MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240

Total Repeats: 12767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016860	ACGC	2	8	216988	216995	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
502	NC_016860	TAA	2	6	217008	217013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_016860	GA	3	6	220847	220852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016860	TCT	3	9	220855	220863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_016860	GTC	2	6	220864	220869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_016860	GAA	2	6	220875	220880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_016860	TCC	2	6	223554	223559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_016860	ATAA	2	8	223560	223567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_016860	TTA	2	6	223582	223587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016860	CCTT	2	8	223590	223597	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
511	NC_016860	CGA	2	6	223657	223662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_016860	TGC	2	6	223677	223682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_016860	TAA	3	9	223688	223696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_016860	TCA	2	6	223722	223727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_016860	CAATAT	2	12	229781	229792	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
516	NC_016860	CTGTC	2	10	229848	229857	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
517	NC_016860	AAG	2	6	229894	229899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_016860	GC	3	6	229943	229948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
519	NC_016860	TGA	2	6	230001	230006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_016860	AAT	2	6	230029	230034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_016860	TAA	3	9	230123	230131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_016860	ATA	2	6	230152	230157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_016860	ATT	2	6	230162	230167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_016860	T	7	7	230166	230172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016860	TAA	2	6	230180	230185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_016860	A	6	6	230184	230189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_016860	AAAT	2	8	230201	230208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_016860	A	8	8	230227	230234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_016860	T	6	6	230247	230252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016860	T	8	8	230254	230261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_016860	AAAT	2	8	230279	230286	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_016860	TA	3	6	230302	230307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_016860	T	7	7	230329	230335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_016860	T	7	7	230358	230364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_016860	CTTG	2	8	230376	230383	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
536	NC_016860	TTTG	2	8	230385	230392	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
537	NC_016860	T	6	6	230393	230398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_016860	TAT	2	6	230415	230420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_016860	TAAA	2	8	230439	230446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_016860	A	6	6	230444	230449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_016860	TTAT	2	8	230501	230508	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_016860	GTT	2	6	230515	230520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_016860	CTT	2	6	230523	230528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_016860	ATATA	2	10	230562	230571	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_016860	CTA	2	6	230575	230580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_016860	TG	3	6	230610	230615	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
547	NC_016860	TAA	2	6	230643	230648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_016860	ATC	2	6	231226	231231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_016860	GAT	2	6	231251	231256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_016860	A	7	7	231266	231272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_016860	TA	3	6	231278	231283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_016860	A	9	9	237151	237159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_016860	GGC	2	6	237166	237171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_016860	GTT	2	6	237191	237196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_016860	TCT	2	6	238655	238660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_016860	C	6	6	245972	245977	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
557	NC_016860	TGCTC	2	10	246050	246059	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
558	NC_016860	AGG	2	6	246062	246067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
559	NC_016860	CGG	2	6	247234	247239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_016860	AT	3	6	247265	247270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_016860	AC	3	6	247310	247315	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
562	NC_016860	TCA	2	6	247717	247722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_016860	AAT	2	6	247737	247742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_016860	CCA	2	6	247764	247769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_016860	A	7	7	247778	247784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_016860	AGA	2	6	247799	247804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_016860	GCG	2	6	247832	247837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_016860	G	6	6	249260	249265	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
569	NC_016860	ATAA	2	8	250131	250138	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_016860	CT	3	6	252958	252963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
571	NC_016860	GCC	2	6	252965	252970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_016860	GAT	2	6	253868	253873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_016860	AAT	2	6	253880	253885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_016860	TCAG	2	8	253908	253915	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
575	NC_016860	T	6	6	253984	253989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_016860	ACTG	2	8	254000	254007	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
577	NC_016860	TGC	2	6	254036	254041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_016860	CAA	2	6	254086	254091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_016860	GC	3	6	254125	254130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
580	NC_016860	AC	3	6	254156	254161	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
581	NC_016860	AAC	2	6	254194	254199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_016860	AC	4	8	254198	254205	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
583	NC_016860	GGC	2	6	255065	255070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_016860	GTA	2	6	255178	255183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_016860	GAG	2	6	256140	256145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_016860	CTT	2	6	256160	256165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_016860	CT	3	6	256173	256178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
588	NC_016860	GAAA	2	8	256268	256275	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
589	NC_016860	TTA	2	6	257051	257056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_016860	TG	3	6	257101	257106	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
591	NC_016860	GTCTG	2	10	257110	257119	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
592	NC_016860	GTG	2	6	257757	257762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_016860	AGA	2	6	257778	257783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_016860	GCG	2	6	257802	257807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_016860	AGA	2	6	259059	259064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_016860	T	6	6	259131	259136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_016860	T	6	6	259166	259171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_016860	CG	3	6	259260	259265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
599	NC_016860	A	6	6	259344	259349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_016860	TTAG	2	8	262354	262361	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
601	NC_016860	GAA	2	6	262362	262367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_016860	ATA	2	6	262371	262376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_016860	TTA	2	6	266497	266502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_016860	T	8	8	274048	274055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_016860	GCAG	2	8	274151	274158	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
606	NC_016860	T	6	6	276006	276011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_016860	GCGCT	2	10	279967	279976	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
608	NC_016860	CAC	2	6	280024	280029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_016860	CAA	2	6	280037	280042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_016860	CCT	2	6	280500	280505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_016860	CAA	2	6	282454	282459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_016860	A	7	7	284239	284245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_016860	AATG	2	8	285417	285424	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
614	NC_016860	AAT	2	6	285490	285495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_016860	TGTGT	2	10	286362	286371	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
616	NC_016860	TAT	2	6	288064	288069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_016860	AATGA	2	10	288073	288082	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
618	NC_016860	ATCA	2	8	288157	288164	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
619	NC_016860	CTG	2	6	288192	288197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_016860	CGG	2	6	288904	288909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_016860	CA	3	6	288923	288928	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
622	NC_016860	CGGT	2	8	288935	288942	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
623	NC_016860	TG	3	6	289063	289068	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
624	NC_016860	GGC	2	6	289217	289222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_016860	AGC	2	6	289257	289262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_016860	TGC	2	6	289264	289269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_016860	ACT	2	6	289331	289336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_016860	CGA	2	6	289456	289461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_016860	GCA	2	6	289530	289535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_016860	GAA	2	6	289589	289594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_016860	GGA	2	6	289625	289630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
632	NC_016860	TAA	2	6	289643	289648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_016860	GCA	2	6	289651	289656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_016860	AGA	2	6	289672	289677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_016860	CAG	2	6	289698	289703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_016860	G	6	6	289845	289850	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
637	NC_016860	GGA	2	6	289889	289894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
638	NC_016860	GGC	2	6	289909	289914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_016860	GAA	2	6	290152	290157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_016860	TGC	2	6	290228	290233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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643	NC_016860	GGA	2	6	290353	290358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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