MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus infantarius subsp. infantarius CJ18 plasmid pSICJ18-1

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016837	ATT	2	6	133	138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016837	CAA	2	6	384	389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016837	ATT	2	6	419	424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016837	ATT	2	6	517	522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016837	ATA	2	6	2662	2667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016837	TAG	2	6	2783	2788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016837	AAG	2	6	3750	3755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016837	TTC	2	6	3881	3886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016837	CTT	2	6	3889	3894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016837	CTT	2	6	3943	3948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016837	TCT	2	6	4014	4019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016837	ATA	2	6	4024	4029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016837	TAT	2	6	4067	4072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016837	TCT	2	6	4099	4104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016837	AGT	2	6	4351	4356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016837	GAT	2	6	4361	4366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016837	AAG	2	6	5678	5683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016837	GAG	2	6	5759	5764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016837	CTT	2	6	5768	5773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016837	CCG	2	6	5812	5817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_016837	AAG	2	6	5972	5977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016837	AAT	2	6	6141	6146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016837	TGG	2	6	6362	6367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016837	CGG	2	6	6378	6383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016837	TAA	2	6	7449	7454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016837	TAA	2	6	7458	7463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016837	ATT	2	6	7806	7811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016837	TAA	2	6	7823	7828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016837	ATT	2	6	8369	8374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016837	TAT	2	6	8783	8788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016837	ATA	2	6	8814	8819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016837	AAT	2	6	9619	9624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016837	CAA	2	6	9638	9643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016837	AGG	2	6	10151	10156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016837	GTA	2	6	11268	11273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016837	CAG	3	9	11560	11568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016837	AAC	2	6	11585	11590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016837	TGT	2	6	11618	11623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016837	TTG	2	6	11650	11655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016837	ATT	2	6	11745	11750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016837	ATC	2	6	11840	11845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016837	TTC	2	6	11983	11988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016837	TCC	2	6	13448	13453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_016837	TAT	2	6	13481	13486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016837	GGT	2	6	13601	13606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016837	TTC	2	6	13662	13667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016837	TGT	2	6	14553	14558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016837	CTG	2	6	15033	15038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016837	CTG	2	6	15234	15239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016837	ACG	2	6	15244	15249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016837	ATA	2	6	16105	16110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016837	TGA	2	6	16113	16118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016837	TAA	2	6	16172	16177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016837	TAC	2	6	17600	17605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016837	TAT	2	6	18011	18016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016837	TTC	2	6	18051	18056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016837	GTA	2	6	18078	18083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016837	CTT	2	6	18577	18582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016837	AAG	2	6	19479	19484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016837	TAT	2	6	19569	19574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016837	TAT	2	6	19640	19645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016837	ATA	2	6	19647	19652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016837	TTC	2	6	19714	19719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016837	AAC	3	9	19782	19790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.