MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240

Total Repeats: 12767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016860	ATAA	2	8	2305466	2305473	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_016860	GCG	2	6	2305538	2305543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_016860	AGG	2	6	2305606	2305611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_016860	TCA	2	6	2306021	2306026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_016860	ACA	2	6	2306078	2306083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_016860	C	6	6	2306094	2306099	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6007	NC_016860	T	6	6	2306166	2306171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_016860	AGT	2	6	2306218	2306223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_016860	ACA	2	6	2306250	2306255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_016860	TATT	2	8	2306885	2306892	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_016860	GCA	3	9	2306953	2306961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_016860	ATT	2	6	2307009	2307014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_016860	GTT	2	6	2307019	2307024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_016860	TGT	2	6	2307026	2307031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_016860	ATG	2	6	2308842	2308847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_016860	CAT	2	6	2308862	2308867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_016860	ATT	2	6	2308879	2308884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_016860	A	6	6	2308979	2308984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_016860	TCGC	2	8	2308995	2309002	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6020	NC_016860	CAA	2	6	2309011	2309016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_016860	ATT	2	6	2309053	2309058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_016860	TCA	2	6	2309137	2309142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_016860	ACAA	2	8	2309192	2309199	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6024	NC_016860	TCA	2	6	2309777	2309782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_016860	GCA	2	6	2309784	2309789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_016860	TGA	2	6	2309806	2309811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_016860	GAC	2	6	2309812	2309817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_016860	CAG	2	6	2309834	2309839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_016860	TTA	2	6	2309849	2309854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_016860	ACA	2	6	2309908	2309913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_016860	TTA	2	6	2311699	2311704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_016860	TTAC	2	8	2317669	2317676	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6033	NC_016860	CAT	2	6	2317690	2317695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_016860	TC	3	6	2317731	2317736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6035	NC_016860	GCG	2	6	2317792	2317797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_016860	ATG	2	6	2317846	2317851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_016860	ATAAA	2	10	2317878	2317887	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_016860	AGG	2	6	2317893	2317898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_016860	ATG	2	6	2317902	2317907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_016860	TAA	2	6	2319957	2319962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_016860	A	6	6	2319987	2319992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_016860	CCCG	2	8	2321893	2321900	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6043	NC_016860	ATT	2	6	2321956	2321961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_016860	AG	3	6	2321964	2321969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_016860	GAA	2	6	2322274	2322279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_016860	CCCCG	2	10	2322283	2322292	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
6047	NC_016860	T	7	7	2322299	2322305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_016860	GAC	2	6	2322324	2322329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_016860	ACC	2	6	2324058	2324063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6050	NC_016860	GCAA	2	8	2324078	2324085	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6051	NC_016860	A	8	8	2324145	2324152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_016860	AACA	2	8	2324185	2324192	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6053	NC_016860	GTA	2	6	2326276	2326281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_016860	GAA	2	6	2326383	2326388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_016860	T	7	7	2326407	2326413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_016860	AAT	2	6	2326446	2326451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_016860	CTC	2	6	2327461	2327466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6058	NC_016860	GTC	2	6	2327491	2327496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_016860	CTT	2	6	2327548	2327553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_016860	GAC	2	6	2327596	2327601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_016860	A	6	6	2327608	2327613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_016860	ATC	2	6	2327618	2327623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_016860	TG	3	6	2327643	2327648	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_016860	TTTTA	2	10	2329523	2329532	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_016860	ACA	2	6	2329540	2329545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_016860	GGAT	2	8	2330043	2330050	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_016860	GTT	2	6	2330070	2330075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_016860	TCAA	2	8	2330077	2330084	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6069	NC_016860	TGT	2	6	2330160	2330165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_016860	AG	3	6	2330245	2330250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_016860	GAA	2	6	2330287	2330292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_016860	TTCC	2	8	2332155	2332162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6073	NC_016860	ACA	2	6	2332175	2332180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_016860	TC	3	6	2333080	2333085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6075	NC_016860	CAG	2	6	2333098	2333103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_016860	AAG	2	6	2333154	2333159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_016860	AGGCC	2	10	2333185	2333194	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6078	NC_016860	CGG	2	6	2333234	2333239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_016860	TAT	2	6	2333326	2333331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_016860	T	6	6	2333335	2333340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_016860	ATA	2	6	2334699	2334704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_016860	CCA	2	6	2335102	2335107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6083	NC_016860	CAT	2	6	2336356	2336361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_016860	TGT	2	6	2336375	2336380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_016860	CGCAC	2	10	2336401	2336410	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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6087	NC_016860	CAT	2	6	2338840	2338845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_016860	CGG	2	6	2338879	2338884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_016860	GTC	2	6	2338892	2338897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6091	NC_016860	ATG	2	6	2338940	2338945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_016860	T	6	6	2338986	2338991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_016860	ATC	2	6	2339017	2339022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_016860	CTGC	3	12	2339056	2339067	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6095	NC_016860	TCG	2	6	2339237	2339242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_016860	CTG	2	6	2339262	2339267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_016860	AAT	2	6	2339270	2339275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_016860	CGC	2	6	2339320	2339325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6099	NC_016860	AAT	2	6	2339333	2339338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_016860	TGTT	2	8	2339390	2339397	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_016860	T	8	8	2339405	2339412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_016860	ATT	2	6	2339424	2339429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_016860	CTT	2	6	2339431	2339436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_016860	GCG	3	9	2340358	2340366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_016860	GCA	2	6	2340775	2340780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_016860	ATA	2	6	2340781	2340786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_016860	GGTAA	2	10	2340796	2340805	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_016860	ATTA	2	8	2340907	2340914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_016860	CAGC	2	8	2340921	2340928	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6110	NC_016860	CCA	3	9	2341517	2341525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6111	NC_016860	CGC	2	6	2341660	2341665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6112	NC_016860	GTT	2	6	2341670	2341675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_016860	ATTTA	2	10	2341797	2341806	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_016860	TAA	2	6	2341855	2341860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_016860	ATAA	2	8	2341865	2341872	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_016860	AAT	2	6	2341883	2341888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_016860	TAA	2	6	2341893	2341898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_016860	TAA	2	6	2341925	2341930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_016860	GCA	2	6	2341978	2341983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_016860	A	6	6	2342019	2342024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_016860	TC	3	6	2342065	2342070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6122	NC_016860	GTT	2	6	2342078	2342083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_016860	TAC	2	6	2342129	2342134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_016860	AAT	2	6	2342211	2342216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_016860	TAA	2	6	2342222	2342227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_016860	GCGCC	2	10	2342909	2342918	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6127	NC_016860	GTC	2	6	2347882	2347887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_016860	CCT	2	6	2347894	2347899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6129	NC_016860	TCA	2	6	2349212	2349217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6131	NC_016860	AGT	2	6	2355257	2355262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6133	NC_016860	TA	3	6	2355405	2355410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6256	NC_016860	CATTAA	2	12	2435249	2435260	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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6261	NC_016860	T	6	6	2435460	2435465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6262	NC_016860	T	6	6	2435500	2435505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6398	NC_016860	CG	3	6	2497714	2497719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6399	NC_016860	CCG	2	6	2497738	2497743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6400	NC_016860	GCCA	2	8	2497749	2497756	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6401	NC_016860	A	6	6	2497782	2497787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6402	NC_016860	AAT	2	6	2497916	2497921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6403	NC_016860	TTTA	2	8	2499291	2499298	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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