MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 12726

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016857	CAA	2	6	373395	373400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_016857	GAA	3	9	373418	373426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_016857	TGC	2	6	373447	373452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_016857	ATGA	2	8	373496	373503	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_016857	GAC	2	6	373560	373565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_016857	TGA	2	6	373590	373595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_016857	GCG	4	12	373610	373621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_016857	CA	3	6	377404	377409	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_016857	GATT	2	8	377428	377435	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_016857	ACT	2	6	377441	377446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_016857	TAT	2	6	377479	377484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_016857	A	6	6	377510	377515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_016857	CCAT	2	8	377521	377528	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_016857	CA	3	6	377617	377622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_016857	CTCATT	2	12	377670	377681	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_016857	AATGT	2	10	377691	377700	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_016857	GCA	2	6	377733	377738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_016857	ATT	2	6	377793	377798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_016857	TCT	2	6	377862	377867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_016857	TTTC	2	8	377871	377878	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_016857	TGAAA	2	10	377975	377984	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_016857	TA	3	6	378003	378008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_016857	CAA	2	6	383828	383833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_016857	GGA	2	6	384495	384500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_016857	CCT	2	6	384549	384554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_016857	AAAC	2	8	384576	384583	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_016857	TTGA	2	8	384666	384673	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_016857	TC	3	6	384692	384697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_016857	ATAG	2	8	384707	384714	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_016857	ATA	2	6	384783	384788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_016857	T	6	6	384851	384856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_016857	ATT	2	6	384966	384971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_016857	T	6	6	385028	385033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_016857	ATA	2	6	385041	385046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_016857	GTC	2	6	385048	385053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_016857	ATA	2	6	385863	385868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_016857	AAT	2	6	385905	385910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_016857	ATGG	2	8	385962	385969	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_016857	TAC	2	6	386021	386026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_016857	T	8	8	386047	386054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_016857	CTG	2	6	386143	386148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_016857	TG	3	6	386261	386266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_016857	ACC	2	6	386268	386273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_016857	AGT	2	6	386274	386279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_016857	AAT	2	6	386297	386302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_016857	TCA	2	6	386340	386345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_016857	TC	3	6	386502	386507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_016857	AAGG	2	8	386567	386574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_016857	A	7	7	388187	388193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_016857	AT	3	6	388206	388211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_016857	TGT	2	6	389480	389485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_016857	T	6	6	389584	389589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_016857	GATGC	2	10	389645	389654	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1054	NC_016857	TAA	2	6	389690	389695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_016857	A	6	6	389694	389699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_016857	AT	3	6	389739	389744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_016857	TAA	2	6	389779	389784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_016857	TG	3	6	389817	389822	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_016857	TA	3	6	389848	389853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_016857	ATA	2	6	390441	390446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_016857	GCT	2	6	390451	390456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_016857	TGA	2	6	390532	390537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_016857	TTA	2	6	391442	391447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_016857	AT	3	6	391852	391857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_016857	GC	5	10	391867	391876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_016857	CAT	2	6	397921	397926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_016857	GTC	2	6	398040	398045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_016857	CA	3	6	400869	400874	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1069	NC_016857	CGCTT	2	10	401133	401142	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1070	NC_016857	TAA	2	6	401203	401208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_016857	TA	3	6	401249	401254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_016857	GAC	2	6	401304	401309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_016857	T	6	6	401352	401357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_016857	TCC	2	6	402670	402675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_016857	CGT	2	6	402676	402681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1077	NC_016857	ATG	2	6	402714	402719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_016857	ATC	2	6	402745	402750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_016857	T	6	6	402757	402762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_016857	ATTG	2	8	402774	402781	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_016857	TGAA	2	8	407764	407771	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_016857	GCC	2	6	407809	407814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_016857	AGCG	2	8	407819	407826	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_016857	CCCGT	2	10	407854	407863	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1085	NC_016857	T	7	7	407959	407965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_016857	CGTTT	2	10	408181	408190	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1087	NC_016857	TA	4	8	408231	408238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_016857	GGGA	2	8	408242	408249	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_016857	ATT	2	6	410906	410911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_016857	CCG	2	6	412028	412033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_016857	T	6	6	412063	412068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_016857	TAA	2	6	412125	412130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_016857	TTA	2	6	414970	414975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_016857	GAT	2	6	414988	414993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1096	NC_016857	ACT	2	6	415082	415087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_016857	GAT	2	6	415128	415133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_016857	TAA	3	9	415138	415146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_016857	CAT	2	6	415446	415451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_016857	CGG	2	6	415473	415478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_016857	TATT	2	8	415482	415489	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_016857	T	6	6	417226	417231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_016857	T	9	9	417302	417310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_016857	CTTTG	2	10	417409	417418	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1105	NC_016857	GCC	2	6	418373	418378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_016857	TACGG	2	10	418416	418425	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1107	NC_016857	AAT	2	6	418455	418460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_016857	TTA	2	6	419650	419655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_016857	GC	3	6	423143	423148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_016857	GCAG	2	8	424186	424193	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1111	NC_016857	CGG	4	12	424235	424246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_016857	CTT	2	6	424256	424261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_016857	TA	3	6	424263	424268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_016857	GTT	2	6	424322	424327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_016857	ATT	2	6	424372	424377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_016857	T	7	7	424428	424434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_016857	TTA	2	6	424487	424492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_016857	AAT	2	6	424534	424539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_016857	CGC	2	6	424558	424563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_016857	CTT	2	6	424570	424575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_016857	GAG	2	6	424636	424641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_016857	TC	3	6	427594	427599	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_016857	ATT	2	6	427654	427659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_016857	CGA	2	6	428334	428339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1126	NC_016857	TAC	2	6	429542	429547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_016857	CGG	2	6	429549	429554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_016857	A	6	6	429577	429582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_016857	A	6	6	429590	429595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_016857	CGG	2	6	429601	429606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_016857	CTG	2	6	429675	429680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_016857	TCG	2	6	429691	429696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_016857	GCC	2	6	429794	429799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_016857	CAG	2	6	429804	429809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_016857	TAA	2	6	429813	429818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1137	NC_016857	GC	3	6	432200	432205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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