MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 11972

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016912	AG	3	6	1125632	1125637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_016912	GT	3	6	1126569	1126574	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_016912	T	7	7	1126574	1126580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_016912	TGAT	2	8	1126592	1126599	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_016912	TAA	2	6	1126604	1126609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_016912	A	6	6	1126628	1126633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_016912	ATG	3	9	1126655	1126663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_016912	ATT	2	6	1130321	1130326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_016912	TTA	2	6	1130492	1130497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_016912	TACT	2	8	1130538	1130545	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5011	NC_016912	AAAC	2	8	1130569	1130576	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5012	NC_016912	TATC	2	8	1130646	1130653	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5013	NC_016912	ACT	2	6	1130663	1130668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_016912	ATT	2	6	1130672	1130677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_016912	ATAA	2	8	1130749	1130756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_016912	T	6	6	1130758	1130763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_016912	TATG	2	8	1130769	1130776	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_016912	CAAA	2	8	1130788	1130795	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5019	NC_016912	TG	3	6	1131779	1131784	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_016912	AAAT	2	8	1131787	1131794	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_016912	TAC	2	6	1131799	1131804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_016912	AAT	2	6	1131809	1131814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_016912	AAT	3	9	1131818	1131826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_016912	TAA	2	6	1131869	1131874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_016912	ATA	2	6	1131896	1131901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_016912	ATTT	2	8	1131918	1131925	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_016912	ATC	2	6	1132232	1132237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_016912	TAT	2	6	1132295	1132300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_016912	ATG	2	6	1132364	1132369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_016912	AT	3	6	1132386	1132391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_016912	TGA	2	6	1132408	1132413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_016912	GAG	2	6	1132422	1132427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_016912	TCA	2	6	1139083	1139088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_016912	TA	3	6	1139159	1139164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_016912	ATA	2	6	1139185	1139190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_016912	AT	3	6	1139780	1139785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_016912	TAC	2	6	1139811	1139816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_016912	AC	3	6	1139861	1139866	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5039	NC_016912	ATT	2	6	1139918	1139923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_016912	ATT	2	6	1140047	1140052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_016912	TAA	2	6	1141415	1141420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_016912	TAA	2	6	1141436	1141441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_016912	TAGA	2	8	1141453	1141460	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_016912	ATA	3	9	1141470	1141478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_016912	TAAT	2	8	1141493	1141500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_016912	TAT	2	6	1141519	1141524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_016912	ATT	2	6	1141609	1141614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_016912	A	7	7	1141683	1141689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_016912	TCC	2	6	1141729	1141734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5050	NC_016912	T	6	6	1141748	1141753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_016912	AT	3	6	1141761	1141766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_016912	CCT	2	6	1141966	1141971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5053	NC_016912	TAA	2	6	1141973	1141978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_016912	ACT	2	6	1141994	1141999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_016912	TA	3	6	1142000	1142005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_016912	TTAA	2	8	1142007	1142014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_016912	AAT	2	6	1142044	1142049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_016912	GTA	2	6	1142109	1142114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_016912	TGAA	2	8	1142135	1142142	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_016912	TTTA	2	8	1142155	1142162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_016912	TAC	2	6	1142167	1142172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_016912	ATA	2	6	1142235	1142240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_016912	AAT	2	6	1142294	1142299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_016912	AAT	2	6	1142366	1142371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_016912	AGG	2	6	1142386	1142391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_016912	TAAAA	2	10	1144442	1144451	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_016912	A	6	6	1144448	1144453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_016912	ATC	2	6	1144467	1144472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_016912	T	6	6	1144482	1144487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_016912	ATAAA	2	10	1144567	1144576	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_016912	ATA	2	6	1146799	1146804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_016912	TTG	2	6	1146823	1146828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_016912	T	6	6	1150272	1150277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_016912	TAG	2	6	1150299	1150304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5076	NC_016912	GTC	2	6	1150591	1150596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5078	NC_016912	GAT	2	6	1150654	1150659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_016912	GAA	2	6	1151467	1151472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_016912	AAC	2	6	1151490	1151495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_016912	GAGG	2	8	1156713	1156720	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_016912	TTG	2	6	1158120	1158125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5084	NC_016912	TTG	2	6	1158244	1158249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_016912	TAA	2	6	1158257	1158262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_016912	TTAAC	2	10	1158322	1158331	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5092	NC_016912	TTA	2	6	1158857	1158862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_016912	ATT	2	6	1158941	1158946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_016912	GCT	2	6	1160285	1160290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5098	NC_016912	TA	3	6	1160859	1160864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_016912	CTA	2	6	1160874	1160879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5102	NC_016912	AT	3	6	1163690	1163695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_016912	AAT	2	6	1163698	1163703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_016912	TAA	2	6	1163737	1163742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_016912	ATG	2	6	1163761	1163766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_016912	AAT	2	6	1163790	1163795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_016912	AAG	2	6	1163824	1163829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5109	NC_016912	TAA	2	6	1163898	1163903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_016912	A	6	6	1165597	1165602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_016912	T	6	6	1165633	1165638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5113	NC_016912	GAT	2	6	1167787	1167792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_016912	ATT	2	6	1167898	1167903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_016912	CCT	2	6	1167907	1167912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5116	NC_016912	AT	3	6	1167950	1167955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_016912	TAT	2	6	1167981	1167986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_016912	GAAATT	2	12	1170411	1170422	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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5121	NC_016912	A	6	6	1171511	1171516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_016912	ATTAG	2	10	1171594	1171603	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_016912	ATA	2	6	1173786	1173791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_016912	AAC	2	6	1173799	1173804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5128	NC_016912	A	6	6	1175293	1175298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_016912	TAAA	2	8	1175303	1175310	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_016912	TTGA	2	8	1175325	1175332	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_016912	TAAA	2	8	1175355	1175362	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5133	NC_016912	ATA	2	6	1175384	1175389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5404	NC_016912	GTTAG	2	10	1249925	1249934	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5405	NC_016912	AAATT	2	10	1249944	1249953	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5406	NC_016912	TGTC	2	8	1249971	1249978	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5407	NC_016912	AAT	2	6	1250036	1250041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5408	NC_016912	GAT	2	6	1250098	1250103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5410	NC_016912	TAA	2	6	1250168	1250173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5411	NC_016912	T	6	6	1250203	1250208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5412	NC_016912	AT	3	6	1250230	1250235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5413	NC_016912	GAT	2	6	1250236	1250241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5423	NC_016912	AAATT	2	10	1250760	1250769	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5424	NC_016912	ACT	2	6	1250802	1250807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5426	NC_016912	CTAAT	2	10	1250837	1250846	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5427	NC_016912	TGA	3	9	1250967	1250975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5428	NC_016912	TAT	2	6	1251023	1251028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5429	NC_016912	TGA	2	6	1251033	1251038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5431	NC_016912	A	6	6	1251081	1251086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5432	NC_016912	A	7	7	1251110	1251116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5433	NC_016912	TAA	2	6	1251386	1251391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5434	NC_016912	TAA	2	6	1251416	1251421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5435	NC_016912	TAG	2	6	1251436	1251441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5436	NC_016912	A	6	6	1251540	1251545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5437	NC_016912	T	6	6	1251589	1251594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5438	NC_016912	AAG	2	6	1251671	1251676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5439	NC_016912	A	6	6	1251694	1251699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5440	NC_016912	TAA	2	6	1251726	1251731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5441	NC_016912	TCAG	2	8	1251773	1251780	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5451	NC_016912	A	6	6	1252062	1252067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5452	NC_016912	TA	3	6	1253011	1253016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5453	NC_016912	AAATA	2	10	1253036	1253045	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5455	NC_016912	TGA	2	6	1253400	1253405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5482	NC_016912	GTA	2	6	1255931	1255936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5484	NC_016912	ATC	2	6	1255964	1255969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5499	NC_016912	A	7	7	1259265	1259271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5500	NC_016912	ACAA	2	8	1262582	1262589	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding

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