MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 13251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016863	GAA	2	6	1486339	1486344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_016863	TCT	2	6	1486396	1486401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_016863	A	6	6	1486442	1486447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_016863	GATA	2	8	1486559	1486566	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_016863	T	6	6	1486570	1486575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_016863	A	7	7	1486582	1486588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_016863	TGAT	2	8	1486653	1486660	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_016863	GC	3	6	1486691	1486696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4009	NC_016863	GACG	2	8	1486703	1486710	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4010	NC_016863	A	6	6	1493112	1493117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_016863	GCC	2	6	1493118	1493123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_016863	TAT	2	6	1493124	1493129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_016863	ACA	2	6	1493150	1493155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_016863	TCT	2	6	1493615	1493620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_016863	AGT	2	6	1493953	1493958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_016863	A	6	6	1493966	1493971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_016863	ACA	2	6	1494086	1494091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_016863	T	8	8	1494127	1494134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_016863	C	6	6	1494159	1494164	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4020	NC_016863	CTT	2	6	1494218	1494223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_016863	TGG	2	6	1494245	1494250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_016863	ATT	2	6	1494339	1494344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_016863	GAC	2	6	1494345	1494350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_016863	AGGG	2	8	1494416	1494423	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_016863	GA	3	6	1495632	1495637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_016863	TAA	2	6	1496681	1496686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_016863	TAC	2	6	1496702	1496707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_016863	C	6	6	1496861	1496866	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4029	NC_016863	CGGTG	2	10	1496889	1496898	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4030	NC_016863	CCTT	2	8	1497024	1497031	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4031	NC_016863	TCA	2	6	1497047	1497052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_016863	G	6	6	1497200	1497205	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_016863	GCC	2	6	1497238	1497243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4034	NC_016863	ACG	2	6	1497252	1497257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_016863	CGT	2	6	1497319	1497324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_016863	GGA	2	6	1498920	1498925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_016863	GTT	2	6	1498955	1498960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_016863	A	6	6	1498961	1498966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_016863	A	6	6	1500261	1500266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_016863	CGC	2	6	1502004	1502009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4041	NC_016863	GTTGT	2	10	1502079	1502088	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_016863	TCA	2	6	1502142	1502147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_016863	TCAC	2	8	1504502	1504509	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4044	NC_016863	ACA	2	6	1504517	1504522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_016863	CGC	2	6	1504546	1504551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4046	NC_016863	CG	3	6	1505909	1505914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4047	NC_016863	TGG	2	6	1505945	1505950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_016863	AG	3	6	1507722	1507727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_016863	GGT	2	6	1507783	1507788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_016863	A	6	6	1507793	1507798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_016863	CCG	2	6	1507806	1507811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4052	NC_016863	CGG	2	6	1507815	1507820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_016863	GAA	2	6	1507827	1507832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_016863	ACTTA	2	10	1508994	1509003	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4055	NC_016863	AAT	2	6	1509058	1509063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_016863	ATT	2	6	1509064	1509069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_016863	TTA	2	6	1509097	1509102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_016863	AT	3	6	1509132	1509137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_016863	AT	3	6	1509147	1509152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_016863	TTA	2	6	1509156	1509161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_016863	ATGT	2	8	1509169	1509176	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_016863	A	6	6	1509202	1509207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_016863	GCG	2	6	1509220	1509225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_016863	T	7	7	1509266	1509272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_016863	TAA	2	6	1509331	1509336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_016863	TAA	2	6	1509352	1509357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_016863	T	6	6	1509385	1509390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_016863	TGA	2	6	1509403	1509408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_016863	TGT	2	6	1510286	1510291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_016863	GAA	2	6	1512122	1512127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_016863	ATT	2	6	1512130	1512135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_016863	GA	3	6	1512187	1512192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_016863	A	6	6	1512231	1512236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_016863	GGC	2	6	1512299	1512304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_016863	GCC	2	6	1512354	1512359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4076	NC_016863	CG	3	6	1512385	1512390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4077	NC_016863	AAT	2	6	1513341	1513346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_016863	ATT	2	6	1513402	1513407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_016863	TGA	2	6	1513469	1513474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_016863	A	7	7	1513495	1513501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_016863	GCTAA	2	10	1513515	1513524	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4082	NC_016863	TAA	2	6	1513540	1513545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_016863	TTAAT	2	10	1513547	1513556	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_016863	ATG	2	6	1513586	1513591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_016863	GCT	2	6	1513651	1513656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_016863	A	6	6	1513692	1513697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_016863	T	6	6	1513703	1513708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_016863	AG	3	6	1513745	1513750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_016863	CTG	2	6	1513768	1513773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_016863	CAT	2	6	1513831	1513836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_016863	GCG	2	6	1516805	1516810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_016863	TTG	2	6	1516859	1516864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_016863	TTC	2	6	1516913	1516918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_016863	GCC	2	6	1516923	1516928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4095	NC_016863	TGTA	2	8	1516952	1516959	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_016863	AAT	3	9	1518031	1518039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_016863	GTCG	2	8	1518045	1518052	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4098	NC_016863	AAG	2	6	1518086	1518091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_016863	ATC	2	6	1518160	1518165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_016863	T	6	6	1518226	1518231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_016863	CCT	2	6	1518258	1518263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4102	NC_016863	AGC	2	6	1518282	1518287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_016863	TC	3	6	1518308	1518313	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4104	NC_016863	ATTTT	2	10	1518352	1518361	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_016863	T	6	6	1518358	1518363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_016863	TGC	2	6	1518368	1518373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_016863	GCA	2	6	1518376	1518381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_016863	GGTT	2	8	1519111	1519118	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_016863	TGG	2	6	1519968	1519973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_016863	ATT	2	6	1519983	1519988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_016863	AAC	2	6	1519989	1519994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_016863	TAC	2	6	1520005	1520010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_016863	T	6	6	1520139	1520144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_016863	GGC	2	6	1520157	1520162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_016863	GC	3	6	1520205	1520210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4116	NC_016863	GCA	2	6	1520212	1520217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_016863	GTGA	2	8	1520558	1520565	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_016863	ATA	2	6	1520625	1520630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_016863	GGT	2	6	1520728	1520733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_016863	ATT	2	6	1520859	1520864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_016863	AT	3	6	1522209	1522214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_016863	CA	3	6	1523228	1523233	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4123	NC_016863	ATT	2	6	1523235	1523240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_016863	T	6	6	1524493	1524498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_016863	TGT	2	6	1524502	1524507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_016863	TAT	2	6	1524568	1524573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_016863	ATA	2	6	1526634	1526639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_016863	AAT	2	6	1526648	1526653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_016863	CGG	2	6	1526681	1526686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_016863	TTAT	2	8	1529416	1529423	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_016863	GT	3	6	1530143	1530148	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_016863	GTT	2	6	1530190	1530195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_016863	GA	3	6	1530405	1530410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_016863	CGCA	2	8	1531088	1531095	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4135	NC_016863	A	6	6	1535044	1535049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_016863	GGC	2	6	1535115	1535120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4139	NC_016863	ATT	2	6	1537612	1537617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4152	NC_016863	GTT	2	6	1549908	1549913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4256	NC_016863	AAT	2	6	1586042	1586047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4259	NC_016863	TCC	2	6	1587482	1587487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4263	NC_016863	TCCCT	2	10	1587949	1587958	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4264	NC_016863	GCA	2	6	1588018	1588023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4266	NC_016863	A	7	7	1588040	1588046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4386	NC_016863	A	6	6	1611849	1611854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4387	NC_016863	TTG	2	6	1611967	1611972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4389	NC_016863	GATATT	2	12	1612834	1612845	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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4391	NC_016863	TAATG	2	10	1613002	1613011	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4392	NC_016863	AT	3	6	1613030	1613035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4393	NC_016863	TTA	2	6	1613058	1613063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4394	NC_016863	ATA	2	6	1613070	1613075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4395	NC_016863	TAC	2	6	1613085	1613090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4396	NC_016863	AT	3	6	1613132	1613137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4397	NC_016863	TTA	2	6	1613139	1613144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4399	NC_016863	AAT	2	6	1613208	1613213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4400	NC_016863	TTA	2	6	1613231	1613236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4401	NC_016863	ATT	2	6	1613333	1613338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4402	NC_016863	TGT	2	6	1614434	1614439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4423	NC_016863	TCAA	2	8	1628373	1628380	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4500	NC_016863	A	7	7	1656488	1656494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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