MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 12726

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016857	CAT	3	9	1366335	1366343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_016857	TAA	2	6	1366467	1366472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_016857	TTCA	2	8	1366482	1366489	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3504	NC_016857	TCGT	2	8	1366499	1366506	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3505	NC_016857	AT	4	8	1366551	1366558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_016857	GTAC	2	8	1366601	1366608	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3507	NC_016857	TCAT	2	8	1366634	1366641	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3508	NC_016857	GAT	2	6	1366695	1366700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_016857	TAA	3	9	1366745	1366753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_016857	CGG	2	6	1366755	1366760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_016857	ATC	3	9	1366793	1366801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_016857	AT	3	6	1366825	1366830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_016857	ATG	2	6	1366852	1366857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_016857	CAA	2	6	1366870	1366875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_016857	CGG	2	6	1366917	1366922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_016857	GCC	2	6	1366927	1366932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3517	NC_016857	A	6	6	1368177	1368182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_016857	TCT	2	6	1368235	1368240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_016857	TCA	2	6	1368279	1368284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_016857	GCA	2	6	1368382	1368387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_016857	TA	3	6	1368443	1368448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_016857	TCA	2	6	1368466	1368471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_016857	CGA	2	6	1368521	1368526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_016857	CAT	2	6	1368589	1368594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_016857	AGC	2	6	1368627	1368632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_016857	TGC	2	6	1368695	1368700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_016857	ATAG	2	8	1368721	1368728	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_016857	GTC	2	6	1368731	1368736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_016857	CAT	2	6	1368804	1368809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_016857	GT	3	6	1368831	1368836	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_016857	T	7	7	1368877	1368883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_016857	CAT	3	9	1368892	1368900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_016857	CAC	2	6	1369031	1369036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3534	NC_016857	TTA	2	6	1371594	1371599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_016857	CT	3	6	1372257	1372262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3536	NC_016857	TTTA	2	8	1372263	1372270	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_016857	GCT	2	6	1372356	1372361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_016857	T	7	7	1372374	1372380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_016857	AGG	2	6	1372399	1372404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_016857	ACGAA	2	10	1372419	1372428	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3541	NC_016857	A	6	6	1372438	1372443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_016857	CCT	2	6	1372445	1372450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3543	NC_016857	T	7	7	1372460	1372466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_016857	GA	3	6	1372479	1372484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_016857	CATC	2	8	1376238	1376245	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3546	NC_016857	T	6	6	1376357	1376362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_016857	AAC	2	6	1377415	1377420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_016857	TCA	2	6	1377426	1377431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_016857	TTG	2	6	1378863	1378868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_016857	TGT	2	6	1379402	1379407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_016857	CAT	2	6	1379408	1379413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_016857	AT	3	6	1379412	1379417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_016857	TTA	2	6	1379451	1379456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_016857	A	7	7	1379524	1379530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_016857	ATG	2	6	1379559	1379564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_016857	TCCG	2	8	1379598	1379605	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3557	NC_016857	AGG	2	6	1380416	1380421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_016857	CAG	2	6	1381877	1381882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_016857	CTG	2	6	1381889	1381894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_016857	TATT	2	8	1382097	1382104	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_016857	AAT	2	6	1382105	1382110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_016857	ATT	3	9	1382124	1382132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_016857	AAT	2	6	1382136	1382141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_016857	CG	4	8	1382183	1382190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3565	NC_016857	GA	3	6	1382191	1382196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_016857	GAA	2	6	1382216	1382221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_016857	TTG	2	6	1383314	1383319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_016857	CTG	2	6	1383371	1383376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_016857	GCAG	2	8	1383405	1383412	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3570	NC_016857	AACC	2	8	1383430	1383437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3571	NC_016857	TAAT	2	8	1384392	1384399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_016857	GT	3	6	1384405	1384410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_016857	A	6	6	1384499	1384504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_016857	A	6	6	1384507	1384512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_016857	T	7	7	1384537	1384543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_016857	GGC	2	6	1387015	1387020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3578	NC_016857	CCG	2	6	1390366	1390371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3579	NC_016857	CGA	2	6	1390375	1390380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_016857	CTGA	2	8	1392168	1392175	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3581	NC_016857	CAA	2	6	1392231	1392236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_016857	A	6	6	1392245	1392250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_016857	AAT	2	6	1392319	1392324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_016857	ATC	2	6	1392338	1392343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3586	NC_016857	TGT	2	6	1392367	1392372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_016857	ATA	2	6	1392428	1392433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_016857	ATA	2	6	1392472	1392477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_016857	AAT	2	6	1392494	1392499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_016857	ACA	2	6	1392529	1392534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_016857	CGCT	2	8	1392539	1392546	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3592	NC_016857	AT	3	6	1393488	1393493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_016857	TAT	2	6	1396328	1396333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_016857	TAA	2	6	1396368	1396373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_016857	TATT	2	8	1396420	1396427	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_016857	TCG	2	6	1397249	1397254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_016857	TAA	2	6	1398151	1398156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_016857	AAT	2	6	1398214	1398219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_016857	ATA	2	6	1398263	1398268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_016857	AATA	2	8	1398272	1398279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_016857	AAT	2	6	1398281	1398286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_016857	AGT	2	6	1398303	1398308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_016857	AT	3	6	1398333	1398338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_016857	TAG	2	6	1398349	1398354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_016857	AG	3	6	1398353	1398358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_016857	C	6	6	1398396	1398401	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3607	NC_016857	ATC	2	6	1398402	1398407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_016857	AT	4	8	1398408	1398415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_016857	CAG	2	6	1398487	1398492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_016857	T	7	7	1398616	1398622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_016857	TAA	2	6	1398669	1398674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_016857	CCAG	2	8	1398802	1398809	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3613	NC_016857	TGA	2	6	1398901	1398906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_016857	ACC	2	6	1398930	1398935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3615	NC_016857	CCG	2	6	1399076	1399081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3616	NC_016857	AC	4	8	1399109	1399116	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3617	NC_016857	ATC	2	6	1399133	1399138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_016857	GAA	2	6	1399162	1399167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_016857	AT	3	6	1399175	1399180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_016857	TAT	2	6	1399198	1399203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_016857	GAC	2	6	1399257	1399262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_016857	TAA	2	6	1399350	1399355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_016857	AAAT	2	8	1399382	1399389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_016857	CAGC	2	8	1399398	1399405	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3625	NC_016857	TTA	2	6	1399483	1399488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_016857	TAC	2	6	1399495	1399500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_016857	CATTT	2	10	1399593	1399602	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3628	NC_016857	TGC	2	6	1399625	1399630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_016857	TGT	2	6	1399636	1399641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_016857	AAT	3	9	1399700	1399708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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