MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 13251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016863	AAT	3	9	1951755	1951763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_016863	TGA	2	6	1951771	1951776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_016863	T	7	7	1951794	1951800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_016863	AACCT	2	10	1951808	1951817	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5505	NC_016863	CCT	2	6	1951830	1951835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5506	NC_016863	A	7	7	1951976	1951982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_016863	ACAA	2	8	1951994	1952001	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5508	NC_016863	TA	3	6	1952003	1952008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_016863	CTTTCA	2	12	1952055	1952066	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_016863	ATG	2	6	1952113	1952118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_016863	ATA	3	9	1952130	1952138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_016863	ATT	2	6	1952193	1952198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_016863	TAA	2	6	1952204	1952209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_016863	CCG	2	6	1953359	1953364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5515	NC_016863	A	7	7	1954134	1954140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_016863	GC	3	6	1954141	1954146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5517	NC_016863	GTT	2	6	1954612	1954617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_016863	CGC	2	6	1954631	1954636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5519	NC_016863	TGA	2	6	1954641	1954646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_016863	GCC	2	6	1954662	1954667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5521	NC_016863	ATG	2	6	1954682	1954687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_016863	TTG	2	6	1956509	1956514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_016863	CGA	2	6	1956528	1956533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_016863	A	6	6	1956568	1956573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_016863	GGC	2	6	1956574	1956579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_016863	TAT	2	6	1956580	1956585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_016863	ACTG	2	8	1956672	1956679	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5528	NC_016863	CGC	2	6	1956736	1956741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5530	NC_016863	GGC	2	6	1960447	1960452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_016863	GCA	2	6	1960456	1960461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_016863	GTAG	2	8	1960475	1960482	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_016863	GGC	2	6	1960504	1960509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_016863	GCT	2	6	1960514	1960519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_016863	A	7	7	1960541	1960547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_016863	AGCA	2	8	1960580	1960587	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5537	NC_016863	ATG	2	6	1960602	1960607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_016863	CTT	2	6	1961967	1961972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_016863	CAAC	2	8	1962010	1962017	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5540	NC_016863	TTTGA	2	10	1962019	1962028	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_016863	ATT	2	6	1962056	1962061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_016863	CGCGC	2	10	1962082	1962091	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5543	NC_016863	GC	4	8	1962088	1962095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5544	NC_016863	CGT	2	6	1963932	1963937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_016863	CAT	2	6	1963941	1963946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_016863	AG	3	6	1964035	1964040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_016863	GGC	2	6	1964088	1964093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_016863	CAGGTA	2	12	1964102	1964113	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5549	NC_016863	TGC	2	6	1967210	1967215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_016863	CCG	2	6	1967227	1967232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5551	NC_016863	AAGCT	2	10	1967256	1967265	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5552	NC_016863	ACCT	2	8	1967332	1967339	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5553	NC_016863	TATT	2	8	1967364	1967371	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_016863	AG	3	6	1967377	1967382	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_016863	AAAG	2	8	1967401	1967408	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_016863	GCA	2	6	1971030	1971035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_016863	AG	3	6	1971055	1971060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_016863	ATG	2	6	1971062	1971067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_016863	A	6	6	1971105	1971110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_016863	CCGG	2	8	1971166	1971173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5561	NC_016863	AGCGC	2	10	1971196	1971205	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5562	NC_016863	A	6	6	1971215	1971220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_016863	TAC	2	6	1972272	1972277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_016863	CTT	2	6	1974203	1974208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_016863	GC	3	6	1974231	1974236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5566	NC_016863	T	6	6	1974270	1974275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_016863	CGG	2	6	1974308	1974313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5569	NC_016863	GAC	2	6	1976103	1976108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_016863	GCG	2	6	1976130	1976135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_016863	ATT	2	6	1976753	1976758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_016863	CAT	2	6	1980609	1980614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_016863	AAGGC	2	10	1980663	1980672	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5574	NC_016863	A	8	8	1980673	1980680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_016863	GCT	2	6	1980700	1980705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5578	NC_016863	TAAT	2	8	1981997	1982004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_016863	CTG	2	6	1982034	1982039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5581	NC_016863	TC	3	6	1982075	1982080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5582	NC_016863	ATA	2	6	1982099	1982104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5584	NC_016863	TTTTA	2	10	1982138	1982147	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_016863	TTA	2	6	1982180	1982185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_016863	GTG	2	6	1982285	1982290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_016863	AAT	2	6	1982328	1982333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_016863	CGC	2	6	1982879	1982884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5589	NC_016863	TCC	2	6	1985102	1985107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5590	NC_016863	ATC	2	6	1985110	1985115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5592	NC_016863	TCA	2	6	1985254	1985259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_016863	CGCTT	2	10	1985267	1985276	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5594	NC_016863	TGT	2	6	1985302	1985307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5596	NC_016863	GCC	2	6	1985428	1985433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5597	NC_016863	C	8	8	1985444	1985451	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5598	NC_016863	AC	3	6	1985456	1985461	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5599	NC_016863	T	6	6	1985515	1985520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_016863	AGA	2	6	1985552	1985557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_016863	TCAT	2	8	1985579	1985586	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5602	NC_016863	TCA	2	6	1985646	1985651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_016863	CAGC	2	8	1985691	1985698	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5604	NC_016863	GACT	2	8	1986441	1986448	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5605	NC_016863	TTTAT	2	10	1986453	1986462	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_016863	TA	3	6	1986527	1986532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_016863	CTC	2	6	1986564	1986569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5608	NC_016863	A	6	6	1986590	1986595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_016863	A	8	8	1986614	1986621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_016863	CGAT	2	8	1986679	1986686	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5611	NC_016863	TTC	2	6	1986728	1986733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_016863	TATT	2	8	1986743	1986750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_016863	TTA	2	6	1987372	1987377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_016863	AGC	2	6	1987395	1987400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_016863	GGT	2	6	1987438	1987443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5617	NC_016863	CAT	2	6	1987472	1987477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_016863	TGTCT	2	10	1987504	1987513	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5619	NC_016863	AC	3	6	1988230	1988235	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5620	NC_016863	TAA	2	6	1988245	1988250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_016863	CA	3	6	1988280	1988285	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5622	NC_016863	GGC	2	6	1988749	1988754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_016863	GGA	2	6	1988782	1988787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5625	NC_016863	ATA	2	6	1988920	1988925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_016863	CCT	2	6	1989775	1989780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5627	NC_016863	CGG	2	6	1989841	1989846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_016863	GTA	2	6	1989985	1989990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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