MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 12726

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016857	CAA	2	6	1549863	1549868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_016857	A	6	6	1549943	1549948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_016857	ATT	2	6	1549957	1549962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_016857	TTA	2	6	1550168	1550173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_016857	GA	3	6	1550176	1550181	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_016857	CG	3	6	1550577	1550582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4007	NC_016857	CGG	2	6	1550830	1550835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_016857	T	9	9	1550836	1550844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_016857	GCA	2	6	1550884	1550889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_016857	ATC	2	6	1550927	1550932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_016857	GGC	2	6	1550951	1550956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_016857	AAAAT	2	10	1550968	1550977	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_016857	T	6	6	1551051	1551056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_016857	A	6	6	1551057	1551062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_016857	TATT	2	8	1551114	1551121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_016857	CAG	2	6	1551191	1551196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_016857	AT	3	6	1551211	1551216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_016857	CCTG	2	8	1552459	1552466	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4019	NC_016857	ATG	2	6	1552517	1552522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_016857	GT	3	6	1552576	1552581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_016857	AAAAG	2	10	1552605	1552614	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_016857	TAA	2	6	1552664	1552669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_016857	AAG	2	6	1553599	1553604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_016857	GCG	2	6	1553641	1553646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_016857	A	7	7	1553671	1553677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_016857	T	6	6	1554342	1554347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_016857	TAAT	2	8	1554803	1554810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_016857	GC	3	6	1554977	1554982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4029	NC_016857	ATT	2	6	1557966	1557971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_016857	ATG	2	6	1557999	1558004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_016857	GA	3	6	1558024	1558029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_016857	AGC	2	6	1560783	1560788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_016857	CGT	2	6	1560790	1560795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_016857	AGC	2	6	1560837	1560842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_016857	AT	3	6	1560854	1560859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_016857	ACA	2	6	1560887	1560892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_016857	AGTT	2	8	1560896	1560903	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_016857	T	8	8	1560905	1560912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_016857	A	7	7	1560934	1560940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_016857	CAGGG	2	10	1560948	1560957	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4041	NC_016857	A	6	6	1562628	1562633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_016857	AGT	2	6	1562664	1562669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_016857	TTTG	2	8	1562688	1562695	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_016857	TTG	3	9	1562737	1562745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_016857	ACTT	2	8	1562753	1562760	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4046	NC_016857	TTA	2	6	1562767	1562772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_016857	CGAAG	2	10	1562857	1562866	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4048	NC_016857	AGT	2	6	1562879	1562884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_016857	AAAT	2	8	1562912	1562919	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_016857	AAG	2	6	1562948	1562953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_016857	ACTG	2	8	1562967	1562974	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4052	NC_016857	TTA	2	6	1563075	1563080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_016857	CAG	2	6	1563081	1563086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_016857	CCT	2	6	1564420	1564425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4055	NC_016857	TAT	2	6	1564456	1564461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_016857	TAT	2	6	1564478	1564483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_016857	T	6	6	1564505	1564510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_016857	GT	3	6	1566818	1566823	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_016857	TAGT	2	8	1571779	1571786	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_016857	CAT	2	6	1571792	1571797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_016857	TAG	2	6	1571830	1571835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_016857	AAC	2	6	1571856	1571861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_016857	TG	3	6	1571870	1571875	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_016857	GCTC	2	8	1572042	1572049	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4065	NC_016857	TTA	2	6	1572083	1572088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_016857	AATT	2	8	1572108	1572115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_016857	TGC	2	6	1572119	1572124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_016857	TTTAA	2	10	1572140	1572149	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_016857	ATCCA	2	10	1572157	1572166	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4070	NC_016857	ACAA	2	8	1572171	1572178	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4071	NC_016857	CATGC	2	10	1574145	1574154	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4072	NC_016857	CT	3	6	1576524	1576529	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4073	NC_016857	ATAA	2	8	1578216	1578223	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_016857	GAA	2	6	1578226	1578231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_016857	AAT	2	6	1578238	1578243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_016857	AAAAG	2	10	1581537	1581546	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_016857	AAC	3	9	1581618	1581626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_016857	TA	3	6	1581683	1581688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_016857	AG	3	6	1583398	1583403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_016857	CCT	2	6	1583947	1583952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4081	NC_016857	TGA	2	6	1583956	1583961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_016857	TAA	2	6	1583987	1583992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_016857	T	6	6	1584053	1584058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_016857	AAC	2	6	1584145	1584150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_016857	ATT	2	6	1584176	1584181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_016857	TGG	2	6	1584187	1584192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_016857	GGAT	2	8	1584208	1584215	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_016857	GCT	2	6	1584642	1584647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_016857	ATT	2	6	1584662	1584667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_016857	AT	4	8	1584709	1584716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_016857	AAT	2	6	1584727	1584732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_016857	ATT	2	6	1585688	1585693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_016857	GC	3	6	1585715	1585720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4094	NC_016857	TAT	2	6	1585747	1585752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_016857	CAA	2	6	1585753	1585758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_016857	AT	3	6	1585863	1585868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_016857	CAG	2	6	1585929	1585934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_016857	TGG	2	6	1585949	1585954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_016857	GTG	2	6	1586007	1586012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_016857	GCC	2	6	1586051	1586056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4101	NC_016857	TGA	2	6	1586068	1586073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_016857	GC	3	6	1586081	1586086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4103	NC_016857	TCC	2	6	1586167	1586172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4104	NC_016857	CCAGCG	2	12	1586180	1586191	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4105	NC_016857	GTT	2	6	1586289	1586294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_016857	CAG	2	6	1586328	1586333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_016857	TGGCG	2	10	1586344	1586353	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4108	NC_016857	CAG	2	6	1586369	1586374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_016857	TAT	2	6	1586544	1586549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_016857	A	6	6	1586607	1586612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_016857	TCCCT	2	10	1586633	1586642	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4112	NC_016857	GCA	2	6	1586702	1586707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_016857	CACGC	2	10	1586708	1586717	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4114	NC_016857	A	7	7	1586724	1586730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_016857	TCG	2	6	1586749	1586754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_016857	GCT	2	6	1586791	1586796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_016857	CTGA	2	8	1586801	1586808	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4118	NC_016857	ACA	2	6	1586867	1586872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_016857	TTG	2	6	1586879	1586884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_016857	GCA	2	6	1586952	1586957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_016857	AGC	2	6	1587049	1587054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_016857	TGG	2	6	1587100	1587105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_016857	ACC	2	6	1588736	1588741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4124	NC_016857	CTA	2	6	1588837	1588842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_016857	GAT	2	6	1588867	1588872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_016857	CGT	2	6	1589994	1589999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_016857	AGT	2	6	1590077	1590082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_016857	A	6	6	1592865	1592870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_016857	CCAC	2	8	1594998	1595005	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4130	NC_016857	ACA	2	6	1599383	1599388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_016857	GAA	2	6	1599392	1599397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_016857	AGA	2	6	1600327	1600332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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