MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 13251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016863	CA	3	6	611671	611676	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_016863	AAT	2	6	611684	611689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_016863	TAA	2	6	611733	611738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_016863	CAA	2	6	611763	611768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_016863	A	6	6	611767	611772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_016863	GTG	2	6	611896	611901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_016863	AGT	2	6	611929	611934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_016863	TGT	2	6	611941	611946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_016863	ATA	2	6	611961	611966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_016863	TAA	2	6	611997	612002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_016863	GAG	2	6	612037	612042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_016863	A	7	7	612062	612068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_016863	A	6	6	612155	612160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_016863	CTC	2	6	613242	613247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1515	NC_016863	ATG	2	6	613257	613262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_016863	AT	3	6	613268	613273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_016863	CAT	2	6	613307	613312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_016863	A	7	7	613325	613331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_016863	ATT	2	6	613354	613359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_016863	A	7	7	613997	614003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_016863	TGAT	2	8	614047	614054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_016863	GGC	2	6	614067	614072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_016863	CTTCA	2	10	614238	614247	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1524	NC_016863	TGA	2	6	614505	614510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_016863	GCTC	2	8	614542	614549	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_016863	TC	3	6	614616	614621	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_016863	ACG	2	6	614705	614710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_016863	TCAT	2	8	614819	614826	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1529	NC_016863	T	7	7	614858	614864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_016863	CT	3	6	615117	615122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1531	NC_016863	TGG	2	6	615265	615270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_016863	T	6	6	615366	615371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_016863	CTT	2	6	615393	615398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_016863	CGC	2	6	615448	615453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1535	NC_016863	TGG	2	6	615465	615470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_016863	ATTA	2	8	615479	615486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_016863	AAT	2	6	618487	618492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_016863	TTA	2	6	618525	618530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_016863	GTT	2	6	618538	618543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_016863	AGT	2	6	618572	618577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_016863	AC	3	6	618594	618599	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1542	NC_016863	GTA	2	6	618661	618666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_016863	TTG	2	6	618677	618682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_016863	GC	3	6	618742	618747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1545	NC_016863	GCG	3	9	618787	618795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_016863	CTC	2	6	618865	618870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1547	NC_016863	ATT	2	6	618901	618906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_016863	GTC	2	6	618940	618945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_016863	TCA	2	6	619041	619046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_016863	A	7	7	619114	619120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_016863	TAA	2	6	619172	619177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_016863	ATA	2	6	619183	619188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_016863	GTT	2	6	619194	619199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_016863	ATT	2	6	619238	619243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_016863	CAG	2	6	619632	619637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_016863	GCG	2	6	619917	619922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_016863	ATTT	2	8	620822	620829	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_016863	ACC	2	6	620908	620913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_016863	A	6	6	620931	620936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_016863	T	6	6	620961	620966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_016863	TTAT	2	8	620971	620978	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_016863	ATAA	2	8	622350	622357	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_016863	T	8	8	622379	622386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_016863	GAAA	2	8	622433	622440	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_016863	TAT	2	6	622462	622467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_016863	TCG	2	6	623342	623347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_016863	TGA	2	6	623377	623382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_016863	ATG	2	6	623383	623388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_016863	A	6	6	624639	624644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_016863	GC	3	6	624738	624743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_016863	CTTTT	2	10	624747	624756	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1572	NC_016863	T	7	7	624773	624779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_016863	TAACGT	2	12	624786	624797	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1574	NC_016863	T	6	6	626288	626293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_016863	TC	3	6	627578	627583	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1576	NC_016863	CAG	2	6	627593	627598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_016863	ATG	2	6	627602	627607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_016863	CTG	2	6	627609	627614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_016863	CGT	2	6	627727	627732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1581	NC_016863	TGAA	2	8	627781	627788	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_016863	CGT	2	6	627849	627854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_016863	CAA	2	6	627861	627866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_016863	AGGG	2	8	629866	629873	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_016863	CGTT	2	8	629881	629888	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1586	NC_016863	AGTA	2	8	629932	629939	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_016863	CGT	2	6	629968	629973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1589	NC_016863	GCC	2	6	632860	632865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1591	NC_016863	ATA	2	6	633910	633915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_016863	TAA	2	6	633924	633929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_016863	TCT	2	6	634981	634986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_016863	TTAT	2	8	637587	637594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_016863	A	6	6	637685	637690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_016863	TGGT	2	8	638384	638391	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1598	NC_016863	GGA	2	6	638443	638448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_016863	GTCGC	2	10	639469	639478	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1600	NC_016863	ACTC	2	8	639545	639552	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1601	NC_016863	TG	3	6	639624	639629	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_016863	TTA	2	6	639631	639636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_016863	TGCGG	2	10	639664	639673	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1604	NC_016863	TCCC	2	8	642219	642226	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1605	NC_016863	GAGG	2	8	642232	642239	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_016863	GTG	2	6	644567	644572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_016863	CG	3	6	644583	644588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1608	NC_016863	TGCAAA	2	12	644613	644624	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1609	NC_016863	AAT	2	6	644633	644638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_016863	AT	3	6	644646	644651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_016863	TA	3	6	644661	644666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_016863	ATA	2	6	644675	644680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_016863	GTT	2	6	650045	650050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_016863	ATA	2	6	650082	650087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_016863	ATT	2	6	650095	650100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_016863	T	6	6	650106	650111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_016863	TCA	2	6	651462	651467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_016863	TATC	2	8	654299	654306	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1619	NC_016863	A	7	7	654350	654356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_016863	TTA	2	6	656652	656657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_016863	ATA	2	6	656782	656787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_016863	ATT	2	6	656791	656796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_016863	AAG	2	6	656813	656818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_016863	GAA	2	6	656835	656840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_016863	TG	3	6	656862	656867	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_016863	CAA	2	6	656889	656894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_016863	TA	3	6	656919	656924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_016863	GGA	2	6	656938	656943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_016863	AG	3	6	659751	659756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_016863	GCA	2	6	661809	661814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_016863	GAA	2	6	661820	661825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_016863	TGTAA	2	10	661847	661856	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_016863	A	6	6	661855	661860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_016863	TGT	3	9	661884	661892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_016863	GTT	2	6	661893	661898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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