MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Shigella sonnei 53G plasmid A

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016833	AG	3	6	65	70	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016833	AT	3	6	1156	1161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016833	AT	3	6	3452	3457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016833	AT	3	6	8557	8562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016833	AT	5	10	10183	10192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016833	CT	3	6	10673	10678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016833	AT	3	6	15275	15280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016833	TC	3	6	16148	16153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016833	TG	3	6	16161	16166	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016833	CT	3	6	17071	17076	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016833	AG	3	6	17082	17087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016833	AT	3	6	17876	17881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016833	GA	3	6	18184	18189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016833	GC	3	6	25003	25008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016833	GA	3	6	28251	28256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016833	AG	4	8	35523	35530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016833	AT	3	6	39327	39332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016833	AG	3	6	39391	39396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016833	AT	3	6	39440	39445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016833	AT	3	6	39512	39517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016833	AT	3	6	39567	39572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016833	AG	4	8	42388	42395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016833	CA	3	6	42709	42714	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016833	TA	3	6	42799	42804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016833	TA	3	6	43093	43098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016833	TA	4	8	43130	43137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016833	AT	3	6	44681	44686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016833	AT	3	6	44950	44955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016833	GA	3	6	47390	47395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016833	AT	3	6	49006	49011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016833	TA	3	6	49079	49084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016833	TG	4	8	49815	49822	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016833	GA	3	6	55630	55635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016833	GT	3	6	62720	62725	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016833	CA	3	6	63165	63170	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016833	AG	4	8	70487	70494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016833	AT	3	6	71572	71577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016833	AT	4	8	73230	73237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016833	AG	3	6	73374	73379	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016833	TC	4	8	75014	75021	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016833	CT	3	6	82097	82102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016833	AT	3	6	82386	82391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016833	TG	3	6	83818	83823	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016833	TG	3	6	83874	83879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016833	AT	3	6	84240	84245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016833	AT	3	6	88980	88985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016833	AT	3	6	94971	94976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016833	AT	3	6	94978	94983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016833	AT	3	6	95112	95117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016833	AG	3	6	95141	95146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016833	CA	3	6	109440	109445	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016833	AG	3	6	114722	114727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016833	TA	3	6	114758	114763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016833	AT	3	6	119919	119924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016833	AC	3	6	119932	119937	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016833	TA	3	6	120767	120772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016833	AT	3	6	121113	121118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016833	AG	3	6	121825	121830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016833	AT	4	8	131222	131229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016833	AT	3	6	131586	131591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016833	AT	3	6	131628	131633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016833	AT	3	6	131640	131645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016833	AT	3	6	135302	135307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016833	GA	3	6	139304	139309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016833	AT	3	6	143290	143295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016833	TA	4	8	144033	144040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016833	AT	3	6	145239	145244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016833	TC	3	6	145909	145914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_016833	AT	3	6	150603	150608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016833	GT	3	6	165030	165035	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016833	GC	3	6	167064	167069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016833	AT	3	6	167385	167390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016833	GC	3	6	167725	167730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_016833	AG	3	6	180366	180371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016833	TG	3	6	180873	180878	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016833	TC	4	8	186356	186363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016833	TC	3	6	190356	190361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016833	AT	3	6	190397	190402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016833	AT	3	6	190512	190517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016833	CA	3	6	198529	198534	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_016833	TA	4	8	198861	198868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016833	TA	4	8	198886	198893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016833	TA	3	6	199156	199161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016833	AT	4	8	199288	199295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016833	AG	3	6	206167	206172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016833	CT	3	6	208085	208090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016833	GA	3	6	214177	214182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.