MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 12726

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016857	CAA	2	6	1910934	1910939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_016857	ACA	2	6	1910949	1910954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_016857	TAA	2	6	1911392	1911397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_016857	CCGA	2	8	1911493	1911500	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5005	NC_016857	GCA	2	6	1911502	1911507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_016857	ACA	2	6	1911527	1911532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_016857	TCTA	2	8	1911610	1911617	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5008	NC_016857	A	6	6	1911692	1911697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_016857	TCT	2	6	1912192	1912197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_016857	ATTA	2	8	1912234	1912241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_016857	CAG	2	6	1912260	1912265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_016857	TAT	2	6	1912288	1912293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_016857	TA	3	6	1912316	1912321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_016857	GCC	2	6	1912353	1912358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5015	NC_016857	GT	3	6	1912490	1912495	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_016857	CAA	2	6	1912502	1912507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_016857	AT	3	6	1912512	1912517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_016857	GCA	2	6	1912566	1912571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_016857	TTAA	2	8	1913045	1913052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_016857	GTTT	2	8	1913068	1913075	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_016857	CAC	2	6	1913295	1913300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5022	NC_016857	GAT	2	6	1913349	1913354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_016857	AAGG	2	8	1913687	1913694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_016857	AGA	2	6	1913958	1913963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_016857	AG	3	6	1914027	1914032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_016857	TTA	2	6	1914082	1914087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_016857	ATA	2	6	1914119	1914124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_016857	GCC	2	6	1914141	1914146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5029	NC_016857	T	6	6	1914169	1914174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_016857	ATAA	2	8	1914195	1914202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_016857	CGG	2	6	1914315	1914320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_016857	CATC	2	8	1914410	1914417	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5033	NC_016857	GCC	2	6	1914427	1914432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5034	NC_016857	TCGG	2	8	1914436	1914443	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5035	NC_016857	TGG	2	6	1914457	1914462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_016857	CA	3	6	1914587	1914592	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5037	NC_016857	GCCA	2	8	1914672	1914679	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5038	NC_016857	TTG	2	6	1914738	1914743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_016857	GAC	2	6	1914770	1914775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_016857	CGT	2	6	1914892	1914897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_016857	CGA	2	6	1914916	1914921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_016857	CTT	2	6	1914995	1915000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_016857	AGC	2	6	1915002	1915007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_016857	GT	3	6	1915039	1915044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_016857	CAGC	2	8	1915147	1915154	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5046	NC_016857	TTAC	2	8	1915336	1915343	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5047	NC_016857	TCAGT	2	10	1915348	1915357	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5048	NC_016857	ATT	2	6	1915361	1915366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_016857	CCTT	2	8	1915432	1915439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5050	NC_016857	ATT	2	6	1915874	1915879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_016857	A	7	7	1915904	1915910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_016857	ATTA	2	8	1915977	1915984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_016857	CAAA	2	8	1916101	1916108	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5054	NC_016857	CAA	2	6	1916195	1916200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_016857	CCG	2	6	1916277	1916282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5056	NC_016857	CATCA	2	10	1916368	1916377	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5057	NC_016857	GGT	2	6	1916434	1916439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_016857	TCC	2	6	1916505	1916510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5059	NC_016857	T	6	6	1916538	1916543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_016857	AAAC	2	8	1916557	1916564	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5061	NC_016857	ATT	2	6	1916566	1916571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_016857	CTT	2	6	1916668	1916673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_016857	ATC	2	6	1916755	1916760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_016857	CAA	2	6	1916799	1916804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_016857	ATG	2	6	1916817	1916822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_016857	CTG	2	6	1916882	1916887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_016857	TAT	2	6	1916939	1916944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_016857	TCT	2	6	1916968	1916973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_016857	A	6	6	1917001	1917006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_016857	GAA	2	6	1917013	1917018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_016857	T	6	6	1917027	1917032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_016857	T	7	7	1917054	1917060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_016857	TAA	2	6	1917998	1918003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_016857	AAT	2	6	1918008	1918013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_016857	TAA	2	6	1918105	1918110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_016857	T	6	6	1918116	1918121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_016857	GT	3	6	1918284	1918289	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_016857	AT	3	6	1918932	1918937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_016857	AGCA	2	8	1918938	1918945	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5080	NC_016857	TAG	2	6	1919051	1919056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_016857	TAAC	2	8	1919066	1919073	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5082	NC_016857	CTCAA	2	10	1919106	1919115	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5083	NC_016857	ATG	2	6	1919122	1919127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_016857	ATG	2	6	1919139	1919144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_016857	GCAC	2	8	1919208	1919215	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5086	NC_016857	CAT	2	6	1919275	1919280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_016857	AAT	2	6	1919282	1919287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_016857	CTG	2	6	1919294	1919299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_016857	TAA	2	6	1919317	1919322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_016857	CTGC	2	8	1919329	1919336	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5091	NC_016857	CCA	2	6	1919370	1919375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5092	NC_016857	ATG	2	6	1919592	1919597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_016857	ATT	2	6	1919840	1919845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_016857	AT	3	6	1919879	1919884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_016857	A	6	6	1919940	1919945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_016857	TTTA	2	8	1919962	1919969	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_016857	GCC	2	6	1920011	1920016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5098	NC_016857	CAG	2	6	1920201	1920206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_016857	AG	3	6	1920234	1920239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_016857	GCG	2	6	1920354	1920359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_016857	TGGC	2	8	1920443	1920450	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5102	NC_016857	TGAAG	2	10	1920460	1920469	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_016857	TTGA	2	8	1920470	1920477	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_016857	AACA	2	8	1920481	1920488	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5105	NC_016857	TCC	2	6	1920514	1920519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5106	NC_016857	GAGC	2	8	1920524	1920531	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5107	NC_016857	AATT	2	8	1920572	1920579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_016857	AAATA	2	10	1920588	1920597	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_016857	TTTA	2	8	1920615	1920622	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_016857	TTTA	2	8	1920646	1920653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_016857	GACA	2	8	1920988	1920995	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5112	NC_016857	CTT	2	6	1920999	1921004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_016857	TCC	2	6	1921938	1921943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5114	NC_016857	CAC	2	6	1921988	1921993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5115	NC_016857	CCG	2	6	1922047	1922052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5116	NC_016857	GC	3	6	1922368	1922373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5117	NC_016857	A	6	6	1922404	1922409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_016857	CAT	2	6	1922419	1922424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_016857	AAAT	2	8	1922432	1922439	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_016857	AG	3	6	1922451	1922456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_016857	ATT	2	6	1922589	1922594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_016857	AAC	2	6	1922630	1922635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_016857	AC	3	6	1922634	1922639	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5124	NC_016857	AGG	2	6	1922859	1922864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_016857	AGA	2	6	1922895	1922900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_016857	GTT	2	6	1922912	1922917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_016857	CAGA	2	8	1922942	1922949	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5128	NC_016857	CCG	2	6	1923641	1923646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5129	NC_016857	TGT	2	6	1925494	1925499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_016857	TAAA	2	8	1925616	1925623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_016857	GA	3	6	1925673	1925678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5133	NC_016857	T	6	6	1925846	1925851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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