MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 11167

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016856	TCG	2	6	1182594	1182599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_016856	CGGT	2	8	1182633	1182640	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2503	NC_016856	C	6	6	1182650	1182655	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2504	NC_016856	G	7	7	1182728	1182734	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_016856	TCG	2	6	1182778	1182783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_016856	CGGT	2	8	1182817	1182824	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2507	NC_016856	C	6	6	1182834	1182839	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2508	NC_016856	G	7	7	1182912	1182918	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_016856	AC	3	6	1182946	1182951	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2510	NC_016856	TCAA	2	8	1183050	1183057	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2511	NC_016856	A	6	6	1184195	1184200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_016856	GA	3	6	1184241	1184246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_016856	CAT	2	6	1185602	1185607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2515	NC_016856	AT	4	8	1188750	1188757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_016856	TGT	2	6	1188763	1188768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_016856	T	7	7	1188776	1188782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_016856	A	6	6	1188836	1188841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_016856	TAA	2	6	1188854	1188859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_016856	ATT	2	6	1188883	1188888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_016856	T	6	6	1189053	1189058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_016856	TCT	2	6	1189076	1189081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_016856	A	6	6	1189101	1189106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_016856	TTA	2	6	1189123	1189128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_016856	TTA	2	6	1189175	1189180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2533	NC_016856	TGG	2	6	1190643	1190648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2535	NC_016856	CGG	2	6	1191087	1191092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2537	NC_016856	G	10	10	1191163	1191172	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_016856	CG	3	6	1193143	1193148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2539	NC_016856	GGATC	2	10	1194516	1194525	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2540	NC_016856	CA	3	6	1194534	1194539	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2541	NC_016856	CTTA	2	8	1194552	1194559	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2542	NC_016856	TTTGA	2	10	1199339	1199348	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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2544	NC_016856	ATT	2	6	1201804	1201809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_016856	TG	3	6	1201839	1201844	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2547	NC_016856	T	6	6	1201889	1201894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2552	NC_016856	GAT	2	6	1205722	1205727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_016856	GA	3	6	1205792	1205797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_016856	C	6	6	1206073	1206078	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2555	NC_016856	TCT	2	6	1206126	1206131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2557	NC_016856	GGA	2	6	1206188	1206193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2559	NC_016856	T	7	7	1206247	1206253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_016856	TGT	2	6	1206258	1206263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2562	NC_016856	TCA	2	6	1206293	1206298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_016856	A	6	6	1206310	1206315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_016856	ACAT	2	8	1206334	1206341	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2565	NC_016856	AT	4	8	1206629	1206636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_016856	TA	3	6	1206651	1206656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_016856	TAA	2	6	1207724	1207729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_016856	A	8	8	1207797	1207804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_016856	GC	3	6	1207813	1207818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2572	NC_016856	GCC	2	6	1208498	1208503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2573	NC_016856	TCC	2	6	1209166	1209171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2574	NC_016856	GGA	2	6	1209199	1209204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2578	NC_016856	T	7	7	1210514	1210520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2582	NC_016856	AGGA	2	8	1210650	1210657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2589	NC_016856	AGTC	2	8	1217963	1217970	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2590	NC_016856	GCC	2	6	1220758	1220763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2597	NC_016856	TGC	2	6	1230006	1230011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_016856	TGA	2	6	1230014	1230019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_016856	CAT	2	6	1230085	1230090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2601	NC_016856	TAA	2	6	1230183	1230188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_016856	TG	3	6	1230253	1230258	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_016856	C	6	6	1230288	1230293	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2604	NC_016856	ATA	2	6	1231297	1231302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_016856	TTTTG	2	10	1231304	1231313	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_016856	GTT	2	6	1232263	1232268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_016856	ACTGA	2	10	1232347	1232356	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2608	NC_016856	T	6	6	1233240	1233245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_016856	ATG	2	6	1233263	1233268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_016856	TG	3	6	1233352	1233357	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_016856	ATT	2	6	1233361	1233366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_016856	GC	3	6	1233427	1233432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2613	NC_016856	GAG	2	6	1233995	1234000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_016856	CG	3	6	1234184	1234189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2615	NC_016856	CGA	2	6	1234306	1234311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2616	NC_016856	GCC	2	6	1235414	1235419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2617	NC_016856	TA	3	6	1235447	1235452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_016856	TTA	2	6	1238143	1238148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_016856	TCCC	2	8	1238578	1238585	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2620	NC_016856	GGA	2	6	1238587	1238592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_016856	AGAC	2	8	1239850	1239857	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2622	NC_016856	TAA	2	6	1239860	1239865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_016856	T	6	6	1239886	1239891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_016856	T	7	7	1244243	1244249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_016856	TATT	2	8	1244408	1244415	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_016856	TAA	2	6	1244426	1244431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_016856	TGTCC	2	10	1244449	1244458	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2628	NC_016856	CGG	2	6	1244460	1244465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2629	NC_016856	C	6	6	1244472	1244477	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2630	NC_016856	ATG	2	6	1245972	1245977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_016856	T	6	6	1246010	1246015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_016856	CTTG	2	8	1248234	1248241	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2634	NC_016856	TAA	2	6	1248449	1248454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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