MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 11167

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016856	AGA	2	6	249339	249344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_016856	GGT	2	6	249351	249356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_016856	AGT	2	6	249360	249365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016856	GCA	2	6	249380	249385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_016856	T	6	6	249427	249432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016856	CGA	2	6	249461	249466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_016856	CTG	2	6	249520	249525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_016856	CAT	2	6	249552	249557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_016856	GC	3	6	249596	249601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
510	NC_016856	GCT	2	6	249636	249641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_016856	TGA	2	6	249662	249667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_016856	TTA	2	6	249686	249691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_016856	CTT	2	6	249725	249730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_016856	T	6	6	249729	249734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_016856	TCA	2	6	249772	249777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_016856	GTTG	2	8	249867	249874	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
517	NC_016856	G	6	6	249964	249969	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
518	NC_016856	ATAA	2	8	250835	250842	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_016856	CT	3	6	253662	253667	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
520	NC_016856	GCC	2	6	253669	253674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_016856	GAT	2	6	254572	254577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_016856	AAT	2	6	254584	254589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_016856	TCAG	2	8	254612	254619	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
524	NC_016856	T	6	6	254688	254693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016856	ACTG	2	8	254704	254711	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
526	NC_016856	TGC	2	6	254740	254745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_016856	CAA	2	6	254790	254795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_016856	GGC	2	6	255769	255774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_016856	GTA	2	6	255882	255887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016856	GAG	2	6	256844	256849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_016856	CTT	2	6	256864	256869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_016856	CT	3	6	256877	256882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
533	NC_016856	GAAA	2	8	256972	256979	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
534	NC_016856	TTA	2	6	257755	257760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_016856	TG	3	6	257805	257810	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_016856	GTCTG	2	10	257814	257823	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
537	NC_016856	GTG	2	6	258461	258466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_016856	AGA	2	6	258482	258487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_016856	GCG	2	6	258506	258511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_016856	AGA	2	6	259763	259768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_016856	A	6	6	260048	260053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_016856	TTAG	2	8	263058	263065	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
543	NC_016856	GAA	2	6	263066	263071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_016856	ATA	2	6	263075	263080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_016856	T	7	7	274752	274758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_016856	GCAG	2	8	274854	274861	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
547	NC_016856	T	6	6	276709	276714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_016856	GCGCT	2	10	280670	280679	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
549	NC_016856	CAC	2	6	280727	280732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_016856	CAA	2	6	280740	280745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_016856	TAA	2	6	282454	282459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_016856	GGC	2	6	282493	282498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_016856	GCA	2	6	282514	282519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_016856	GCG	2	6	282528	282533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_016856	TGC	2	6	282534	282539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_016856	TGA	2	6	282600	282605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_016856	GAA	2	6	282629	282634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_016856	CGG	2	6	282672	282677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_016856	TAT	2	6	282716	282721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_016856	CG	3	6	282722	282727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
561	NC_016856	GTAT	3	12	282843	282854	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
562	NC_016856	GCG	2	6	282866	282871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_016856	GGC	2	6	282943	282948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_016856	TGC	2	6	282972	282977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_016856	CACT	2	8	283084	283091	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
566	NC_016856	CAA	2	6	283153	283158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_016856	A	7	7	284938	284944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_016856	AATG	2	8	286116	286123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
569	NC_016856	AAT	2	6	286189	286194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_016856	TGTGT	2	10	287061	287070	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
571	NC_016856	TAT	2	6	288763	288768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_016856	AATGA	2	10	288772	288781	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
573	NC_016856	ATCA	2	8	288856	288863	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
574	NC_016856	CTG	2	6	288891	288896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_016856	GGC	2	6	289916	289921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_016856	AGC	2	6	289956	289961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_016856	TGC	2	6	289963	289968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_016856	ACT	2	6	290030	290035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_016856	CGA	2	6	290155	290160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_016856	GCA	2	6	290229	290234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_016856	GAA	2	6	290288	290293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_016856	GGA	2	6	290324	290329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_016856	TAA	2	6	290342	290347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_016856	GCA	2	6	290350	290355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_016856	AGA	2	6	290371	290376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_016856	CAG	2	6	290397	290402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_016856	G	6	6	290544	290549	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
588	NC_016856	GGA	2	6	290588	290593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
589	NC_016856	GGC	2	6	290608	290613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_016856	GAA	2	6	290851	290856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_016856	TGC	2	6	290927	290932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_016856	GTC	2	6	290939	290944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_016856	TTG	2	6	291000	291005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_016856	GGA	2	6	291052	291057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
595	NC_016856	TCA	2	6	291077	291082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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597	NC_016856	CGT	2	6	291171	291176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_016856	AC	3	6	291272	291277	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
599	NC_016856	GTAG	2	8	291313	291320	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_016856	CCT	2	6	291413	291418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_016856	AAG	2	6	291426	291431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_016856	CA	3	6	291448	291453	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
603	NC_016856	TGA	2	6	291461	291466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_016856	GGT	2	6	291504	291509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_016856	GGT	2	6	291539	291544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
606	NC_016856	TGT	2	6	291584	291589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_016856	GCTTC	2	10	291614	291623	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
608	NC_016856	CGC	2	6	291628	291633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_016856	AGG	2	6	291716	291721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_016856	CCA	2	6	291746	291751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_016856	TC	3	6	291878	291883	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
612	NC_016856	GAT	2	6	291899	291904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_016856	GCG	2	6	292178	292183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_016856	GAG	2	6	292194	292199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
615	NC_016856	TG	3	6	292219	292224	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
616	NC_016856	GC	3	6	292246	292251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
617	NC_016856	G	6	6	292339	292344	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
618	NC_016856	TCC	2	6	292349	292354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_016856	CTGA	2	8	292369	292376	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
620	NC_016856	GTAC	2	8	292453	292460	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
621	NC_016856	CAC	2	6	292476	292481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_016856	GTG	2	6	292489	292494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_016856	GTG	2	6	292579	292584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_016856	GGA	2	6	292759	292764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_016856	AC	3	6	292977	292982	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
626	NC_016856	CGTC	2	8	292995	293002	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
627	NC_016856	AAC	2	6	293014	293019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_016856	AGC	2	6	293104	293109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_016856	CAT	2	6	293110	293115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_016856	AAAG	2	8	293118	293125	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
631	NC_016856	AGCGA	2	10	293246	293255	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
632	NC_016856	CGTT	2	8	293295	293302	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
633	NC_016856	GT	3	6	293334	293339	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
634	NC_016856	G	6	6	293539	293544	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
635	NC_016856	GT	4	8	293597	293604	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
636	NC_016856	GAC	2	6	293641	293646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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638	NC_016856	GGT	2	6	293739	293744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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