MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS678 plasmid pSBAL67801

Total Repeats: 252

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016905	TAA	2	6	41	46	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016905	AAT	2	6	47	52	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016905	GT	3	6	114	119	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016905	ATT	2	6	120	125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016905	GTT	2	6	229	234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016905	TA	3	6	637	642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016905	CG	3	6	6632	6637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016905	CAT	2	6	26647	26652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016905	TA	3	6	27349	27354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016905	TAAT	2	8	27372	27379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016905	ATA	2	6	27629	27634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016905	TTA	2	6	27652	27657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016905	TGAAA	2	10	27676	27685	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016905	T	7	7	27946	27952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016905	CTT	2	6	27954	27959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016905	GGT	2	6	28039	28044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016905	ATT	2	6	28058	28063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016905	A	8	8	28067	28074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016905	CCT	2	6	28082	28087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_016905	AAG	2	6	28127	28132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016905	T	7	7	28274	28280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016905	CTA	2	6	28337	28342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016905	GT	3	6	28379	28384	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016905	GGT	2	6	28389	28394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016905	T	6	6	28446	28451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016905	CGAT	2	8	28492	28499	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_016905	ATT	2	6	28576	28581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016905	GCA	2	6	28601	28606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016905	ATC	2	6	28658	28663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016905	GGC	2	6	29451	29456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016905	ATAA	2	8	29476	29483	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016905	TC	4	8	29529	29536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016905	GTAT	2	8	29598	29605	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016905	TTA	2	6	29610	29615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016905	T	6	6	29660	29665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016905	CTTA	2	8	29676	29683	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_016905	TTA	2	6	29699	29704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016905	A	6	6	29858	29863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016905	GAA	2	6	29906	29911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016905	CT	3	6	30075	30080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016905	TGT	2	6	30349	30354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016905	ATT	2	6	30463	30468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016905	AGT	2	6	32830	32835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016905	GTACA	2	10	32838	32847	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_016905	TTA	2	6	32849	32854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016905	TTA	2	6	32856	32861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016905	TTA	2	6	32863	32868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016905	TTA	2	6	32870	32875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016905	AT	3	6	32896	32901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016905	TTGTT	2	10	32934	32943	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016905	GTA	2	6	33003	33008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016905	TAA	2	6	33049	33054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016905	AAAGA	2	10	33167	33176	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016905	CCA	2	6	37135	37140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_016905	TCC	2	6	37193	37198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_016905	ATT	2	6	37201	37206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016905	T	6	6	37214	37219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016905	T	6	6	37230	37235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016905	TTC	2	6	37277	37282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016905	T	6	6	37369	37374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016905	GTT	2	6	37438	37443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016905	TTG	2	6	37448	37453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016905	T	6	6	37631	37636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016905	T	7	7	37781	37787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016905	AATG	2	8	37792	37799	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016905	CTC	2	6	37805	37810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_016905	ATA	2	6	37843	37848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016905	TAA	2	6	39058	39063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016905	TGA	2	6	39824	39829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016905	GAT	2	6	40261	40266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016905	AGA	2	6	40450	40455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016905	GTT	2	6	40612	40617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016905	CGG	2	6	40631	40636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016905	TTA	2	6	40643	40648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016905	T	6	6	41636	41641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016905	A	6	6	41665	41670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016905	A	6	6	41684	41689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016905	TTAG	2	8	43701	43708	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016905	ATT	2	6	43775	43780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016905	CAT	2	6	43888	43893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016905	CCG	2	6	43950	43955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_016905	A	6	6	44088	44093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016905	G	6	6	44155	44160	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016905	CTT	2	6	44162	44167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016905	AAG	2	6	44235	44240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016905	AT	3	6	44246	44251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016905	TCA	2	6	46968	46973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016905	T	6	6	46976	46981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016905	TGT	2	6	47064	47069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016905	TAAT	2	8	47152	47159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016905	TTC	2	6	47187	47192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016905	AGG	2	6	47210	47215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016905	CGG	2	6	50826	50831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016905	GAA	2	6	50947	50952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016905	GAG	2	6	50969	50974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016905	A	6	6	50989	50994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016905	CT	3	6	51003	51008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_016905	AAAAG	2	10	51124	51133	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016905	AGTGA	2	10	51166	51175	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016905	ATA	2	6	51300	51305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016905	AGA	2	6	51330	51335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016905	CTG	2	6	51342	51347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016905	CA	3	6	51464	51469	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_016905	TTG	2	6	51611	51616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016905	CAA	2	6	51668	51673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016905	TTA	2	6	51824	51829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016905	CAC	2	6	51907	51912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_016905	GTCAC	2	10	51950	51959	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_016905	ACGA	2	8	52102	52109	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_016905	CCTT	2	8	52130	52137	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016905	TTC	2	6	52145	52150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016905	TGA	2	6	52335	52340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016905	TC	3	6	52360	52365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016905	AAG	2	6	52369	52374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016905	T	6	6	52384	52389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016905	TTTC	2	8	52394	52401	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_016905	TCA	2	6	52444	52449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_016905	TTCC	2	8	52497	52504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_016905	TTC	2	6	52627	52632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016905	AAC	2	6	52704	52709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016905	TGT	2	6	52724	52729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016905	TGAA	2	8	52818	52825	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016905	TTG	2	6	52853	52858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016905	GGC	2	6	52873	52878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016905	CGT	2	6	52887	52892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016905	CTT	2	6	52909	52914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016905	GCG	2	6	52928	52933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016905	TGC	2	6	52961	52966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016905	ACA	2	6	52973	52978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016905	TTAG	2	8	53045	53052	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016905	GCA	2	6	58275	58280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016905	AT	3	6	62848	62853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016905	GGT	2	6	63092	63097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016905	ATTC	2	8	63534	63541	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016905	TA	3	6	63552	63557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016905	ACC	2	6	64210	64215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_016905	G	6	6	64339	64344	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016905	T	6	6	64354	64359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016905	GA	3	6	65328	65333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016905	TTTAT	2	10	65367	65376	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016905	ACA	2	6	65382	65387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_016905	AAG	2	6	66261	66266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016905	TTGA	2	8	66285	66292	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016905	CCG	2	6	66299	66304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_016905	AG	3	6	66338	66343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016905	TTA	2	6	66358	66363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016905	CTT	2	6	66413	66418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_016905	ATT	2	6	66459	66464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016905	TGC	2	6	66488	66493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_016905	CAT	2	6	66508	66513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_016905	TGC	2	6	66629	66634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_016905	TTG	2	6	66637	66642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016905	GTGG	2	8	66657	66664	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
154	NC_016905	TGA	2	6	66709	66714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_016905	T	9	9	66743	66751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_016905	ATT	2	6	66786	66791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_016905	TAA	2	6	66831	66836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_016905	CTA	2	6	66843	66848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_016905	ACTC	2	8	66880	66887	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
160	NC_016905	GTC	2	6	66910	66915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_016905	GCTG	2	8	66954	66961	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
162	NC_016905	GTT	2	6	66969	66974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_016905	CAA	2	6	67019	67024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_016905	AAT	2	6	67031	67036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_016905	CAA	2	6	67061	67066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_016905	ATT	2	6	67082	67087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_016905	T	6	6	67149	67154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_016905	GCG	2	6	67176	67181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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171	NC_016905	ATTTTT	2	12	67231	67242	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_016905	T	7	7	67238	67244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_016905	ATT	2	6	67261	67266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_016905	ATGCA	2	10	67300	67309	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
175	NC_016905	CTG	2	6	67338	67343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_016905	TTG	2	6	67383	67388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_016905	GTG	2	6	68746	68751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_016905	A	6	6	70532	70537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_016905	ATG	2	6	70589	70594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_016905	GTTT	2	8	70714	70721	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
184	NC_016905	TCGG	2	8	71716	71723	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
185	NC_016905	TCGCT	2	10	71729	71738	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
186	NC_016905	GCAA	2	8	71765	71772	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
187	NC_016905	CAA	2	6	71814	71819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
188	NC_016905	CCAAA	2	10	71826	71835	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
189	NC_016905	CTT	2	6	71955	71960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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192	NC_016905	TGTC	2	8	72016	72023	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
193	NC_016905	TAAA	2	8	74032	74039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_016905	TG	3	6	74046	74051	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
195	NC_016905	GT	3	6	74057	74062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
196	NC_016905	ATA	2	6	74063	74068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_016905	TTG	2	6	75342	75347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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239	NC_016905	GC	3	6	78976	78981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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251	NC_016905	GTT	2	6	80647	80652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
252	NC_016905	T	8	8	80689	80696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.