MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 plasmid pSTUK-100

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016864	GTTGA	2	10	14375	14384	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016864	TAATG	2	10	19256	19265	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016864	GTCTG	2	10	20498	20507	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_016864	TATAA	2	10	21405	21414	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016864	GGACG	2	10	23339	23348	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_016864	ACGGG	2	10	29837	29846	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016864	ACGGG	2	10	31014	31023	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_016864	GAACT	2	10	32237	32246	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_016864	GGCCT	2	10	32539	32548	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_016864	GAACA	2	10	36085	36094	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_016864	GAACT	2	10	40419	40428	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_016864	CCCCG	2	10	40458	40467	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
13	NC_016864	AAAAT	2	10	41363	41372	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016864	TAATT	2	10	42544	42553	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016864	ATTTC	2	10	65816	65825	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_016864	ACTGG	2	10	76566	76575	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_016864	TCGTC	2	10	77273	77282	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_016864	ACCAC	2	10	80493	80502	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NC_016864	ATGTT	2	10	80562	80571	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016864	GCTCC	2	10	80606	80615	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_016864	AATTT	2	10	89745	89754	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016864	TGCAA	2	10	90548	90557	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_016864	GGCCC	2	10	91137	91146	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
24	NC_016864	GCCGT	2	10	91957	91966	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_016864	TGACA	2	10	92017	92026	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.