MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 1455

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016856	AGAC	2	8	153	160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016856	CTGT	2	8	8666	8673	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016856	TTAT	2	8	23265	23272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016856	CCAG	2	8	33346	33353	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016856	TGAT	2	8	35032	35039	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016856	ATTA	2	8	38765	38772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016856	AATT	2	8	40048	40055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016856	TGAC	2	8	46042	46049	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016856	TACC	2	8	48321	48328	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016856	AGTA	2	8	51937	51944	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016856	ATCA	2	8	51977	51984	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016856	GAAA	2	8	52097	52104	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016856	AGGG	2	8	52130	52137	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016856	TACT	2	8	63482	63489	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016856	TTTC	2	8	63490	63497	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_016856	TAAT	2	8	68492	68499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016856	ATAA	2	8	74943	74950	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016856	GCCA	2	8	75616	75623	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016856	ACTG	2	8	75824	75831	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_016856	AGTG	2	8	75853	75860	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016856	TATT	2	8	81059	81066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016856	ATTT	2	8	88941	88948	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016856	GTTT	2	8	88968	88975	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016856	CAGG	2	8	94635	94642	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016856	CCCA	2	8	95889	95896	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_016856	TTTC	2	8	96342	96349	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_016856	TTAT	2	8	96527	96534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016856	ATCA	2	8	106512	106519	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016856	AATG	2	8	109991	109998	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016856	GTTC	2	8	116816	116823	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016856	GAGT	2	8	116944	116951	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016856	ATGG	2	8	117049	117056	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016856	TTTA	2	8	117166	117173	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016856	GTTT	2	8	117299	117306	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016856	TAAT	2	8	117307	117314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016856	TAAA	2	8	117390	117397	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016856	TCCA	2	8	122020	122027	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016856	CAGG	2	8	122074	122081	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_016856	TTTG	2	8	134517	134524	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016856	TTTG	2	8	134828	134835	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016856	AGCG	2	8	136489	136496	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_016856	CAAA	2	8	140091	140098	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016856	CTTT	2	8	140173	140180	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016856	GCCG	2	8	162730	162737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016856	CTGG	2	8	165814	165821	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016856	ATTT	2	8	175563	175570	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016856	TCAA	2	8	175919	175926	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016856	TAGA	2	8	176931	176938	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016856	CGGC	2	8	181538	181545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016856	GGCG	2	8	184771	184778	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51	NC_016856	GAGC	2	8	185669	185676	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016856	CATC	2	8	185696	185703	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016856	TGGC	2	8	185824	185831	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016856	TGCC	2	8	186213	186220	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016856	TTGA	2	8	190845	190852	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016856	GAAT	2	8	201419	201426	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016856	AAGT	2	8	202870	202877	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016856	AACG	2	8	217091	217098	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_016856	ACGC	2	8	217692	217699	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016856	ATAA	2	8	224264	224271	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016856	AAAT	2	8	230904	230911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016856	AAAT	2	8	230982	230989	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016856	TTAT	2	8	231204	231211	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016856	TGCC	2	8	248959	248966	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016856	GTTG	2	8	249867	249874	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016856	ATAA	2	8	250835	250842	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016856	TCAG	2	8	254612	254619	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_016856	ACTG	2	8	254704	254711	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016856	GAAA	2	8	256972	256979	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016856	TTAG	2	8	263058	263065	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016856	GCAG	2	8	274854	274861	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_016856	GTAT	3	12	282843	282854	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016856	CACT	2	8	283084	283091	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_016856	AATG	2	8	286116	286123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016856	ATCA	2	8	288856	288863	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_016856	GTAG	2	8	291313	291320	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016856	CTGA	2	8	292369	292376	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_016856	GTAC	2	8	292453	292460	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_016856	CGTC	2	8	292995	293002	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_016856	AAAG	2	8	293118	293125	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016856	CGTT	2	8	293295	293302	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016856	AGTC	2	8	293865	293872	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_016856	GCTG	2	8	293883	293890	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_016856	TGAC	2	8	295150	295157	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_016856	CCTG	2	8	295555	295562	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_016856	CCGT	2	8	295590	295597	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016856	TTTC	2	8	295639	295646	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_016856	AGTG	2	8	298839	298846	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016856	CCTG	2	8	304994	305001	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016856	CCGT	2	8	305029	305036	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_016856	TATT	2	8	311542	311549	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016856	ATAA	2	8	311583	311590	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016856	CTGG	2	8	318092	318099	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016856	AAGA	2	8	319274	319281	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016856	TATT	2	8	330522	330529	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016856	TAAA	2	8	340299	340306	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016856	TTAT	2	8	340310	340317	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016856	GCTG	2	8	340327	340334	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_016856	GTGA	2	8	340350	340357	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016856	CCTC	2	8	340385	340392	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
101	NC_016856	GTCA	2	8	340509	340516	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016856	TGCT	2	8	340715	340722	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_016856	AATC	2	8	341412	341419	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_016856	AAGG	2	8	342319	342326	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016856	GTCA	2	8	342366	342373	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_016856	ATGT	2	8	342500	342507	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016856	TGAT	2	8	347383	347390	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016856	TTTG	2	8	347491	347498	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016856	GTTT	2	8	347543	347550	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016856	ATTT	2	8	347629	347636	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016856	GATG	2	8	349141	349148	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016856	TGCC	2	8	352323	352330	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_016856	CTTG	2	8	355740	355747	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_016856	GTTG	2	8	356576	356583	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016856	CTGA	2	8	360065	360072	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_016856	TTCG	2	8	360211	360218	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_016856	GCTG	2	8	360588	360595	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_016856	TGCC	2	8	360837	360844	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_016856	ATCA	2	8	369562	369569	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_016856	AAAG	2	8	371357	371364	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016856	AATA	2	8	371877	371884	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016856	TGTT	2	8	372040	372047	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016856	GATT	2	8	378635	378642	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016856	CCAT	2	8	378728	378735	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_016856	TTTC	2	8	379078	379085	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_016856	TTGA	2	8	385873	385880	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016856	ATAG	2	8	385914	385921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016856	AAGG	2	8	387774	387781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016856	ATTG	2	8	403981	403988	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016856	TGAA	2	8	408971	408978	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016856	AGCG	2	8	409026	409033	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016856	GGGA	2	8	409449	409456	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016856	TATT	2	8	416689	416696	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016856	GCAG	2	8	425393	425400	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016856	CTCG	2	8	433935	433942	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_016856	TCAA	2	8	438260	438267	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_016856	GTAA	2	8	438288	438295	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016856	TAAC	2	8	451463	451470	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_016856	AGGG	2	8	459419	459426	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016856	CAAT	2	8	459454	459461	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_016856	ATCG	2	8	459478	459485	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016856	ACGC	2	8	459554	459561	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_016856	TATC	2	8	469220	469227	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_016856	AAAT	2	8	483937	483944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016856	TGCC	2	8	484780	484787	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_016856	TCAT	2	8	490575	490582	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_016856	TGGC	2	8	490735	490742	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_016856	GGTG	2	8	490744	490751	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016856	TGAT	2	8	502263	502270	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016856	ACTT	2	8	504606	504613	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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