MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 11167

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016856	GTT	2	6	2165447	2165452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_016856	CAGG	2	8	2165465	2165472	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5003	NC_016856	TCT	2	6	2165473	2165478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_016856	TCC	2	6	2165488	2165493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5005	NC_016856	GTC	2	6	2165536	2165541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_016856	CAG	2	6	2165549	2165554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_016856	TAA	2	6	2165651	2165656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_016856	TAT	2	6	2165839	2165844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_016856	TTG	2	6	2165846	2165851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_016856	TTTC	2	8	2165885	2165892	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5011	NC_016856	AAACA	2	10	2166892	2166901	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5012	NC_016856	ATT	2	6	2166903	2166908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_016856	TTA	2	6	2166921	2166926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_016856	CAT	2	6	2167047	2167052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_016856	GCC	2	6	2167958	2167963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5016	NC_016856	TTG	2	6	2167970	2167975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_016856	AGC	2	6	2168045	2168050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_016856	CAT	2	6	2168052	2168057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_016856	ATA	2	6	2168093	2168098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_016856	A	6	6	2168197	2168202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_016856	ATA	2	6	2168207	2168212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_016856	AAT	2	6	2168220	2168225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_016856	AAT	2	6	2168235	2168240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_016856	ATT	2	6	2168305	2168310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_016856	TCT	2	6	2168353	2168358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_016856	ACG	2	6	2184216	2184221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_016856	TAA	2	6	2184240	2184245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_016856	GATTCG	2	12	2185558	2185569	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5029	NC_016856	AGC	2	6	2185747	2185752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_016856	ATTC	2	8	2185758	2185765	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5031	NC_016856	A	6	6	2186863	2186868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_016856	CGGA	2	8	2186907	2186914	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5033	NC_016856	TCCG	2	8	2186923	2186930	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5034	NC_016856	GT	4	8	2187560	2187567	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_016856	AAAC	2	8	2188798	2188805	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5036	NC_016856	ATT	2	6	2188855	2188860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_016856	CTC	2	6	2190219	2190224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5038	NC_016856	CCT	2	6	2192508	2192513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5039	NC_016856	TTA	2	6	2192515	2192520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_016856	TAT	2	6	2192549	2192554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_016856	GTT	2	6	2192586	2192591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_016856	TTTTA	2	10	2192620	2192629	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_016856	AAT	2	6	2192673	2192678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_016856	CAG	2	6	2192679	2192684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_016856	AAC	2	6	2192693	2192698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_016856	TAA	2	6	2192739	2192744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_016856	ATT	2	6	2192761	2192766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_016856	TTCT	2	8	2192799	2192806	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5049	NC_016856	CCG	2	6	2192824	2192829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5050	NC_016856	ACCCG	2	10	2192908	2192917	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5051	NC_016856	T	6	6	2195547	2195552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_016856	AATCAG	2	12	2195599	2195610	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5053	NC_016856	TGA	2	6	2195668	2195673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_016856	CGC	2	6	2197293	2197298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5055	NC_016856	ACAA	2	8	2197321	2197328	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5056	NC_016856	A	6	6	2197327	2197332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_016856	ATA	2	6	2197366	2197371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_016856	CG	3	6	2197372	2197377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5059	NC_016856	GCG	2	6	2198938	2198943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_016856	A	6	6	2198993	2198998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_016856	GATT	2	8	2199014	2199021	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_016856	ACC	2	6	2199963	2199968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5063	NC_016856	TGAC	2	8	2200860	2200867	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5064	NC_016856	A	6	6	2200892	2200897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_016856	GCTT	2	8	2200900	2200907	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5066	NC_016856	ACC	2	6	2200992	2200997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5067	NC_016856	ATC	2	6	2200998	2201003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_016856	CAT	2	6	2201006	2201011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_016856	TG	3	6	2201033	2201038	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_016856	GTG	2	6	2201062	2201067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_016856	ATC	2	6	2201096	2201101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_016856	T	9	9	2201112	2201120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_016856	GC	3	6	2201122	2201127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5074	NC_016856	GCGCT	2	10	2202081	2202090	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5075	NC_016856	A	7	7	2208308	2208314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_016856	T	6	6	2208330	2208335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_016856	ACC	2	6	2208363	2208368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5078	NC_016856	AAG	2	6	2208377	2208382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_016856	CTAA	2	8	2209375	2209382	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5080	NC_016856	A	7	7	2209381	2209387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_016856	AT	3	6	2209422	2209427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_016856	ATT	2	6	2209456	2209461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_016856	ATC	2	6	2209478	2209483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_016856	TCA	2	6	2209489	2209494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_016856	ATG	2	6	2210710	2210715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_016856	TA	3	6	2210758	2210763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_016856	ATT	2	6	2210817	2210822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_016856	A	8	8	2210867	2210874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_016856	ATT	3	9	2212456	2212464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_016856	TAAA	2	8	2213944	2213951	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_016856	AAT	2	6	2218890	2218895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_016856	ATAA	2	8	2218903	2218910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_016856	TAA	2	6	2218941	2218946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_016856	AT	3	6	2218999	2219004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_016856	TAT	3	9	2219002	2219010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_016856	A	7	7	2219025	2219031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_016856	AGT	2	6	2219038	2219043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_016856	ATTT	2	8	2219056	2219063	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_016856	AT	4	8	2219064	2219071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_016856	AAAAG	2	10	2219091	2219100	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_016856	ATA	2	6	2219157	2219162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_016856	ACA	2	6	2221495	2221500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_016856	ATTT	2	8	2221523	2221530	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_016856	TCAT	2	8	2228110	2228117	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5105	NC_016856	AATT	2	8	2230183	2230190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_016856	AC	3	6	2230203	2230208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5107	NC_016856	TCA	2	6	2230224	2230229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_016856	TTG	2	6	2230258	2230263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_016856	CAG	2	6	2230275	2230280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_016856	TTA	2	6	2230315	2230320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_016856	TTA	2	6	2230467	2230472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_016856	ACCA	2	8	2230481	2230488	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5113	NC_016856	GTT	2	6	2230498	2230503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_016856	TTC	2	6	2231406	2231411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_016856	CTG	2	6	2231473	2231478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_016856	ATG	2	6	2231488	2231493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_016856	AAC	2	6	2231540	2231545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_016856	ACC	2	6	2232984	2232989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5119	NC_016856	CAT	2	6	2237019	2237024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_016856	GTT	2	6	2238520	2238525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_016856	ACC	2	6	2246621	2246626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5122	NC_016856	ATT	2	6	2254206	2254211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_016856	GC	3	6	2254535	2254540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5124	NC_016856	TTG	2	6	2254560	2254565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_016856	GAT	2	6	2254641	2254646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_016856	ATTT	2	8	2254673	2254680	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_016856	ACTCC	2	10	2254681	2254690	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5128	NC_016856	AT	3	6	2254709	2254714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_016856	ATT	2	6	2254722	2254727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_016856	GCATT	2	10	2254802	2254811	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5131	NC_016856	CCG	2	6	2254815	2254820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5132	NC_016856	TAT	2	6	2254821	2254826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_016856	CAGG	2	8	2256488	2256495	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5134	NC_016856	AAGG	2	8	2259782	2259789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_016856	G	6	6	2259788	2259793	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_016856	CGC	2	6	2263985	2263990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5137	NC_016856	GAC	2	6	2263991	2263996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5138	NC_016856	CTT	2	6	2264017	2264022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5139	NC_016856	ATT	2	6	2265429	2265434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5140	NC_016856	TCC	3	9	2265476	2265484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5141	NC_016856	ATG	2	6	2265535	2265540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5142	NC_016856	TCA	2	6	2265548	2265553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5143	NC_016856	CTG	2	6	2265610	2265615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5144	NC_016856	TCC	2	6	2265753	2265758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5145	NC_016856	TCCCT	2	10	2265766	2265775	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5146	NC_016856	ATT	2	6	2276815	2276820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5147	NC_016856	ATAACA	2	12	2276824	2276835	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5148	NC_016856	AC	3	6	2276882	2276887	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5149	NC_016856	ACG	2	6	2276926	2276931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5150	NC_016856	ATT	2	6	2276952	2276957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5151	NC_016856	AGT	2	6	2276991	2276996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5153	NC_016856	ACATAA	2	12	2277042	2277053	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5154	NC_016856	ATA	2	6	2277120	2277125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5155	NC_016856	T	6	6	2277151	2277156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5165	NC_016856	T	6	6	2282612	2282617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5166	NC_016856	TAT	2	6	2282671	2282676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5167	NC_016856	GCCA	2	8	2282874	2282881	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5171	NC_016856	AAT	2	6	2283084	2283089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5172	NC_016856	TCA	2	6	2283163	2283168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5174	NC_016856	CGC	2	6	2283224	2283229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5177	NC_016856	TAT	2	6	2283321	2283326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5183	NC_016856	A	8	8	2283570	2283577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5189	NC_016856	TTAC	2	8	2283775	2283782	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5192	NC_016856	ATT	2	6	2283980	2283985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5201	NC_016856	CTG	2	6	2287700	2287705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5230	NC_016856	AGG	2	6	2300011	2300016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5236	NC_016856	T	6	6	2303351	2303356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5240	NC_016856	ATT	2	6	2303524	2303529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5241	NC_016856	TA	3	6	2303546	2303551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5242	NC_016856	GGCA	2	8	2304027	2304034	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5243	NC_016856	GCT	2	6	2304071	2304076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5244	NC_016856	TCTTT	2	10	2304086	2304095	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5246	NC_016856	TAA	2	6	2304729	2304734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5247	NC_016856	CGC	2	6	2307806	2307811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5248	NC_016856	A	6	6	2307844	2307849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_016856	TTA	2	6	2308690	2308695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5250	NC_016856	A	6	6	2312589	2312594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5251	NC_016856	GGCA	2	8	2312650	2312657	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5252	NC_016856	G	6	6	2312664	2312669	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5253	NC_016856	GCT	2	6	2312697	2312702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5254	NC_016856	TC	3	6	2315030	2315035	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5255	NC_016856	TTTATC	2	12	2315036	2315047	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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5257	NC_016856	GAG	2	6	2315105	2315110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_016856	CAC	2	6	2315272	2315277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5259	NC_016856	CGG	2	6	2317045	2317050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5260	NC_016856	TGCC	2	8	2317056	2317063	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5261	NC_016856	GCG	2	6	2317070	2317075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5262	NC_016856	CTG	2	6	2318790	2318795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5263	NC_016856	CGC	2	6	2319532	2319537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5264	NC_016856	ATC	2	6	2320368	2320373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5267	NC_016856	T	6	6	2321872	2321877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5271	NC_016856	T	6	6	2321961	2321966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5272	NC_016856	GAT	2	6	2322207	2322212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5284	NC_016856	CGG	2	6	2331707	2331712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5285	NC_016856	TATT	2	8	2332744	2332751	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5286	NC_016856	TTA	3	9	2332774	2332782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5301	NC_016856	A	6	6	2350341	2350346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5309	NC_016856	GC	3	6	2355104	2355109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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