MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS678 chromosome

Total Repeats: 15458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016901	TCAT	2	8	1424261	1424268	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4502	NC_016901	CAT	2	6	1424305	1424310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_016901	CAT	2	6	1427244	1427249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_016901	CGCTT	2	10	1427251	1427260	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4505	NC_016901	ATT	2	6	1427314	1427319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_016901	CAAA	2	8	1427335	1427342	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4507	NC_016901	ATT	2	6	1427349	1427354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_016901	AAT	2	6	1427412	1427417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_016901	AAC	2	6	1427437	1427442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_016901	ATC	2	6	1428731	1428736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_016901	AAG	2	6	1428743	1428748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_016901	CGG	2	6	1431597	1431602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_016901	T	6	6	1431605	1431610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_016901	GAA	2	6	1432788	1432793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_016901	TGA	2	6	1432815	1432820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_016901	AGC	2	6	1432939	1432944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_016901	TTA	2	6	1432946	1432951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_016901	AAGTG	2	10	1433142	1433151	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_016901	A	6	6	1433154	1433159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_016901	GCTT	2	8	1434784	1434791	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4521	NC_016901	TTG	2	6	1434798	1434803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_016901	TGA	2	6	1434892	1434897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_016901	TG	3	6	1434905	1434910	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_016901	GTC	2	6	1434975	1434980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_016901	TTG	2	6	1439110	1439115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_016901	TTG	2	6	1440803	1440808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_016901	TATT	2	8	1440894	1440901	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_016901	CTG	2	6	1440943	1440948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_016901	CT	3	6	1444063	1444068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4530	NC_016901	TTATT	2	10	1444186	1444195	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_016901	T	6	6	1444212	1444217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_016901	ATG	2	6	1444283	1444288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_016901	G	6	6	1444303	1444308	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_016901	TGA	2	6	1444320	1444325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_016901	GAT	2	6	1444392	1444397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_016901	ATC	2	6	1445717	1445722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_016901	AG	3	6	1448533	1448538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_016901	AAG	2	6	1448681	1448686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_016901	ATTA	2	8	1450030	1450037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_016901	ACG	2	6	1450042	1450047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_016901	GT	3	6	1450074	1450079	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_016901	ATTTT	2	10	1450088	1450097	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_016901	T	6	6	1450094	1450099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_016901	GAC	2	6	1452809	1452814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_016901	TAA	2	6	1452835	1452840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_016901	TGT	2	6	1452867	1452872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_016901	AT	3	6	1452953	1452958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_016901	ATTT	2	8	1453919	1453926	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_016901	T	7	7	1453937	1453943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_016901	ATA	2	6	1454062	1454067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_016901	TGT	2	6	1456277	1456282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_016901	AGCG	2	8	1456361	1456368	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4553	NC_016901	GAT	2	6	1456394	1456399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_016901	A	6	6	1456424	1456429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_016901	T	6	6	1456448	1456453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_016901	GTG	2	6	1456464	1456469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_016901	GGA	2	6	1456572	1456577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_016901	CTTA	2	8	1456589	1456596	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4559	NC_016901	TCG	2	6	1456673	1456678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_016901	GCC	2	6	1456719	1456724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4561	NC_016901	ATC	2	6	1458637	1458642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_016901	ACG	2	6	1458663	1458668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_016901	AAAC	2	8	1460525	1460532	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4564	NC_016901	GTT	2	6	1461265	1461270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_016901	TGA	2	6	1461445	1461450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_016901	A	6	6	1462508	1462513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_016901	T	6	6	1462531	1462536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_016901	TAT	2	6	1463206	1463211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_016901	CAA	2	6	1463216	1463221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_016901	AGA	2	6	1463373	1463378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_016901	TAG	2	6	1463424	1463429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_016901	AGTT	2	8	1463432	1463439	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_016901	TTGA	2	8	1463824	1463831	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_016901	CAT	2	6	1465207	1465212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_016901	ATA	2	6	1465219	1465224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_016901	AAT	2	6	1465225	1465230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_016901	TTTTTG	2	12	1465252	1465263	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_016901	TGT	2	6	1466270	1466275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_016901	TTA	2	6	1466301	1466306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_016901	ACT	2	6	1466346	1466351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_016901	CTTTT	2	10	1466394	1466403	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4582	NC_016901	A	6	6	1466427	1466432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_016901	T	6	6	1466436	1466441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_016901	TAA	2	6	1466499	1466504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_016901	TTAA	2	8	1466513	1466520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_016901	G	6	6	1466579	1466584	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_016901	TAG	2	6	1466637	1466642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_016901	A	7	7	1466683	1466689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_016901	TCTT	2	8	1466719	1466726	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4590	NC_016901	A	6	6	1467044	1467049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_016901	T	8	8	1467171	1467178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_016901	T	7	7	1467185	1467191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_016901	AGG	2	6	1467221	1467226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_016901	GATA	2	8	1468578	1468585	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_016901	GTC	2	6	1468588	1468593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_016901	GAT	2	6	1468690	1468695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_016901	TGG	2	6	1468696	1468701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_016901	CAA	2	6	1471505	1471510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_016901	T	6	6	1471578	1471583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_016901	TAA	2	6	1471589	1471594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_016901	CTG	2	6	1472865	1472870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_016901	CTG	2	6	1473006	1473011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_016901	TA	3	6	1473055	1473060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_016901	TTTGA	2	10	1473100	1473109	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_016901	CAGT	2	8	1473149	1473156	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4606	NC_016901	AATT	2	8	1473170	1473177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_016901	TGT	2	6	1473377	1473382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_016901	TAAA	2	8	1473603	1473610	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_016901	TAA	2	6	1473643	1473648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_016901	GCC	2	6	1476224	1476229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4611	NC_016901	TTA	2	6	1476302	1476307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_016901	TTGTA	2	10	1478054	1478063	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_016901	TA	3	6	1478093	1478098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_016901	GTGAG	2	10	1479288	1479297	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_016901	A	6	6	1479301	1479306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_016901	TTG	2	6	1479327	1479332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_016901	TAC	2	6	1479347	1479352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_016901	TGT	2	6	1480248	1480253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_016901	AAC	2	6	1480333	1480338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_016901	TGT	2	6	1480355	1480360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_016901	TAT	2	6	1481085	1481090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_016901	TTGT	2	8	1481102	1481109	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_016901	TGAG	2	8	1481161	1481168	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_016901	CG	4	8	1481175	1481182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4625	NC_016901	CAG	2	6	1481201	1481206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_016901	GTT	2	6	1481247	1481252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_016901	GTT	2	6	1481314	1481319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_016901	TAA	2	6	1481353	1481358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_016901	TCCG	2	8	1482622	1482629	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4630	NC_016901	AAT	2	6	1484069	1484074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4632	NC_016901	TGG	2	6	1484101	1484106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4899	NC_016901	TTA	2	6	1590485	1590490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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