2	6	157706	157711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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601	NC_016912	TTA	2	6	157808	157813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_016912	T	6	6	157815	157820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_016912	TAAA	2	8	157872	157879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_016912	ATC	2	6	157910	157915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_016912	ACC	2	6	158726	158731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_016912	CCT	2	6	161025	161030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_016912	AT	3	6	161036	161041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_016912	TTTATA	2	12	162252	162263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_016912	ATTAAT	2	12	162275	162286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_016912	AT	3	6	162285	162290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_016912	GTT	2	6	162295	162300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_016912	TAA	2	6	162325	162330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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614	NC_016912	ATGT	2	8	162409	162416	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
615	NC_016912	GTA	2	6	162435	162440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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617	NC_016912	TTAA	2	8	163889	163896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_016912	ATA	2	6	163898	163903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_016912	AATA	2	8	163939	163946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_016912	T	6	6	163952	163957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_016912	AATA	2	8	163969	163976	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_016912	T	6	6	163980	163985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_016912	GTA	2	6	163988	163993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_016912	G	6	6	164107	164112	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
625	NC_016912	CTT	2	6	164632	164637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_016912	TTA	2	6	164664	164669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_016912	ATC	2	6	164676	164681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_016912	TAA	2	6	164704	164709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_016912	A	7	7	166388	166394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_016912	TGT	2	6	166466	166471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_016912	T	6	6	166502	166507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_016912	G	6	6	166524	166529	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
633	NC_016912	TGA	2	6	166537	166542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_016912	TATT	2	8	168727	168734	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_016912	A	7	7	168749	168755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_016912	CTTA	2	8	168815	168822	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
637	NC_016912	TAAT	2	8	168841	168848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_016912	AAG	2	6	168853	168858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_016912	AGT	2	6	168869	168874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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956	NC_016912	TAG	2	6	258512	258517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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982	NC_016912	A	6	6	263668	263673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
983	NC_016912	ATG	2	6	263683	263688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
984	NC_016912	A	6	6	263709	263714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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