MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 13251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016863	GCG	2	6	200753	200758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_016863	TTA	2	6	200759	200764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_016863	ATT	2	6	202126	202131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016863	AT	3	6	202138	202143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_016863	AAGT	2	8	202160	202167	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016863	GCTTC	2	10	203902	203911	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
507	NC_016863	TGA	2	6	208331	208336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016863	CCA	2	6	208369	208374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_016863	GAT	2	6	209022	209027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016863	GAA	2	6	209039	209044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_016863	AT	4	8	209078	209085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_016863	ATT	2	6	209093	209098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_016863	GTTT	2	8	209108	209115	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
514	NC_016863	GCT	2	6	209162	209167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_016863	AAT	2	6	209180	209185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_016863	T	7	7	209191	209197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_016863	A	6	6	209202	209207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_016863	GT	3	6	209222	209227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
519	NC_016863	A	7	7	209236	209242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_016863	CAT	2	6	209251	209256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_016863	GGA	2	6	209275	209280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_016863	GAC	2	6	209739	209744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_016863	T	6	6	209766	209771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_016863	CTT	2	6	211408	211413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_016863	TGA	2	6	212376	212381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_016863	GCGCT	2	10	212394	212403	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
527	NC_016863	CGCGT	2	10	212446	212455	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
528	NC_016863	G	6	6	213326	213331	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
529	NC_016863	TAA	2	6	215291	215296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016863	AG	3	6	215341	215346	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
531	NC_016863	CAT	2	6	215368	215373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_016863	CGC	2	6	215377	215382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_016863	AACG	2	8	216381	216388	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
534	NC_016863	ACGC	2	8	216982	216989	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
535	NC_016863	TAA	2	6	217002	217007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_016863	GA	3	6	220841	220846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
537	NC_016863	TCT	3	9	220849	220857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_016863	GTC	2	6	220858	220863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_016863	GAA	2	6	220869	220874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_016863	TCC	2	6	223548	223553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_016863	ATAA	2	8	223554	223561	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_016863	TTA	2	6	223576	223581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_016863	CCTT	2	8	223584	223591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
544	NC_016863	CGA	2	6	223651	223656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_016863	TGC	2	6	223671	223676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_016863	TAA	3	9	223682	223690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_016863	TCA	2	6	223716	223721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_016863	CAATAT	2	12	229775	229786	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
549	NC_016863	CTGTC	2	10	229842	229851	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
550	NC_016863	AAG	2	6	229888	229893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_016863	GC	3	6	229937	229942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
552	NC_016863	TGA	2	6	229995	230000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_016863	AAT	2	6	230023	230028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_016863	TAA	3	9	230117	230125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_016863	ATA	2	6	230146	230151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_016863	ATT	2	6	230156	230161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_016863	T	6	6	230160	230165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_016863	TAA	2	6	230173	230178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_016863	A	6	6	230177	230182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_016863	AAAT	2	8	230194	230201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_016863	A	8	8	230220	230227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_016863	T	6	6	230240	230245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_016863	T	8	8	230247	230254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_016863	AAAT	2	8	230272	230279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_016863	TA	3	6	230295	230300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_016863	T	7	7	230322	230328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_016863	T	7	7	230351	230357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_016863	CTTG	2	8	230369	230376	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
569	NC_016863	TTTG	2	8	230378	230385	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
570	NC_016863	T	6	6	230386	230391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_016863	TAT	2	6	230408	230413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_016863	TAAA	2	8	230432	230439	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_016863	A	6	6	230437	230442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_016863	TTAT	2	8	230494	230501	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_016863	GTT	2	6	230508	230513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_016863	CTT	2	6	230516	230521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_016863	ATATA	2	10	230555	230564	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_016863	CTA	2	6	230568	230573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_016863	TG	3	6	230603	230608	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
580	NC_016863	TAA	2	6	230636	230641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_016863	ATC	2	6	231219	231224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_016863	GAT	2	6	231244	231249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_016863	A	7	7	231259	231265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_016863	TA	3	6	231271	231276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_016863	A	8	8	237144	237151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_016863	GGC	2	6	237158	237163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_016863	GTT	2	6	237183	237188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_016863	TCT	2	6	238647	238652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_016863	C	6	6	245964	245969	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
590	NC_016863	TGCTC	2	10	246042	246051	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
591	NC_016863	AGG	2	6	246054	246059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_016863	CGG	2	6	247226	247231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_016863	AT	3	6	247257	247262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_016863	AC	3	6	247302	247307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
595	NC_016863	TCA	2	6	247709	247714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_016863	AAT	2	6	247729	247734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_016863	CCA	2	6	247756	247761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_016863	A	7	7	247770	247776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_016863	AGA	2	6	247791	247796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_016863	GCG	2	6	247824	247829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_016863	G	6	6	249252	249257	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
602	NC_016863	ATAA	2	8	250123	250130	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_016863	CT	3	6	252950	252955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
604	NC_016863	GCC	2	6	252957	252962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_016863	GAT	2	6	253860	253865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_016863	AAT	2	6	253872	253877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_016863	TCAG	2	8	253900	253907	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
608	NC_016863	T	6	6	253976	253981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_016863	ACTG	2	8	253992	253999	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
610	NC_016863	TGC	2	6	254028	254033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_016863	CAA	2	6	254078	254083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_016863	GC	3	6	254117	254122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
613	NC_016863	AC	3	6	254148	254153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
614	NC_016863	AAC	2	6	254186	254191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_016863	AC	4	8	254190	254197	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
616	NC_016863	GGC	2	6	255057	255062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_016863	GTA	2	6	255170	255175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_016863	GAG	2	6	256132	256137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
619	NC_016863	CTT	2	6	256152	256157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_016863	CT	3	6	256165	256170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
621	NC_016863	GAAA	2	8	256260	256267	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
622	NC_016863	TTA	2	6	257043	257048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_016863	TG	3	6	257093	257098	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
624	NC_016863	GTCTG	2	10	257102	257111	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
625	NC_016863	GTG	2	6	257749	257754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
626	NC_016863	AGA	2	6	257770	257775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_016863	GCG	2	6	257794	257799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_016863	AGA	2	6	259051	259056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_016863	T	6	6	259123	259128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_016863	T	6	6	259158	259163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_016863	CG	3	6	259252	259257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
632	NC_016863	A	6	6	259336	259341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_016863	TTAG	2	8	262346	262353	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
634	NC_016863	GAA	2	6	262354	262359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_016863	ATA	2	6	262363	262368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_016863	TTA	2	6	266489	266494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_016863	T	7	7	274040	274046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_016863	GCAG	2	8	274142	274149	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
639	NC_016863	T	6	6	275997	276002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_016863	GCGCT	2	10	279958	279967	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
641	NC_016863	CAC	2	6	280015	280020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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