MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240

Total Repeats: 12767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016860	ATT	2	6	1577132	1577137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_016860	ATG	2	6	1577147	1577152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_016860	ATT	2	6	1577181	1577186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_016860	AGG	3	9	1577227	1577235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_016860	ATG	2	6	1577613	1577618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_016860	CCGCG	2	10	1578388	1578397	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4007	NC_016860	ACC	2	6	1579373	1579378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4008	NC_016860	TGT	2	6	1579448	1579453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_016860	CG	3	6	1579822	1579827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4010	NC_016860	GTA	2	6	1579880	1579885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_016860	T	8	8	1585581	1585588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_016860	GTG	2	6	1586410	1586415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_016860	TGT	2	6	1587262	1587267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_016860	GTT	2	6	1589428	1589433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_016860	AAC	2	6	1589445	1589450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_016860	TGA	2	6	1589476	1589481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_016860	GTG	2	6	1589559	1589564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_016860	TTA	2	6	1589582	1589587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_016860	A	6	6	1589610	1589615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_016860	TAT	2	6	1589638	1589643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_016860	AAT	2	6	1589647	1589652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_016860	CATAT	2	10	1589721	1589730	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4023	NC_016860	CAT	3	9	1589742	1589750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_016860	CTG	2	6	1589951	1589956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_016860	AT	3	6	1589968	1589973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_016860	T	7	7	1590014	1590020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_016860	ATT	2	6	1590057	1590062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_016860	GTTC	2	8	1590628	1590635	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4029	NC_016860	ATTT	2	8	1590652	1590659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_016860	ATT	2	6	1590680	1590685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_016860	CAA	2	6	1590698	1590703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_016860	A	6	6	1590778	1590783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_016860	ATT	2	6	1590792	1590797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_016860	TTA	2	6	1591003	1591008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_016860	GA	3	6	1591011	1591016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_016860	CG	3	6	1591412	1591417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4037	NC_016860	CGG	2	6	1591665	1591670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_016860	T	11	11	1591671	1591681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_016860	GCA	2	6	1591721	1591726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_016860	T	6	6	1591888	1591893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_016860	A	6	6	1591894	1591899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_016860	TATT	2	8	1591951	1591958	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_016860	CAG	2	6	1592028	1592033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_016860	AT	3	6	1592048	1592053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_016860	CCTG	2	8	1593296	1593303	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4046	NC_016860	ATG	2	6	1593354	1593359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_016860	GT	3	6	1593413	1593418	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_016860	AAAAG	2	10	1593442	1593451	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_016860	TAA	2	6	1593501	1593506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_016860	AAG	2	6	1594436	1594441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_016860	GCG	2	6	1594478	1594483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_016860	A	7	7	1594508	1594514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_016860	T	6	6	1595179	1595184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_016860	TAAT	2	8	1595640	1595647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_016860	GC	3	6	1595814	1595819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4056	NC_016860	ATT	2	6	1598803	1598808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_016860	ATG	2	6	1598836	1598841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_016860	GA	3	6	1598861	1598866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_016860	TGT	2	6	1600330	1600335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_016860	AGC	2	6	1601620	1601625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_016860	CGT	2	6	1601627	1601632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_016860	AGC	2	6	1601674	1601679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_016860	AT	3	6	1601691	1601696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_016860	ACA	2	6	1601724	1601729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_016860	AGTT	2	8	1601733	1601740	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_016860	T	8	8	1601742	1601749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_016860	A	7	7	1601771	1601777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_016860	CAGGG	2	10	1601785	1601794	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4069	NC_016860	A	6	6	1603465	1603470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_016860	AGT	2	6	1603501	1603506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4073	NC_016860	ACTT	2	8	1603590	1603597	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4074	NC_016860	TTA	2	6	1603604	1603609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_016860	CGAAG	2	10	1603694	1603703	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4076	NC_016860	AGT	2	6	1603716	1603721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4078	NC_016860	AAG	2	6	1603785	1603790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_016860	ACTG	2	8	1603804	1603811	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4080	NC_016860	TTA	2	6	1603912	1603917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_016860	CAG	2	6	1603918	1603923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4083	NC_016860	TAT	2	6	1605293	1605298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_016860	TAT	2	6	1605315	1605320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_016860	T	6	6	1605342	1605347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_016860	TAGT	2	8	1612616	1612623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_016860	CAT	2	6	1612629	1612634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_016860	TAG	2	6	1612667	1612672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_016860	AAC	2	6	1612693	1612698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4091	NC_016860	GCTC	2	8	1612879	1612886	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4092	NC_016860	TTA	2	6	1612920	1612925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_016860	AATT	2	8	1612945	1612952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_016860	TGC	2	6	1612956	1612961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_016860	TTTAA	2	10	1612977	1612986	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_016860	ATCCA	2	10	1612994	1613003	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4097	NC_016860	ACAA	2	8	1613008	1613015	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4098	NC_016860	CGG	2	6	1614171	1614176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_016860	TAAT	2	8	1614200	1614207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_016860	CATGC	2	10	1614982	1614991	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4101	NC_016860	CT	3	6	1617361	1617366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4102	NC_016860	ATAA	2	8	1619053	1619060	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_016860	GAA	2	6	1619063	1619068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_016860	AAT	2	6	1619075	1619080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_016860	TC	3	6	1621841	1621846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4106	NC_016860	TAT	2	6	1621856	1621861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_016860	AAAAG	2	10	1622374	1622383	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_016860	AAC	3	9	1622455	1622463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_016860	TA	3	6	1622520	1622525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_016860	CGGG	2	8	1624114	1624121	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4111	NC_016860	AATG	2	8	1624127	1624134	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_016860	AG	3	6	1624235	1624240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_016860	CCT	2	6	1624784	1624789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4114	NC_016860	TGA	2	6	1624793	1624798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_016860	TAA	2	6	1624824	1624829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_016860	T	6	6	1624890	1624895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_016860	AAC	2	6	1624982	1624987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_016860	ATT	2	6	1625013	1625018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_016860	TGG	2	6	1625024	1625029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_016860	GGAT	2	8	1625045	1625052	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_016860	GCT	2	6	1625479	1625484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_016860	ATT	2	6	1625499	1625504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_016860	AT	4	8	1625546	1625553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_016860	AAT	2	6	1625564	1625569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_016860	ATT	2	6	1626525	1626530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_016860	GC	3	6	1626552	1626557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4127	NC_016860	TAT	2	6	1626584	1626589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_016860	CAA	2	6	1626590	1626595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_016860	AT	3	6	1626700	1626705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_016860	CAG	2	6	1626766	1626771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_016860	TGG	2	6	1626786	1626791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_016860	GTG	2	6	1626844	1626849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_016860	GCC	2	6	1626888	1626893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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