MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 11972

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016912	TTC	2	6	1418886	1418891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_016912	ATC	2	6	1418933	1418938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_016912	AAAT	2	8	1418955	1418962	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_016912	CA	4	8	1418979	1418986	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6005	NC_016912	GGGA	2	8	1419018	1419025	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_016912	TC	3	6	1420415	1420420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6007	NC_016912	TAA	2	6	1420443	1420448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_016912	T	6	6	1420488	1420493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_016912	A	6	6	1420506	1420511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_016912	AAG	2	6	1420527	1420532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_016912	CTT	2	6	1420542	1420547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_016912	T	6	6	1420568	1420573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_016912	CTC	2	6	1420915	1420920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6014	NC_016912	TAT	2	6	1420938	1420943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_016912	ATT	2	6	1420956	1420961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_016912	T	6	6	1422180	1422185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_016912	CAA	2	6	1422195	1422200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_016912	A	6	6	1422300	1422305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_016912	CAT	2	6	1422312	1422317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_016912	TAG	2	6	1422333	1422338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_016912	TGTTC	2	10	1422357	1422366	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6022	NC_016912	TCA	2	6	1422375	1422380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_016912	GT	3	6	1422444	1422449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_016912	TA	3	6	1422698	1422703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_016912	ATT	2	6	1422750	1422755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_016912	CCT	2	6	1424059	1424064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6027	NC_016912	T	6	6	1424068	1424073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_016912	TA	3	6	1424115	1424120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_016912	T	6	6	1424135	1424140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_016912	TA	3	6	1424183	1424188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_016912	TGT	2	6	1424210	1424215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_016912	TAA	2	6	1424240	1424245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_016912	CTG	2	6	1424269	1424274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_016912	AAC	2	6	1424278	1424283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_016912	TACTTG	2	12	1424287	1424298	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6036	NC_016912	AAAAAT	2	12	1424303	1424314	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_016912	AATT	2	8	1424393	1424400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_016912	TG	3	6	1424406	1424411	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_016912	TAT	2	6	1424438	1424443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_016912	ATT	2	6	1424447	1424452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_016912	TGT	2	6	1424541	1424546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_016912	TAA	2	6	1424550	1424555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_016912	TAC	2	6	1424564	1424569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_016912	TG	3	6	1424576	1424581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_016912	T	7	7	1427450	1427456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_016912	TTC	2	6	1427460	1427465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_016912	TGG	2	6	1427474	1427479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_016912	T	7	7	1427498	1427504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_016912	TAG	2	6	1427532	1427537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_016912	ATT	2	6	1427616	1427621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_016912	GTT	2	6	1427637	1427642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_016912	AT	3	6	1427703	1427708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_016912	TTA	2	6	1427709	1427714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_016912	ATG	2	6	1427840	1427845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_016912	GACAC	2	10	1427880	1427889	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6056	NC_016912	TG	3	6	1427908	1427913	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_016912	TA	3	6	1427927	1427932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_016912	AT	3	6	1429721	1429726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_016912	TAG	2	6	1429732	1429737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6061	NC_016912	T	6	6	1429761	1429766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_016912	TATT	2	8	1429811	1429818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_016912	TAT	2	6	1429933	1429938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_016912	ATA	2	6	1429940	1429945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_016912	TA	3	6	1429944	1429949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_016912	TATT	2	8	1431276	1431283	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_016912	T	6	6	1431282	1431287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_016912	TCAT	2	8	1431301	1431308	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6069	NC_016912	ACAAT	2	10	1431407	1431416	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6070	NC_016912	AT	3	6	1431434	1431439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_016912	ATT	2	6	1431454	1431459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_016912	T	6	6	1431473	1431478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_016912	GAC	2	6	1431517	1431522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6075	NC_016912	CATGT	2	10	1431554	1431563	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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6081	NC_016912	TA	4	8	1437731	1437738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_016912	TCAT	2	8	1437740	1437747	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6083	NC_016912	TACT	2	8	1437755	1437762	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6084	NC_016912	ATA	2	6	1437769	1437774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_016912	GATG	2	8	1437799	1437806	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_016912	TTAATC	2	12	1437810	1437821	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6087	NC_016912	AT	3	6	1437837	1437842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_016912	TA	3	6	1438204	1438209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_016912	CATG	2	8	1438224	1438231	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6090	NC_016912	GTT	2	6	1438272	1438277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6093	NC_016912	CTAA	2	8	1438324	1438331	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6094	NC_016912	AATAA	2	10	1438381	1438390	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_016912	AAT	2	6	1438398	1438403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_016912	A	7	7	1438426	1438432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6100	NC_016912	TTCA	2	8	1442973	1442980	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6101	NC_016912	TTG	2	6	1444066	1444071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_016912	AC	3	6	1445239	1445244	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6103	NC_016912	TGT	2	6	1445281	1445286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_016912	TGTT	2	8	1445319	1445326	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_016912	ATTA	2	8	1445401	1445408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_016912	AT	3	6	1445411	1445416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_016912	CAT	2	6	1445455	1445460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_016912	ATTA	2	8	1445467	1445474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_016912	ATA	2	6	1445520	1445525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_016912	GAAC	2	8	1445552	1445559	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6111	NC_016912	ATT	2	6	1445565	1445570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_016912	A	7	7	1445593	1445599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_016912	AAC	2	6	1445828	1445833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_016912	TC	3	6	1445838	1445843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6115	NC_016912	CT	3	6	1445873	1445878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6116	NC_016912	A	6	6	1445896	1445901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_016912	TAC	2	6	1445924	1445929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_016912	A	6	6	1445935	1445940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_016912	TAAA	2	8	1446001	1446008	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_016912	TAT	2	6	1446524	1446529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_016912	AT	3	6	1446528	1446533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_016912	ATA	2	6	1448975	1448980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_016912	ATT	2	6	1448998	1449003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_016912	TAG	2	6	1449031	1449036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_016912	TAT	2	6	1449124	1449129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_016912	AATG	2	8	1449157	1449164	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6128	NC_016912	CCT	2	6	1449549	1449554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6129	NC_016912	ATT	2	6	1449676	1449681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_016912	TAA	2	6	1449695	1449700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_016912	CT	3	6	1452046	1452051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6132	NC_016912	TAA	2	6	1452066	1452071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_016912	TTA	2	6	1452103	1452108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6135	NC_016912	GTC	2	6	1453561	1453566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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