MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240

Total Repeats: 12767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016860	CTAA	2	8	1934539	1934546	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5002	NC_016860	AAAAG	2	10	1934547	1934556	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_016860	GTA	2	6	1934559	1934564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_016860	AATA	2	8	1934810	1934817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_016860	AAT	2	6	1934840	1934845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_016860	TGT	2	6	1934860	1934865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_016860	ATA	2	6	1934882	1934887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_016860	TAA	2	6	1934891	1934896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_016860	TAA	2	6	1935004	1935009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_016860	TAT	2	6	1935853	1935858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_016860	AAC	2	6	1935919	1935924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_016860	ATT	3	9	1935942	1935950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_016860	TTA	2	6	1935967	1935972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_016860	GAC	2	6	1938422	1938427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_016860	A	9	9	1938441	1938449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_016860	T	6	6	1938459	1938464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_016860	GGCCT	2	10	1940532	1940541	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5018	NC_016860	CAA	2	6	1941262	1941267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_016860	GCA	2	6	1941268	1941273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_016860	TA	3	6	1941829	1941834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_016860	ATT	2	6	1941902	1941907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_016860	ATT	2	6	1941929	1941934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_016860	A	7	7	1947369	1947375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_016860	TTAT	2	8	1947741	1947748	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_016860	C	6	6	1947766	1947771	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5026	NC_016860	AGT	2	6	1947802	1947807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_016860	ATC	2	6	1948808	1948813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_016860	TCC	2	6	1948902	1948907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5029	NC_016860	CAT	2	6	1949115	1949120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_016860	AAC	2	6	1949144	1949149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_016860	A	7	7	1949162	1949168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_016860	TAA	2	6	1949196	1949201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_016860	ATT	2	6	1949204	1949209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_016860	GAC	2	6	1949256	1949261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_016860	AT	3	6	1949292	1949297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_016860	GTATT	2	10	1949339	1949348	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_016860	TAC	2	6	1949349	1949354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_016860	A	6	6	1950139	1950144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_016860	ATTTT	2	10	1950189	1950198	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_016860	TTC	2	6	1950213	1950218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_016860	T	8	8	1950233	1950240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_016860	TTCAA	2	10	1950311	1950320	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5043	NC_016860	ATT	3	9	1950350	1950358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_016860	TGT	2	6	1950367	1950372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_016860	GGCT	2	8	1950395	1950402	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5046	NC_016860	CGCCA	2	10	1950452	1950461	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5047	NC_016860	AATT	2	8	1950497	1950504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_016860	TA	3	6	1950515	1950520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_016860	AAATG	2	10	1950553	1950562	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_016860	A	7	7	1950586	1950592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_016860	AAT	2	6	1950605	1950610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_016860	ATT	3	9	1950666	1950674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_016860	GCT	2	6	1950699	1950704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_016860	CAA	2	6	1950711	1950716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_016860	ACA	2	6	1950726	1950731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_016860	TAA	2	6	1951169	1951174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_016860	CCGA	2	8	1951270	1951277	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5058	NC_016860	GCA	2	6	1951279	1951284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_016860	ACA	2	6	1951304	1951309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_016860	TCTA	2	8	1951387	1951394	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5061	NC_016860	A	6	6	1951469	1951474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_016860	TCT	2	6	1951969	1951974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_016860	ATTA	2	8	1952011	1952018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_016860	CAG	2	6	1952037	1952042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_016860	TAT	2	6	1952065	1952070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_016860	TA	3	6	1952093	1952098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_016860	GCC	2	6	1952130	1952135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5068	NC_016860	GT	3	6	1952267	1952272	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5070	NC_016860	AT	3	6	1952289	1952294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_016860	GCA	2	6	1952343	1952348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_016860	TTAA	2	8	1952822	1952829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_016860	GTTT	2	8	1952845	1952852	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5079	NC_016860	TCAA	2	8	1953562	1953569	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5080	NC_016860	CAA	2	6	1953659	1953664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_016860	CAG	2	6	1953693	1953698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_016860	AGA	2	6	1953735	1953740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5097	NC_016860	ATT	2	6	1956343	1956348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5099	NC_016860	ATC	2	6	1956532	1956537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5101	NC_016860	ATG	2	6	1956594	1956599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5103	NC_016860	TAT	2	6	1956716	1956721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_016860	TCT	2	6	1956745	1956750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_016860	A	6	6	1956778	1956783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_016860	GAA	2	6	1956790	1956795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5108	NC_016860	T	7	7	1956831	1956837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_016860	TAA	2	6	1957775	1957780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_016860	AAT	2	6	1957785	1957790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_016860	TAA	2	6	1957882	1957887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_016860	T	6	6	1957893	1957898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_016860	GT	3	6	1958061	1958066	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_016860	AT	3	6	1958709	1958714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_016860	AGCA	2	8	1958715	1958722	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5116	NC_016860	TAG	2	6	1958828	1958833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_016860	TAAC	2	8	1958843	1958850	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5118	NC_016860	CTCAA	2	10	1958883	1958892	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5119	NC_016860	ATG	2	6	1958899	1958904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_016860	ATG	2	6	1958916	1958921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_016860	GCAC	2	8	1958985	1958992	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5122	NC_016860	CAT	2	6	1959052	1959057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_016860	AAT	2	6	1959059	1959064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_016860	CTG	2	6	1959071	1959076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5126	NC_016860	CTGC	2	8	1959106	1959113	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5127	NC_016860	ATG	2	6	1959369	1959374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5132	NC_016860	CAG	2	6	1959563	1959568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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