MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240

Total Repeats: 12767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016860	GCT	2	6	390004	390009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_016860	CGG	2	6	390078	390083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_016860	ACA	2	6	390173	390178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_016860	TA	3	6	404390	404395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_016860	CTTA	2	8	404408	404415	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_016860	TGA	2	6	404422	404427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_016860	A	6	6	404433	404438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_016860	CAA	2	6	404488	404493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_016860	AG	3	6	404514	404519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_016860	GGT	2	6	404547	404552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_016860	CAA	2	6	404677	404682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_016860	AAG	2	6	404693	404698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_016860	TA	3	6	404703	404708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_016860	A	6	6	404715	404720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_016860	CAT	2	6	405024	405029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_016860	ACC	2	6	405058	405063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_016860	CGA	2	6	405098	405103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_016860	TAA	2	6	407137	407142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_016860	TTTTA	2	10	407163	407172	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_016860	AAT	2	6	410000	410005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_016860	GTT	2	6	410051	410056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_016860	AC	3	6	410107	410112	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_016860	TGT	2	6	410188	410193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_016860	TAT	2	6	410249	410254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_016860	ATCA	2	8	410268	410275	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_016860	T	6	6	410308	410313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_016860	GAT	2	6	410378	410383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_016860	CAT	2	6	410458	410463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_016860	GAC	2	6	410581	410586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_016860	AAAG	2	8	412063	412070	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_016860	CGG	2	6	412092	412097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_016860	TC	3	6	412122	412127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_016860	GGC	2	6	412499	412504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_016860	TA	3	6	412570	412575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_016860	AATA	2	8	412583	412590	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_016860	TA	3	6	412589	412594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_016860	TAC	2	6	412605	412610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_016860	GAT	2	6	412635	412640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_016860	AAAAT	2	10	412685	412694	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_016860	TGTT	2	8	412746	412753	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_016860	GT	3	6	414046	414051	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_016860	ATC	2	6	414073	414078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_016860	T	6	6	414080	414085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_016860	GAA	2	6	416215	416220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_016860	GCGTT	2	10	419109	419118	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1046	NC_016860	CAC	2	6	419167	419172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_016860	ATT	2	6	419201	419206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_016860	CA	3	6	419317	419322	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_016860	GATT	2	8	419341	419348	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_016860	ACT	2	6	419354	419359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_016860	TAT	2	6	419392	419397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_016860	A	6	6	419423	419428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_016860	CCAT	2	8	419434	419441	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_016860	CA	3	6	419530	419535	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_016860	CTCATT	2	12	419583	419594	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_016860	AATGT	2	10	419604	419613	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_016860	GCA	2	6	419646	419651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_016860	ATT	2	6	419706	419711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_016860	TCT	2	6	419775	419780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_016860	TTTC	2	8	419784	419791	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_016860	TGAAA	2	10	419888	419897	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_016860	TA	3	6	419916	419921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_016860	CAT	2	6	426022	426027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_016860	CCG	2	6	426079	426084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_016860	A	7	7	426747	426753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_016860	AT	3	6	426766	426771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_016860	GAA	2	6	426794	426799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_016860	TGT	2	6	428040	428045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_016860	T	6	6	428143	428148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_016860	GATGC	2	10	428204	428213	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1071	NC_016860	TAA	2	6	428249	428254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_016860	A	6	6	428253	428258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_016860	AT	3	6	428298	428303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_016860	TAA	2	6	428338	428343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_016860	TG	3	6	428376	428381	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_016860	TA	3	6	428407	428412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_016860	ATA	2	6	429000	429005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_016860	GCT	2	6	429010	429015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_016860	TGA	2	6	429091	429096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_016860	TTA	2	6	430001	430006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_016860	AT	3	6	430411	430416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_016860	GC	5	10	430426	430435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_016860	CAT	2	6	436480	436485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_016860	GTC	2	6	436599	436604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_016860	CA	3	6	439428	439433	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_016860	CGCTT	2	10	439692	439701	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1087	NC_016860	TAA	2	6	439762	439767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_016860	TA	3	6	439808	439813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_016860	GAC	2	6	439863	439868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_016860	T	6	6	439911	439916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_016860	TCC	2	6	441229	441234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_016860	CGT	2	6	441235	441240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_016860	AAC	2	6	441259	441264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_016860	ATG	2	6	441273	441278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_016860	ATC	2	6	441304	441309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_016860	T	6	6	441316	441321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_016860	ATTG	2	8	441333	441340	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_016860	TGAA	2	8	446323	446330	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_016860	GCC	2	6	446368	446373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_016860	AGCG	2	8	446378	446385	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_016860	CCCGT	2	10	446413	446422	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1102	NC_016860	T	7	7	446518	446524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_016860	CGTTT	2	10	446740	446749	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1104	NC_016860	TA	4	8	446790	446797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_016860	GGGA	2	8	446801	446808	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_016860	TCG	2	6	449374	449379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_016860	TC	3	6	449440	449445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_016860	ATT	2	6	449465	449470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_016860	CCG	2	6	450587	450592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_016860	T	6	6	450622	450627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_016860	TAA	2	6	450684	450689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_016860	TTA	2	6	453529	453534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_016860	GAT	2	6	453547	453552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_016860	GTT	2	6	453591	453596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_016860	ACT	2	6	453641	453646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_016860	GAT	2	6	453687	453692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_016860	TAA	3	9	453697	453705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_016860	CAT	2	6	454005	454010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_016860	CGG	2	6	454032	454037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_016860	TATT	2	8	454041	454048	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_016860	T	6	6	455785	455790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_016860	T	9	9	455861	455869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_016860	CTTTG	2	10	455968	455977	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1124	NC_016860	GCC	2	6	456932	456937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_016860	TACGG	2	10	456975	456984	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1126	NC_016860	AAT	2	6	457014	457019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_016860	TTA	2	6	458209	458214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_016860	GC	3	6	461702	461707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_016860	GCAG	2	8	462745	462752	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_016860	CGG	4	12	462794	462805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_016860	CTT	2	6	462815	462820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_016860	TA	3	6	462822	462827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_016860	GTT	2	6	462881	462886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_016860	ATT	2	6	462931	462936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_016860	T	7	7	462987	462993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_016860	TTA	2	6	463046	463051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_016860	AAT	2	6	463093	463098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1266	NC_016860	T	6	6	522163	522168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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