MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240 plasmid pSTMDT12_L

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016861	AAGT	2	8	1280	1287	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016861	AGTG	2	8	1640	1647	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016861	TGGC	2	8	1678	1685	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016861	GCAG	2	8	1909	1916	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016861	TAAA	2	8	3106	3113	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016861	GCCC	2	8	3156	3163	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_016861	TCCC	2	8	4738	4745	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_016861	CCGG	2	8	4788	4795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016861	TAAA	2	8	8139	8146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016861	TGTT	2	8	8232	8239	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016861	CTAA	2	8	8264	8271	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016861	GCCT	2	8	8513	8520	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016861	TGTC	2	8	8586	8593	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016861	ACTG	2	8	9230	9237	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016861	TGGC	2	8	14156	14163	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_016861	TTCC	2	8	14168	14175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016861	AAAC	2	8	14713	14720	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_016861	TGTT	2	8	14745	14752	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016861	CAAA	2	8	14789	14796	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_016861	CATA	2	8	14854	14861	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016861	CTTT	2	8	15418	15425	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_016861	TTGC	2	8	15430	15437	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_016861	TTCC	2	8	15881	15888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016861	GCAG	2	8	16113	16120	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016861	TCAC	2	8	16387	16394	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_016861	ACAG	2	8	18705	18712	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_016861	CAGT	2	8	18723	18730	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_016861	TATT	2	8	25682	25689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016861	GTAA	2	8	25766	25773	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016861	CCCG	2	8	26177	26184	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_016861	TTTA	2	8	31014	31021	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016861	CGAA	2	8	32763	32770	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_016861	CGCT	2	8	37997	38004	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016861	TCCT	2	8	39238	39245	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016861	AATC	2	8	41765	41772	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016861	CTTA	2	8	44075	44082	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_016861	TAAA	2	8	46864	46871	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016861	AATA	2	8	50978	50985	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016861	ATTT	2	8	51475	51482	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016861	CCCG	2	8	52120	52127	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41	NC_016861	TTTG	2	8	52210	52217	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016861	TTAG	2	8	52218	52225	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016861	GTTT	2	8	52237	52244	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016861	CTTT	2	8	56118	56125	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016861	GCTT	2	8	56137	56144	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016861	ATTT	2	8	56371	56378	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016861	TGAA	2	8	61756	61763	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016861	CGGG	2	8	63495	63502	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_016861	ATCA	2	8	63505	63512	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_016861	GAAA	2	8	64351	64358	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016861	GCCG	2	8	64487	64494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016861	CATC	2	8	64550	64557	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016861	TCCT	2	8	64610	64617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016861	TCAT	2	8	65277	65284	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_016861	ATTA	2	8	71557	71564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016861	CAGT	2	8	72596	72603	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_016861	TAAA	2	8	74001	74008	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016861	GTCA	2	8	79969	79976	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_016861	GCCG	2	8	79993	80000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016861	CCTG	2	8	80018	80025	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016861	TGGT	2	8	95771	95778	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016861	CTGA	2	8	96558	96565	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016861	GAAA	2	8	96595	96602	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016861	AAAT	2	8	96636	96643	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016861	GTTA	2	8	96840	96847	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016861	AATT	2	8	96856	96863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016861	TCTT	2	8	96882	96889	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.