MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240

Total Repeats: 12767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016860	A	6	6	2074647	2074652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_016860	TTA	2	6	2074745	2074750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_016860	GAA	2	6	2075021	2075026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_016860	AG	3	6	2075034	2075039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_016860	A	7	7	2075040	2075046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_016860	ATG	2	6	2075073	2075078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_016860	ACT	2	6	2075094	2075099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_016860	A	7	7	2075173	2075179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_016860	T	6	6	2075189	2075194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_016860	GAT	2	6	2075395	2075400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_016860	TA	3	6	2077148	2077153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_016860	AGT	2	6	2077155	2077160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_016860	GC	3	6	2077174	2077179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5514	NC_016860	TCG	2	6	2077213	2077218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_016860	TC	4	8	2077234	2077241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5516	NC_016860	CGA	2	6	2077448	2077453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_016860	GAC	2	6	2077462	2077467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_016860	CGC	2	6	2077478	2077483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5519	NC_016860	AGA	2	6	2077688	2077693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_016860	GA	3	6	2077719	2077724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_016860	TC	3	6	2077797	2077802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5522	NC_016860	ATG	2	6	2077814	2077819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_016860	TTAA	2	8	2078706	2078713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_016860	AATTG	2	10	2078716	2078725	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_016860	TAT	2	6	2078766	2078771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_016860	CGG	2	6	2078814	2078819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_016860	CTT	2	6	2078928	2078933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_016860	ATT	2	6	2079517	2079522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_016860	TGCC	2	8	2079530	2079537	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5530	NC_016860	TCA	2	6	2079551	2079556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_016860	TGT	2	6	2079669	2079674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_016860	CAAA	2	8	2079684	2079691	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5533	NC_016860	CGG	2	6	2079784	2079789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_016860	A	6	6	2079877	2079882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_016860	T	7	7	2079927	2079933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_016860	CCT	2	6	2079993	2079998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5537	NC_016860	TTTAC	2	10	2080515	2080524	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5538	NC_016860	TGC	2	6	2080554	2080559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_016860	TCG	2	6	2080628	2080633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_016860	AAGA	2	8	2080743	2080750	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_016860	G	8	8	2080772	2080779	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_016860	GCAG	2	8	2080807	2080814	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5543	NC_016860	CAA	2	6	2080850	2080855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_016860	TA	3	6	2081790	2081795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_016860	TAA	2	6	2081801	2081806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_016860	TCA	2	6	2081807	2081812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_016860	TTA	2	6	2081818	2081823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_016860	AAC	2	6	2081834	2081839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_016860	ATT	2	6	2081857	2081862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_016860	GAA	2	6	2081876	2081881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_016860	CT	3	6	2081884	2081889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5552	NC_016860	CTC	2	6	2081904	2081909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5553	NC_016860	TTA	2	6	2081963	2081968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_016860	CCCG	2	8	2085952	2085959	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5555	NC_016860	ACG	2	6	2086329	2086334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_016860	CGGT	2	8	2086578	2086585	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5557	NC_016860	GCG	2	6	2086638	2086643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_016860	TTCA	2	8	2086772	2086779	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5559	NC_016860	CAG	3	9	2086823	2086831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_016860	ATT	2	6	2088303	2088308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_016860	AGG	2	6	2088358	2088363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_016860	AAAAG	2	10	2088414	2088423	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_016860	CCA	2	6	2088439	2088444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5564	NC_016860	AAG	2	6	2088457	2088462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_016860	CAA	2	6	2088934	2088939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_016860	ATG	2	6	2089069	2089074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_016860	ATT	2	6	2089115	2089120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_016860	CAA	2	6	2089138	2089143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_016860	A	6	6	2089195	2089200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_016860	GCA	2	6	2089217	2089222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_016860	TTC	2	6	2089264	2089269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_016860	GAAA	2	8	2089337	2089344	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_016860	CCA	2	6	2089419	2089424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5574	NC_016860	TG	3	6	2089445	2089450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_016860	A	6	6	2089605	2089610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5579	NC_016860	A	7	7	2089838	2089844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_016860	TGC	2	6	2089852	2089857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5584	NC_016860	CAA	2	6	2091439	2091444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5588	NC_016860	A	7	7	2091652	2091658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_016860	ACT	2	6	2091785	2091790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5592	NC_016860	TAA	2	6	2093930	2093935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5594	NC_016860	GGT	2	6	2109361	2109366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_016860	GTT	2	6	2109437	2109442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_016860	CAGG	2	8	2109455	2109462	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5597	NC_016860	TCT	2	6	2109463	2109468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_016860	TCC	2	6	2109478	2109483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5599	NC_016860	GTC	2	6	2109526	2109531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5601	NC_016860	TAA	2	6	2109641	2109646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_016860	TAA	2	6	2109755	2109760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_016860	TCA	2	6	2109786	2109791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_016860	TAT	2	6	2109829	2109834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_016860	TTG	2	6	2109836	2109841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_016860	TTTC	2	8	2109875	2109882	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5607	NC_016860	AAACA	2	10	2110882	2110891	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5608	NC_016860	ATT	2	6	2110893	2110898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_016860	TTA	2	6	2110911	2110916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5612	NC_016860	TTG	2	6	2111960	2111965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5614	NC_016860	CAT	2	6	2112042	2112047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_016860	ATA	2	6	2112083	2112088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5617	NC_016860	AAT	2	6	2112209	2112214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_016860	AAT	2	6	2112224	2112229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_016860	ATT	2	6	2112294	2112299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_016860	TCT	2	6	2112342	2112347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_016860	CAA	2	6	2112390	2112395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_016860	ACG	2	6	2128205	2128210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_016860	TAA	2	6	2128229	2128234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_016860	GATTCG	2	12	2129547	2129558	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5625	NC_016860	GCC	2	6	2129610	2129615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5626	NC_016860	AGC	2	6	2129736	2129741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_016860	ATTC	2	8	2129747	2129754	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5628	NC_016860	A	6	6	2130852	2130857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_016860	CGGA	2	8	2130896	2130903	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5631	NC_016860	GT	4	8	2131549	2131556	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5764	NC_016860	AAGG	2	8	2203771	2203778	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5765	NC_016860	G	6	6	2203777	2203782	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5778	NC_016860	ATT	2	6	2220804	2220809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5796	NC_016860	A	6	6	2226772	2226777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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