MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS678 chromosome

Total Repeats: 15458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016901	T	6	6	1614644	1614649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_016901	T	6	6	1614657	1614662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_016901	TCT	2	6	1614689	1614694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_016901	TTGG	2	8	1614703	1614710	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_016901	TGC	2	6	1617192	1617197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_016901	AGG	2	6	1617241	1617246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_016901	GAA	2	6	1617298	1617303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_016901	GGGCT	2	10	1624284	1624293	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5009	NC_016901	CAA	2	6	1624353	1624358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_016901	TTA	2	6	1625877	1625882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_016901	GCA	2	6	1627543	1627548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_016901	C	6	6	1627640	1627645	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5013	NC_016901	TAC	2	6	1630827	1630832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_016901	TAAGT	2	10	1632281	1632290	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_016901	TAAGT	2	10	1632296	1632305	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_016901	TAAGC	2	10	1632311	1632320	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5017	NC_016901	CAA	2	6	1632322	1632327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_016901	TAA	2	6	1632335	1632340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_016901	TTG	2	6	1632436	1632441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_016901	CGAG	2	8	1632488	1632495	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5021	NC_016901	TTA	2	6	1633643	1633648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_016901	TG	3	6	1634517	1634522	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_016901	ATG	2	6	1634574	1634579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_016901	CAT	2	6	1634709	1634714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_016901	ATTG	2	8	1634853	1634860	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_016901	GGC	2	6	1634875	1634880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_016901	CTC	2	6	1635449	1635454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_016901	GGC	2	6	1635527	1635532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_016901	CTG	2	6	1635586	1635591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_016901	GGC	2	6	1635605	1635610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_016901	GAT	2	6	1635611	1635616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_016901	CAG	2	6	1635650	1635655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_016901	GTA	2	6	1635699	1635704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_016901	T	6	6	1635881	1635886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_016901	TTC	2	6	1635921	1635926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_016901	ATC	2	6	1635933	1635938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_016901	AAC	2	6	1636030	1636035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_016901	AGT	2	6	1636049	1636054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_016901	GCG	2	6	1636077	1636082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_016901	AGC	2	6	1636090	1636095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_016901	GCCAA	2	10	1636166	1636175	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5042	NC_016901	GTA	2	6	1636319	1636324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_016901	CTT	2	6	1636372	1636377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_016901	TTA	2	6	1636404	1636409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_016901	AAG	2	6	1636458	1636463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_016901	CGCAG	2	10	1636478	1636487	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5047	NC_016901	GAC	2	6	1636562	1636567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_016901	A	6	6	1636573	1636578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_016901	GAG	2	6	1636651	1636656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_016901	ATG	2	6	1636724	1636729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_016901	ATA	2	6	1636823	1636828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_016901	GCC	2	6	1636858	1636863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5053	NC_016901	GTA	2	6	1636912	1636917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_016901	CCG	2	6	1636943	1636948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5055	NC_016901	TTA	2	6	1637059	1637064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_016901	TAT	2	6	1637078	1637083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_016901	ATTA	2	8	1637094	1637101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_016901	GCTT	2	8	1637158	1637165	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5059	NC_016901	A	6	6	1637201	1637206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_016901	A	6	6	1637212	1637217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_016901	TGA	2	6	1637218	1637223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_016901	TGA	2	6	1637301	1637306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_016901	T	6	6	1637431	1637436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_016901	T	6	6	1638838	1638843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_016901	TGA	2	6	1638852	1638857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_016901	AAG	2	6	1638874	1638879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_016901	AT	3	6	1638914	1638919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_016901	GAT	2	6	1639084	1639089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_016901	GCGG	2	8	1639143	1639150	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5070	NC_016901	T	6	6	1639151	1639156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_016901	TCG	2	6	1639214	1639219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_016901	CTCG	2	8	1639246	1639253	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5073	NC_016901	TTG	2	6	1640804	1640809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_016901	AAC	2	6	1640811	1640816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_016901	T	6	6	1640828	1640833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_016901	T	6	6	1640869	1640874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_016901	TAA	2	6	1640903	1640908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_016901	TGT	2	6	1640954	1640959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_016901	TAGT	2	8	1640970	1640977	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_016901	GTT	2	6	1641001	1641006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_016901	CGC	2	6	1641423	1641428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5082	NC_016901	ATT	2	6	1641980	1641985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_016901	CTGGC	2	10	1641988	1641997	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5084	NC_016901	ATGTC	2	10	1642009	1642018	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5085	NC_016901	ATCA	2	8	1642048	1642055	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5086	NC_016901	TGGG	2	8	1642073	1642080	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_016901	T	6	6	1642099	1642104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_016901	TGT	2	6	1642213	1642218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_016901	ATGG	2	8	1642228	1642235	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_016901	GCC	2	6	1644003	1644008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5091	NC_016901	TCTT	2	8	1646815	1646822	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5092	NC_016901	CA	3	6	1646863	1646868	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5093	NC_016901	T	6	6	1646946	1646951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_016901	TAT	2	6	1646992	1646997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_016901	TCT	2	6	1647059	1647064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_016901	CT	3	6	1649919	1649924	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5097	NC_016901	GCC	2	6	1649945	1649950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5098	NC_016901	GTCT	2	8	1651640	1651647	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5099	NC_016901	TAT	2	6	1651648	1651653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_016901	CAG	2	6	1651706	1651711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_016901	TGTGT	2	10	1651745	1651754	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_016901	ATC	2	6	1651792	1651797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_016901	GCT	2	6	1651801	1651806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_016901	TGC	2	6	1651828	1651833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_016901	TC	3	6	1651842	1651847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5106	NC_016901	TATC	2	8	1651856	1651863	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5107	NC_016901	TTA	2	6	1651939	1651944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_016901	ATT	2	6	1651975	1651980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_016901	ATTT	2	8	1651996	1652003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_016901	T	7	7	1652024	1652030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_016901	GTT	3	9	1652107	1652115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_016901	T	6	6	1652128	1652133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_016901	GGT	2	6	1652142	1652147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_016901	T	6	6	1652147	1652152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_016901	TGG	2	6	1652179	1652184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_016901	TTAA	2	8	1652208	1652215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_016901	GC	3	6	1652280	1652285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5118	NC_016901	GAT	2	6	1652296	1652301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_016901	ATT	2	6	1652362	1652367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_016901	TAA	2	6	1652404	1652409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_016901	GATG	2	8	1652470	1652477	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_016901	TTTA	2	8	1652492	1652499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_016901	TCAC	2	8	1652514	1652521	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5124	NC_016901	TAT	2	6	1652522	1652527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_016901	TCT	2	6	1652538	1652543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_016901	GCC	2	6	1652552	1652557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5127	NC_016901	A	6	6	1652583	1652588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_016901	TAAT	2	8	1652621	1652628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_016901	T	6	6	1655194	1655199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_016901	ACCAT	2	10	1655236	1655245	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5131	NC_016901	TGT	2	6	1655397	1655402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_016901	GCTT	2	8	1655431	1655438	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5252	NC_016901	TCAA	2	8	1695251	1695258	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5253	NC_016901	AAAAC	2	10	1695304	1695313	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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