MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. D23580

Total Repeats: 14005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016854	GGA	2	6	195971	195976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_016854	CGA	2	6	196377	196382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_016854	TAT	2	6	196387	196392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016854	TATTG	2	10	196420	196429	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
505	NC_016854	T	6	6	200631	200636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016854	TG	3	6	200664	200669	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_016854	TCA	2	6	200674	200679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_016854	GAAT	2	8	200708	200715	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
509	NC_016854	GCG	2	6	200752	200757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_016854	TTA	2	6	200758	200763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_016854	ATT	2	6	202125	202130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_016854	AT	3	6	202137	202142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_016854	AAGT	2	8	202159	202166	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
514	NC_016854	GCTTC	2	10	203901	203910	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
515	NC_016854	TGA	2	6	208330	208335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_016854	CCA	2	6	208368	208373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_016854	GAT	2	6	209021	209026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_016854	GAA	2	6	209038	209043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_016854	AT	4	8	209077	209084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_016854	ATT	2	6	209092	209097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_016854	GTTT	2	8	209107	209114	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
522	NC_016854	GCT	2	6	209161	209166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_016854	AAT	2	6	209179	209184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_016854	T	7	7	209190	209196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016854	A	6	6	209201	209206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_016854	GT	3	6	209221	209226	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
527	NC_016854	A	7	7	209235	209241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_016854	CAT	2	6	209250	209255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_016854	GGA	2	6	209274	209279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016854	GAC	2	6	209738	209743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_016854	T	6	6	209765	209770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_016854	CTT	2	6	211407	211412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_016854	TGA	2	6	212375	212380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_016854	GCGCT	2	10	212393	212402	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
535	NC_016854	CGCGT	2	10	212445	212454	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
536	NC_016854	G	6	6	213325	213330	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
537	NC_016854	TAA	2	6	215290	215295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_016854	AG	3	6	215340	215345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
539	NC_016854	CAT	2	6	215367	215372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_016854	CGC	2	6	215376	215381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_016854	AACG	2	8	216380	216387	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
542	NC_016854	ACGC	2	8	216981	216988	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
543	NC_016854	TAA	2	6	217001	217006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_016854	GA	3	6	220840	220845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
545	NC_016854	TCT	3	9	220848	220856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_016854	GTC	2	6	220857	220862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_016854	GAA	2	6	220868	220873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_016854	TCC	2	6	223547	223552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_016854	ATAA	2	8	223553	223560	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_016854	TTA	2	6	223575	223580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_016854	CCTT	2	8	223583	223590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
552	NC_016854	CGA	2	6	223650	223655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_016854	TGC	2	6	223670	223675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_016854	TAA	3	9	223681	223689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_016854	TCA	2	6	223715	223720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_016854	CAATAT	2	12	229774	229785	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
557	NC_016854	CTGTC	2	10	229841	229850	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
558	NC_016854	AAG	2	6	229887	229892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_016854	GC	3	6	229936	229941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
560	NC_016854	TGA	2	6	229994	229999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_016854	AAT	2	6	230022	230027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_016854	TAA	3	9	230116	230124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_016854	ATA	2	6	230145	230150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_016854	ATT	2	6	230155	230160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_016854	T	6	6	230159	230164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_016854	TAA	2	6	230172	230177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_016854	A	6	6	230176	230181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_016854	AAAT	2	8	230193	230200	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_016854	A	8	8	230219	230226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_016854	T	6	6	230239	230244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_016854	T	8	8	230246	230253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_016854	AAAT	2	8	230271	230278	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_016854	TA	3	6	230294	230299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_016854	T	7	7	230321	230327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_016854	T	7	7	230350	230356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_016854	CTTG	2	8	230368	230375	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
577	NC_016854	TTTG	2	8	230377	230384	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
578	NC_016854	T	6	6	230385	230390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_016854	TAT	2	6	230407	230412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_016854	TAAA	2	8	230431	230438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_016854	A	6	6	230436	230441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_016854	TTAT	2	8	230493	230500	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_016854	GTT	2	6	230507	230512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_016854	CTT	2	6	230515	230520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_016854	ATATA	2	10	230554	230563	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_016854	CTA	2	6	230567	230572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_016854	TG	3	6	230602	230607	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
588	NC_016854	TAA	2	6	230635	230640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_016854	ATC	2	6	231218	231223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_016854	GAT	2	6	231243	231248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_016854	A	7	7	231258	231264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_016854	TA	3	6	231270	231275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_016854	A	8	8	237143	237150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_016854	GGC	2	6	237157	237162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_016854	GTT	2	6	237182	237187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_016854	TCT	2	6	238646	238651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_016854	C	6	6	245963	245968	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
598	NC_016854	TGCTC	2	10	246041	246050	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
599	NC_016854	AGG	2	6	246053	246058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_016854	CGG	2	6	247225	247230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_016854	AT	3	6	247256	247261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_016854	AC	3	6	247301	247306	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
603	NC_016854	TCA	2	6	247708	247713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_016854	AAT	2	6	247728	247733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_016854	CCA	2	6	247755	247760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_016854	A	7	7	247769	247775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_016854	AGA	2	6	247790	247795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_016854	GCG	2	6	247823	247828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_016854	G	6	6	249251	249256	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
610	NC_016854	ATAA	2	8	250122	250129	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_016854	CT	3	6	252949	252954	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
612	NC_016854	GCC	2	6	252956	252961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_016854	GAT	2	6	253859	253864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_016854	AAT	2	6	253871	253876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_016854	TCAG	2	8	253899	253906	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
616	NC_016854	T	6	6	253975	253980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_016854	ACTG	2	8	253991	253998	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
618	NC_016854	TGC	2	6	254027	254032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_016854	CAA	2	6	254077	254082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_016854	GC	3	6	254116	254121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
621	NC_016854	AC	3	6	254147	254152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
622	NC_016854	AAC	2	6	254185	254190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_016854	AC	4	8	254189	254196	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
624	NC_016854	GGC	2	6	255056	255061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_016854	GTA	2	6	255169	255174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_016854	GAG	2	6	256131	256136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
627	NC_016854	CTT	2	6	256151	256156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_016854	CT	3	6	256164	256169	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
629	NC_016854	GAAA	2	8	256259	256266	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
630	NC_016854	TTA	2	6	257042	257047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_016854	TG	3	6	257092	257097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_016854	GTCTG	2	10	257101	257110	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
633	NC_016854	GTG	2	6	257748	257753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_016854	AGA	2	6	257769	257774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_016854	GCG	2	6	257793	257798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_016854	AGA	2	6	259050	259055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_016854	T	6	6	259122	259127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_016854	T	6	6	259157	259162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_016854	CG	3	6	259251	259256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
640	NC_016854	A	6	6	259335	259340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_016854	TTAG	2	8	262345	262352	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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665	NC_016854	ATGG	2	8	288449	288456	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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