MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 12726

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016857	ACA	2	6	1723706	1723711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_016857	ATTCA	2	10	1723754	1723763	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4503	NC_016857	GATG	2	8	1724116	1724123	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_016857	T	6	6	1724169	1724174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_016857	TAC	2	6	1724777	1724782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_016857	CTA	2	6	1724826	1724831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_016857	TCG	2	6	1726542	1726547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_016857	TAA	2	6	1726626	1726631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_016857	T	6	6	1726644	1726649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_016857	TGCT	2	8	1726669	1726676	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4511	NC_016857	AAT	2	6	1726791	1726796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_016857	C	6	6	1727710	1727715	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4513	NC_016857	TCTA	2	8	1727790	1727797	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4514	NC_016857	CGG	2	6	1728758	1728763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_016857	GGC	2	6	1728806	1728811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_016857	ATT	2	6	1730500	1730505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_016857	CAG	2	6	1730511	1730516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_016857	CGG	2	6	1730593	1730598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_016857	ACA	2	6	1730606	1730611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_016857	GAT	2	6	1730616	1730621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_016857	AAT	2	6	1732383	1732388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_016857	CTG	2	6	1732953	1732958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_016857	AAG	2	6	1733001	1733006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_016857	CTT	2	6	1733023	1733028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_016857	AAT	2	6	1734591	1734596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_016857	GAT	2	6	1734610	1734615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_016857	AGGA	2	8	1734635	1734642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_016857	CAA	2	6	1734649	1734654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_016857	GCG	2	6	1734686	1734691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_016857	GAAGA	2	10	1737197	1737206	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_016857	A	6	6	1737206	1737211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_016857	TAA	2	6	1737212	1737217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_016857	TTA	2	6	1737249	1737254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_016857	GA	3	6	1737266	1737271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_016857	CAA	2	6	1737273	1737278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_016857	CA	3	6	1737671	1737676	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4537	NC_016857	AT	3	6	1737949	1737954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_016857	TGA	2	6	1738564	1738569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_016857	GCC	2	6	1738588	1738593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4540	NC_016857	ATA	2	6	1739357	1739362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_016857	A	6	6	1739392	1739397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_016857	GTG	2	6	1739405	1739410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_016857	GAC	2	6	1740439	1740444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_016857	CCACT	2	10	1746548	1746557	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4545	NC_016857	ATCA	2	8	1746594	1746601	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4546	NC_016857	AT	3	6	1746615	1746620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_016857	A	6	6	1746621	1746626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_016857	A	7	7	1746633	1746639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_016857	AT	3	6	1746642	1746647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_016857	TTC	2	6	1746690	1746695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_016857	TAC	2	6	1746718	1746723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_016857	AAC	2	6	1746728	1746733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_016857	ACG	2	6	1746740	1746745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_016857	TGT	2	6	1746812	1746817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_016857	AAT	2	6	1746942	1746947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_016857	AAT	2	6	1748914	1748919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_016857	A	6	6	1748956	1748961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_016857	GCGG	2	8	1749795	1749802	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4559	NC_016857	TGC	2	6	1749811	1749816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_016857	CTCA	2	8	1749826	1749833	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4561	NC_016857	TA	3	6	1749847	1749852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_016857	ATCG	2	8	1749946	1749953	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4563	NC_016857	TGC	2	6	1751135	1751140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_016857	CTCA	2	8	1753144	1753151	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4565	NC_016857	TTTCT	2	10	1753180	1753189	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4566	NC_016857	TCT	3	9	1753187	1753195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_016857	TTAT	2	8	1753334	1753341	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_016857	CTTT	2	8	1753354	1753361	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4569	NC_016857	CGA	2	6	1755381	1755386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_016857	CAT	2	6	1755457	1755462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_016857	ATT	2	6	1755684	1755689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_016857	CT	3	6	1755719	1755724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4573	NC_016857	CTGT	2	8	1755727	1755734	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4574	NC_016857	CTC	2	6	1755738	1755743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4575	NC_016857	ATC	2	6	1756548	1756553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_016857	CT	4	8	1756554	1756561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4577	NC_016857	TGT	2	6	1756598	1756603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_016857	CGT	2	6	1756615	1756620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_016857	TTTTA	2	10	1756712	1756721	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_016857	TATAGT	2	12	1756724	1756735	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_016857	GA	3	6	1756765	1756770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_016857	ATA	2	6	1757025	1757030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_016857	CTT	2	6	1758186	1758191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_016857	GAT	2	6	1758192	1758197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_016857	GCG	2	6	1758245	1758250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_016857	CGT	2	6	1758307	1758312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_016857	TGT	2	6	1758336	1758341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_016857	T	7	7	1758356	1758362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_016857	CG	3	6	1759936	1759941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4590	NC_016857	CCA	2	6	1759956	1759961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4591	NC_016857	GAT	2	6	1759965	1759970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_016857	TAAG	2	8	1760781	1760788	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_016857	CCG	2	6	1760882	1760887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4594	NC_016857	CGA	2	6	1760923	1760928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_016857	GCCT	2	8	1761574	1761581	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4596	NC_016857	CTC	2	6	1764286	1764291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4597	NC_016857	ACAA	2	8	1764348	1764355	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4598	NC_016857	AAC	2	6	1764372	1764377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_016857	ATAA	2	8	1764435	1764442	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_016857	ATA	2	6	1764507	1764512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_016857	TGC	2	6	1764610	1764615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_016857	TAA	2	6	1764620	1764625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_016857	TAA	2	6	1764634	1764639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_016857	ATC	2	6	1765028	1765033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_016857	TAAA	2	8	1765049	1765056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_016857	AATC	2	8	1765103	1765110	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4607	NC_016857	GGC	2	6	1765214	1765219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_016857	TGCCA	2	10	1765226	1765235	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4609	NC_016857	CAT	2	6	1766239	1766244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_016857	GCT	2	6	1766291	1766296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_016857	TAA	3	9	1766306	1766314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_016857	A	6	6	1766313	1766318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_016857	ATA	2	6	1766377	1766382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_016857	AAT	2	6	1766399	1766404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_016857	GGC	2	6	1766419	1766424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_016857	GAGT	2	8	1766429	1766436	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_016857	ATGG	2	8	1766533	1766540	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_016857	A	6	6	1766593	1766598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_016857	GAC	2	6	1766630	1766635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_016857	TTC	2	6	1769264	1769269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_016857	CGA	2	6	1769306	1769311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_016857	AT	3	6	1769319	1769324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_016857	TCTGCG	2	12	1769329	1769340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_016857	T	6	6	1769406	1769411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_016857	CA	3	6	1769413	1769418	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4626	NC_016857	ACG	2	6	1769430	1769435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_016857	TTA	2	6	1769519	1769524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_016857	ACA	2	6	1771026	1771031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_016857	AGTC	2	8	1771040	1771047	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4630	NC_016857	TC	3	6	1771046	1771051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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