MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 13251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016863	CAA	2	6	2095642	2095647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_016863	TGA	2	6	2095650	2095655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_016863	CCG	2	6	2095710	2095715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6004	NC_016863	CGG	2	6	2095762	2095767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_016863	A	7	7	2095855	2095861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_016863	ACT	2	6	2095988	2095993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_016863	CCTT	2	8	2096976	2096983	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6008	NC_016863	T	6	6	2097013	2097018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_016863	TAA	2	6	2098133	2098138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_016863	GTC	2	6	2111203	2111208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_016863	GGT	2	6	2113564	2113569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_016863	GTT	2	6	2113640	2113645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_016863	CAGG	2	8	2113658	2113665	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6014	NC_016863	TCT	2	6	2113666	2113671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_016863	TCC	2	6	2113681	2113686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6016	NC_016863	GTC	2	6	2113729	2113734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_016863	CAG	2	6	2113742	2113747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_016863	TAA	2	6	2113844	2113849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_016863	TAA	2	6	2113958	2113963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_016863	TCA	2	6	2113989	2113994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_016863	TAT	2	6	2114032	2114037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_016863	TTG	2	6	2114039	2114044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_016863	TTTC	2	8	2114078	2114085	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6024	NC_016863	AAACA	2	10	2115085	2115094	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6025	NC_016863	ATT	2	6	2115096	2115101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_016863	TTA	2	6	2115114	2115119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_016863	CAT	2	6	2115240	2115245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_016863	GCC	2	6	2116151	2116156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6029	NC_016863	TTG	2	6	2116163	2116168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_016863	AGC	2	6	2116238	2116243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_016863	CAT	2	6	2116245	2116250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_016863	ATA	2	6	2116286	2116291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_016863	ATA	2	6	2116399	2116404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_016863	AAT	2	6	2116412	2116417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_016863	AAT	2	6	2116427	2116432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_016863	ATT	2	6	2116497	2116502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_016863	TCT	2	6	2116545	2116550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_016863	TGG	2	6	2116887	2116892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_016863	AAC	2	6	2116935	2116940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_016863	GA	3	6	2116971	2116976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_016863	ACG	2	6	2132408	2132413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_016863	TAA	2	6	2132432	2132437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_016863	GATTCG	2	12	2133750	2133761	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6044	NC_016863	GCC	2	6	2133813	2133818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6045	NC_016863	AGC	2	6	2133939	2133944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_016863	ATTC	2	8	2133950	2133957	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6047	NC_016863	A	6	6	2135055	2135060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_016863	CGGA	2	8	2135099	2135106	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6049	NC_016863	TCCG	2	8	2135115	2135122	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6050	NC_016863	GT	4	8	2135752	2135759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_016863	AAAC	2	8	2136990	2136997	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6052	NC_016863	ATT	2	6	2137047	2137052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_016863	CTC	2	6	2138411	2138416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6054	NC_016863	CCT	2	6	2140700	2140705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6055	NC_016863	TTA	2	6	2140707	2140712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_016863	TAT	2	6	2140741	2140746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_016863	GTT	2	6	2140778	2140783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_016863	TTTTA	2	10	2140812	2140821	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_016863	AAT	2	6	2140865	2140870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_016863	CAG	2	6	2140871	2140876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_016863	AAC	2	6	2140885	2140890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_016863	TAA	2	6	2140931	2140936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_016863	ATT	2	6	2140953	2140958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_016863	TTCT	2	8	2140991	2140998	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6065	NC_016863	CCG	2	6	2141016	2141021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6066	NC_016863	ACCCG	2	10	2141100	2141109	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6067	NC_016863	ATG	2	6	2141165	2141170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_016863	GAAA	2	8	2141189	2141196	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_016863	ATG	2	6	2141292	2141297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_016863	T	6	6	2143739	2143744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_016863	AATCAG	2	12	2143791	2143802	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6072	NC_016863	TGA	2	6	2143860	2143865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_016863	CAA	2	6	2143910	2143915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_016863	CAAT	2	8	2143936	2143943	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6075	NC_016863	CATATA	2	12	2143973	2143984	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6076	NC_016863	CGC	2	6	2145485	2145490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6077	NC_016863	ACAA	2	8	2145513	2145520	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6078	NC_016863	A	6	6	2145519	2145524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_016863	ATA	2	6	2145558	2145563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_016863	CG	3	6	2145564	2145569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6081	NC_016863	A	6	6	2146967	2146972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_016863	ACA	2	6	2147000	2147005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_016863	TAAG	2	8	2147018	2147025	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_016863	TATC	2	8	2147026	2147033	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6085	NC_016863	ATG	2	6	2147063	2147068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_016863	A	7	7	2147079	2147085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_016863	T	6	6	2147120	2147125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_016863	GCG	2	6	2147130	2147135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_016863	A	6	6	2147185	2147190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_016863	GATT	2	8	2147206	2147213	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_016863	ACC	2	6	2148155	2148160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6092	NC_016863	TGAC	2	8	2149052	2149059	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6093	NC_016863	A	6	6	2149084	2149089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_016863	GCTT	2	8	2149092	2149099	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6095	NC_016863	ACC	2	6	2149184	2149189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6096	NC_016863	ATC	2	6	2149190	2149195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_016863	CAT	2	6	2149198	2149203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_016863	TG	3	6	2149225	2149230	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_016863	GTG	2	6	2149254	2149259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_016863	ATC	2	6	2149288	2149293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_016863	T	10	10	2149304	2149313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_016863	GC	3	6	2149315	2149320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6103	NC_016863	GCGCT	2	10	2150274	2150283	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6104	NC_016863	A	7	7	2156501	2156507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_016863	T	6	6	2156523	2156528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_016863	ACC	2	6	2156556	2156561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6107	NC_016863	AAG	2	6	2156570	2156575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_016863	CTAA	2	8	2157568	2157575	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6109	NC_016863	A	7	7	2157574	2157580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_016863	AT	3	6	2157615	2157620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_016863	ATT	2	6	2157649	2157654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_016863	ATC	2	6	2157671	2157676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_016863	TCA	2	6	2157682	2157687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_016863	ATG	2	6	2158903	2158908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_016863	TA	3	6	2158951	2158956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_016863	ATT	2	6	2159010	2159015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_016863	A	8	8	2159060	2159067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_016863	ATT	3	9	2160649	2160657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_016863	TAAA	2	8	2162137	2162144	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_016863	AAT	2	6	2167083	2167088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_016863	ATAA	2	8	2167096	2167103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_016863	TAA	2	6	2167134	2167139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_016863	AT	3	6	2167192	2167197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_016863	TAT	3	9	2167195	2167203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_016863	A	7	7	2167218	2167224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_016863	AGT	2	6	2167231	2167236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_016863	ATTT	2	8	2167249	2167256	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_016863	AT	4	8	2167257	2167264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_016863	AAAAG	2	10	2167284	2167293	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_016863	ATA	2	6	2167350	2167355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_016863	ACA	2	6	2169688	2169693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6132	NC_016863	ATTT	2	8	2169716	2169723	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_016863	TCAT	2	8	2176303	2176310	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6134	NC_016863	AATT	2	8	2178376	2178383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6135	NC_016863	AC	3	6	2178396	2178401	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6163	NC_016863	ACTCC	2	10	2202874	2202883	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6164	NC_016863	AT	3	6	2202902	2202907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6165	NC_016863	ATT	2	6	2202915	2202920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6256	NC_016863	T	6	6	2242359	2242364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6257	NC_016863	T	6	6	2242401	2242406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6258	NC_016863	TTA	2	6	2242508	2242513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6259	NC_016863	TTCA	2	8	2242531	2242538	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6260	NC_016863	AT	3	6	2242550	2242555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6261	NC_016863	A	6	6	2246807	2246812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6263	NC_016863	CGC	2	6	2246824	2246829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6401	NC_016863	ATCG	2	8	2309604	2309611	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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