MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 13251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016863	GTA	2	6	1151635	1151640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_016863	ATG	2	6	1154938	1154943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_016863	ATT	2	6	1154999	1155004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_016863	T	6	6	1155003	1155008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_016863	ACT	2	6	1155015	1155020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_016863	GAT	2	6	1155049	1155054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_016863	CTC	2	6	1155164	1155169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3008	NC_016863	A	6	6	1155202	1155207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_016863	AGT	2	6	1155284	1155289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_016863	T	6	6	1155782	1155787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_016863	T	6	6	1155811	1155816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_016863	TTAT	2	8	1155823	1155830	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_016863	GTG	2	6	1155880	1155885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_016863	ATT	2	6	1155921	1155926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_016863	TGT	2	6	1155941	1155946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_016863	TTAT	2	8	1155952	1155959	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_016863	AG	3	6	1156030	1156035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_016863	AT	3	6	1156053	1156058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_016863	A	6	6	1156108	1156113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_016863	TTTA	2	8	1156133	1156140	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_016863	GAT	2	6	1156144	1156149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_016863	TTC	2	6	1156221	1156226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_016863	TAT	2	6	1156258	1156263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_016863	CAT	2	6	1157557	1157562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_016863	ATAC	2	8	1157575	1157582	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3026	NC_016863	GTT	2	6	1157678	1157683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_016863	GC	3	6	1157705	1157710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3028	NC_016863	A	6	6	1158193	1158198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_016863	AAC	2	6	1161315	1161320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_016863	TCC	2	6	1162843	1162848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3031	NC_016863	TAC	2	6	1163458	1163463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_016863	GT	3	6	1163480	1163485	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_016863	AAT	2	6	1163565	1163570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_016863	TTG	2	6	1163585	1163590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_016863	TTAT	2	8	1163641	1163648	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_016863	TTA	2	6	1163658	1163663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_016863	CTA	2	6	1163711	1163716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_016863	TGA	2	6	1163755	1163760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_016863	GAG	2	6	1163780	1163785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_016863	CTC	2	6	1163789	1163794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3041	NC_016863	ATG	2	6	1163809	1163814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_016863	CCG	3	9	1164063	1164071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3043	NC_016863	CGG	2	6	1164078	1164083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_016863	T	7	7	1164084	1164090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_016863	TTAA	2	8	1165216	1165223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_016863	CCA	2	6	1169250	1169255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3047	NC_016863	ATGA	2	8	1169309	1169316	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_016863	A	7	7	1169323	1169329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_016863	ATTT	2	8	1169363	1169370	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_016863	A	6	6	1169409	1169414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_016863	GA	3	6	1169418	1169423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_016863	GT	3	6	1169476	1169481	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_016863	ACC	2	6	1169499	1169504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3054	NC_016863	AATA	2	8	1169592	1169599	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_016863	ATT	2	6	1171142	1171147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_016863	GGC	2	6	1171169	1171174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_016863	CGCC	2	8	1171181	1171188	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3058	NC_016863	ACTA	2	8	1171310	1171317	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3059	NC_016863	AT	3	6	1171321	1171326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_016863	ATAA	2	8	1171431	1171438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_016863	GA	3	6	1171456	1171461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_016863	ATT	2	6	1171472	1171477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_016863	TA	3	6	1171490	1171495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_016863	T	6	6	1171560	1171565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_016863	AAT	2	6	1171582	1171587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_016863	AAT	2	6	1171623	1171628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_016863	AT	3	6	1171649	1171654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_016863	ATT	2	6	1171661	1171666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_016863	TGT	2	6	1171676	1171681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_016863	TAG	2	6	1171685	1171690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_016863	TCAC	2	8	1171720	1171727	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3072	NC_016863	AGT	2	6	1171775	1171780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_016863	ACA	2	6	1171782	1171787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_016863	TC	4	8	1171802	1171809	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3075	NC_016863	GGT	3	9	1171811	1171819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_016863	TCA	2	6	1171839	1171844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_016863	GTG	2	6	1171878	1171883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_016863	GT	3	6	1171893	1171898	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_016863	CGT	2	6	1171901	1171906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_016863	AAGC	2	8	1171913	1171920	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3081	NC_016863	CAG	2	6	1172861	1172866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_016863	A	6	6	1172877	1172882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_016863	CAGAG	2	10	1173844	1173853	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3084	NC_016863	A	7	7	1173874	1173880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_016863	GTAA	2	8	1173888	1173895	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_016863	AGG	2	6	1173896	1173901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_016863	GC	3	6	1173979	1173984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3088	NC_016863	CG	3	6	1174026	1174031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3089	NC_016863	CAT	2	6	1175637	1175642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_016863	ACGAT	2	10	1175647	1175656	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3091	NC_016863	CCA	2	6	1175732	1175737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3092	NC_016863	ATT	2	6	1175841	1175846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_016863	ATT	2	6	1175855	1175860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_016863	TTTTC	2	10	1175896	1175905	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3095	NC_016863	TA	3	6	1176603	1176608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_016863	TATGT	2	10	1176629	1176638	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_016863	TGTT	2	8	1176698	1176705	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_016863	ATTC	2	8	1176764	1176771	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3099	NC_016863	GCA	2	6	1176777	1176782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_016863	TTA	2	6	1176792	1176797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_016863	TTG	2	6	1176880	1176885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_016863	TATT	2	8	1176886	1176893	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_016863	ATT	2	6	1176995	1177000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_016863	TGTCAT	2	12	1177021	1177032	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3105	NC_016863	ATG	2	6	1177062	1177067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_016863	TTC	2	6	1177088	1177093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_016863	T	6	6	1178257	1178262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_016863	TGA	2	6	1178284	1178289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_016863	GAT	2	6	1179125	1179130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_016863	AATT	2	8	1179227	1179234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_016863	TGG	2	6	1181689	1181694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_016863	GCGCT	2	10	1181710	1181719	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3113	NC_016863	GCC	2	6	1181752	1181757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3114	NC_016863	G	7	7	1181835	1181841	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_016863	TCG	2	6	1181885	1181890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_016863	CGGT	2	8	1181924	1181931	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3117	NC_016863	C	6	6	1181941	1181946	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3118	NC_016863	G	7	7	1182019	1182025	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_016863	TCG	2	6	1182069	1182074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_016863	CGGT	2	8	1182108	1182115	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3121	NC_016863	C	6	6	1182125	1182130	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3122	NC_016863	G	7	7	1182203	1182209	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_016863	AC	3	6	1182237	1182242	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3124	NC_016863	TCAA	2	8	1182341	1182348	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3125	NC_016863	T	6	6	1182350	1182355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_016863	A	8	8	1182357	1182364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_016863	CCA	2	6	1182383	1182388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3128	NC_016863	TAA	2	6	1182400	1182405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_016863	T	7	7	1182417	1182423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_016863	TGC	2	6	1182446	1182451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_016863	A	6	6	1183486	1183491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_016863	GA	3	6	1183532	1183537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_016863	CAT	2	6	1184893	1184898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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