MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 12726

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016857	CTTCA	2	10	613032	613041	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1502	NC_016857	TGA	2	6	613299	613304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_016857	GCTC	2	8	613336	613343	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_016857	TC	3	6	613410	613415	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1505	NC_016857	ACG	2	6	613499	613504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_016857	TCAT	2	8	613613	613620	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1507	NC_016857	T	8	8	613652	613659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_016857	CGG	2	6	613704	613709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_016857	ATC	2	6	613721	613726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_016857	TGG	2	6	613749	613754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_016857	CTT	2	6	613771	613776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_016857	GTA	2	6	613799	613804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_016857	GCG	2	6	613820	613825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_016857	CT	3	6	613912	613917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1515	NC_016857	TGG	2	6	614060	614065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_016857	T	6	6	614161	614166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_016857	CTT	2	6	614188	614193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_016857	CGC	2	6	614243	614248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_016857	TGG	2	6	614260	614265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_016857	ATTA	2	8	614274	614281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_016857	AAT	2	6	617282	617287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_016857	TTA	2	6	617320	617325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_016857	GTT	2	6	617333	617338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_016857	AGT	2	6	617367	617372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_016857	AC	3	6	617389	617394	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_016857	GTA	2	6	617456	617461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_016857	TTG	2	6	617472	617477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_016857	GC	3	6	617537	617542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_016857	GCG	3	9	617582	617590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_016857	CTC	2	6	617660	617665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_016857	ATT	2	6	617696	617701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_016857	GTC	2	6	617735	617740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_016857	TCA	2	6	617836	617841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_016857	A	7	7	617909	617915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_016857	TAA	2	6	617967	617972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_016857	ATA	2	6	617978	617983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_016857	GTT	2	6	617989	617994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_016857	ATT	2	6	618033	618038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_016857	CAG	2	6	618427	618432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_016857	GCG	2	6	618712	618717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_016857	ATTT	2	8	619617	619624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_016857	ACC	2	6	619703	619708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1543	NC_016857	A	6	6	619726	619731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_016857	T	6	6	619756	619761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_016857	TTAT	2	8	619766	619773	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_016857	ATAA	2	8	621145	621152	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_016857	T	8	8	621174	621181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_016857	GAAA	2	8	621228	621235	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_016857	TAT	2	6	621257	621262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_016857	TCG	2	6	622137	622142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_016857	TGA	2	6	622172	622177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_016857	ATG	2	6	622178	622183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_016857	A	6	6	623434	623439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_016857	GC	3	6	623533	623538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1555	NC_016857	CTTTT	2	10	623542	623551	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1556	NC_016857	T	7	7	623568	623574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_016857	TAACGT	2	12	623581	623592	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1558	NC_016857	T	6	6	625083	625088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_016857	TC	3	6	626373	626378	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1560	NC_016857	CAG	2	6	626388	626393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_016857	ATG	2	6	626397	626402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_016857	CTG	2	6	626404	626409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_016857	CGT	2	6	626522	626527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_016857	CAA	2	6	626570	626575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_016857	TGAA	2	8	626576	626583	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_016857	AGGG	2	8	628661	628668	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_016857	CGTT	2	8	628676	628683	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1568	NC_016857	AGTA	2	8	628727	628734	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_016857	CGT	2	6	628763	628768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_016857	AGA	2	6	631587	631592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_016857	TAA	2	6	632719	632724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_016857	TTAT	2	8	636382	636389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_016857	A	6	6	636480	636485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_016857	TGGT	2	8	637179	637186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_016857	CAG	2	6	637204	637209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_016857	GGA	2	6	637238	637243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_016857	GTCGC	2	10	638264	638273	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1578	NC_016857	ACTC	2	8	638340	638347	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_016857	TG	3	6	638419	638424	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_016857	TTA	2	6	638426	638431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_016857	TGCGG	2	10	638459	638468	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1582	NC_016857	TCCC	2	8	641014	641021	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1583	NC_016857	GAGG	2	8	641027	641034	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_016857	GTG	2	6	643362	643367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_016857	CG	3	6	643378	643383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1586	NC_016857	TGCAAA	2	12	643408	643419	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1587	NC_016857	AAT	2	6	643428	643433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_016857	AT	3	6	643441	643446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_016857	TA	3	6	643456	643461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_016857	ATA	2	6	643470	643475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_016857	GTT	2	6	648840	648845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_016857	ATA	2	6	648877	648882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_016857	ATT	2	6	648890	648895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_016857	T	6	6	648901	648906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_016857	TCA	2	6	650257	650262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_016857	TATC	2	8	653094	653101	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1597	NC_016857	A	7	7	653145	653151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_016857	TTA	2	6	655447	655452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_016857	ATA	2	6	655577	655582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_016857	ATT	2	6	655586	655591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_016857	AAG	2	6	655608	655613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_016857	GAA	2	6	655630	655635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_016857	TG	3	6	655657	655662	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_016857	CAA	2	6	655684	655689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_016857	TA	3	6	655714	655719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_016857	GGA	2	6	655733	655738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_016857	AG	3	6	658546	658551	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_016857	GCA	2	6	660604	660609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_016857	GAA	2	6	660615	660620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_016857	TGTAA	2	10	660642	660651	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_016857	A	6	6	660650	660655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_016857	TGT	3	9	660679	660687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_016857	GTT	2	6	660688	660693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_016857	TC	3	6	660731	660736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1615	NC_016857	ACA	2	6	660753	660758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_016857	TCT	2	6	664271	664276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_016857	GTT	2	6	664281	664286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_016857	AAT	2	6	667406	667411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_016857	TAT	2	6	667453	667458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_016857	AT	3	6	667472	667477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_016857	CTT	2	6	667524	667529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_016857	AAT	2	6	668485	668490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_016857	TTA	2	6	668506	668511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_016857	TTTA	2	8	668526	668533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_016857	AAT	2	6	668571	668576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_016857	GCC	2	6	669764	669769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1627	NC_016857	GGC	2	6	669775	669780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_016857	GTT	2	6	669836	669841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_016857	TTGAT	2	10	669854	669863	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_016857	CTC	2	6	669907	669912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1631	NC_016857	GGA	2	6	669924	669929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_016857	CGT	2	6	670506	670511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_016857	ACTT	2	8	670556	670563	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1634	NC_016857	GCC	2	6	670592	670597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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