MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 15464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016832	GTG	2	6	1250736	1250741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_016832	T	6	6	1250808	1250813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_016832	T	6	6	1250836	1250841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_016832	CTT	2	6	1250905	1250910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_016832	GTG	2	6	1250969	1250974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_016832	AAGG	2	8	1250981	1250988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_016832	TGG	2	6	1251081	1251086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_016832	CAC	2	6	1251152	1251157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4009	NC_016832	GTGC	2	8	1251173	1251180	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4010	NC_016832	CCG	2	6	1251210	1251215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4011	NC_016832	CG	3	6	1251239	1251244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4012	NC_016832	GAG	2	6	1251278	1251283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_016832	TGG	2	6	1252617	1252622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_016832	GCC	2	6	1252663	1252668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4015	NC_016832	ATT	2	6	1252670	1252675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_016832	GAT	2	6	1255107	1255112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_016832	ATT	2	6	1255140	1255145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_016832	TAA	2	6	1255164	1255169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_016832	TGC	2	6	1255174	1255179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_016832	ACA	2	6	1255350	1255355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_016832	AGGA	2	8	1255392	1255399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_016832	CCG	2	6	1255912	1255917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4023	NC_016832	ACA	2	6	1255927	1255932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_016832	CGG	2	6	1255955	1255960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_016832	A	6	6	1256901	1256906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_016832	AG	3	6	1256917	1256922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_016832	A	6	6	1257815	1257820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_016832	CGC	2	6	1257851	1257856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4029	NC_016832	ACA	2	6	1257895	1257900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_016832	T	7	7	1258403	1258409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_016832	TGCC	2	8	1258411	1258418	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4032	NC_016832	TTAT	2	8	1258425	1258432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_016832	ATT	2	6	1258441	1258446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_016832	G	6	6	1258461	1258466	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_016832	GA	3	6	1258485	1258490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_016832	TAG	2	6	1258496	1258501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_016832	CGG	2	6	1258519	1258524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_016832	A	6	6	1258555	1258560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_016832	GCG	2	6	1258611	1258616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_016832	T	6	6	1258980	1258985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_016832	ATGCC	2	10	1260436	1260445	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4042	NC_016832	GCG	2	6	1263931	1263936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_016832	T	6	6	1263952	1263957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_016832	TTA	2	6	1264017	1264022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_016832	AG	3	6	1264613	1264618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_016832	GGA	2	6	1264655	1264660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_016832	TATT	2	8	1264661	1264668	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_016832	TCA	2	6	1266947	1266952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_016832	GTA	2	6	1266967	1266972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_016832	CG	3	6	1267059	1267064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4051	NC_016832	TAGCCT	2	12	1267116	1267127	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_016832	A	7	7	1267389	1267395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_016832	GACA	2	8	1267430	1267437	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4054	NC_016832	TCG	2	6	1267452	1267457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_016832	T	7	7	1268896	1268902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_016832	AATGG	2	10	1268976	1268985	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_016832	GTG	2	6	1269665	1269670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_016832	A	6	6	1270446	1270451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_016832	ACG	2	6	1270545	1270550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_016832	TC	3	6	1272016	1272021	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4061	NC_016832	A	6	6	1272067	1272072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_016832	CGC	2	6	1272098	1272103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4063	NC_016832	GCG	2	6	1272444	1272449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_016832	GCC	2	6	1272455	1272460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4065	NC_016832	CCT	2	6	1273443	1273448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4066	NC_016832	TTTA	2	8	1273519	1273526	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_016832	AAG	2	6	1273527	1273532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_016832	TA	3	6	1273546	1273551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_016832	AATG	2	8	1273556	1273563	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_016832	A	6	6	1273584	1273589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_016832	ATTG	2	8	1273600	1273607	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_016832	CTT	2	6	1273623	1273628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_016832	CGT	2	6	1273687	1273692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_016832	T	6	6	1273699	1273704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_016832	TA	3	6	1273719	1273724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_016832	GTTAC	2	10	1274496	1274505	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4077	NC_016832	GTG	2	6	1274522	1274527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_016832	TAA	2	6	1275538	1275543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_016832	CAG	2	6	1275547	1275552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_016832	ATG	2	6	1275554	1275559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_016832	TTA	2	6	1275568	1275573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_016832	CAG	2	6	1275601	1275606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_016832	GTA	2	6	1275982	1275987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_016832	TTA	2	6	1275988	1275993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_016832	TAC	2	6	1276002	1276007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_016832	TCC	2	6	1276014	1276019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4087	NC_016832	ACA	2	6	1276027	1276032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_016832	AGG	2	6	1276104	1276109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_016832	CAA	2	6	1276114	1276119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_016832	AAT	3	9	1276147	1276155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_016832	CCAG	2	8	1276202	1276209	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4092	NC_016832	GCG	2	6	1276346	1276351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_016832	CGT	2	6	1276364	1276369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_016832	ATT	2	6	1276373	1276378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_016832	CGC	2	6	1276391	1276396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4096	NC_016832	C	6	6	1276497	1276502	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4097	NC_016832	AGA	2	6	1276531	1276536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_016832	TAT	2	6	1276624	1276629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_016832	ACA	2	6	1276760	1276765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_016832	AGGTT	2	10	1276784	1276793	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_016832	T	7	7	1276883	1276889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_016832	CAT	3	9	1276898	1276906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_016832	TAA	2	6	1276994	1276999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_016832	TAA	2	6	1277030	1277035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_016832	TCGT	2	8	1277062	1277069	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4106	NC_016832	AT	4	8	1277114	1277121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_016832	GTAC	2	8	1277164	1277171	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4108	NC_016832	TCAT	2	8	1277197	1277204	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4109	NC_016832	GAT	2	6	1277258	1277263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_016832	TAA	3	9	1277308	1277316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_016832	CGG	2	6	1277318	1277323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_016832	ATC	3	9	1277356	1277364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_016832	AT	3	6	1277388	1277393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_016832	ATG	2	6	1277415	1277420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_016832	CAA	2	6	1277433	1277438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_016832	CGG	2	6	1277480	1277485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_016832	GCC	2	6	1277490	1277495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4118	NC_016832	A	6	6	1278740	1278745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_016832	TCT	2	6	1278798	1278803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_016832	TCA	2	6	1278842	1278847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_016832	TCA	2	6	1279029	1279034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_016832	CGA	2	6	1279084	1279089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_016832	CAT	2	6	1279152	1279157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_016832	AGC	2	6	1279190	1279195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_016832	TGC	2	6	1279258	1279263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_016832	ATAG	2	8	1279284	1279291	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_016832	GTC	2	6	1279294	1279299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_016832	CAT	2	6	1279367	1279372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_016832	GT	3	6	1279394	1279399	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_016832	T	7	7	1279440	1279446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_016832	CAT	3	9	1279455	1279463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_016832	CAC	2	6	1279594	1279599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4133	NC_016832	CG	3	6	1281607	1281612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4134	NC_016832	AAG	2	6	1281614	1281619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_016832	AGC	2	6	1281644	1281649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4136	NC_016832	GA	3	6	1281666	1281671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_016832	GAA	2	6	1281688	1281693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_016832	GCC	2	6	1281732	1281737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4139	NC_016832	TTA	2	6	1282157	1282162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4140	NC_016832	TTA	2	6	1282180	1282185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4141	NC_016832	CT	3	6	1282820	1282825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4142	NC_016832	TTTA	2	8	1282826	1282833	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4143	NC_016832	GCT	2	6	1282919	1282924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4144	NC_016832	T	7	7	1282937	1282943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4145	NC_016832	AGG	2	6	1282962	1282967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4146	NC_016832	ACGAA	2	10	1282982	1282991	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4147	NC_016832	A	6	6	1283001	1283006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4148	NC_016832	CCT	2	6	1283008	1283013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4149	NC_016832	T	7	7	1283023	1283029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4150	NC_016832	GA	3	6	1283042	1283047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4151	NC_016832	CATC	2	8	1286801	1286808	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4152	NC_016832	T	6	6	1286920	1286925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4153	NC_016832	AAC	2	6	1287978	1287983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4156	NC_016832	TGT	2	6	1289965	1289970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4157	NC_016832	CAT	2	6	1289971	1289976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4159	NC_016832	TTA	2	6	1290014	1290019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4162	NC_016832	ATG	2	6	1290122	1290127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4163	NC_016832	TCCG	2	8	1290161	1290168	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4164	NC_016832	AGG	2	6	1290979	1290984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4165	NC_016832	CAG	2	6	1292440	1292445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4177	NC_016832	TAAT	2	8	1294956	1294963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4221	NC_016832	TA	3	6	1312977	1312982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4222	NC_016832	A	8	8	1312986	1312993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4223	NC_016832	TTA	2	6	1313016	1313021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4225	NC_016832	T	7	7	1313346	1313352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4231	NC_016832	T	7	7	1313495	1313501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4232	NC_016832	TAAA	2	8	1313521	1313528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4233	NC_016832	A	7	7	1313526	1313532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4234	NC_016832	T	6	6	1313548	1313553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4235	NC_016832	CA	3	6	1313567	1313572	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4236	NC_016832	AGTCTT	2	12	1314996	1315007	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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4239	NC_016832	TAAGC	2	10	1315055	1315064	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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4242	NC_016832	GC	3	6	1315223	1315228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4243	NC_016832	A	6	6	1315248	1315253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4250	NC_016832	TGA	2	6	1317161	1317166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4252	NC_016832	TAA	2	6	1317307	1317312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_016832	GCC	2	6	1317322	1317327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4254	NC_016832	GCC	2	6	1317334	1317339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4255	NC_016832	GCG	2	6	1317354	1317359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4256	NC_016832	TCAT	2	8	1317440	1317447	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4257	NC_016832	GT	3	6	1317463	1317468	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_016832	GGCAG	2	10	1317469	1317478	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4259	NC_016832	TTAA	2	8	1318255	1318262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_016832	TTA	2	6	1318274	1318279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_016832	GCG	2	6	1318412	1318417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4262	NC_016832	CGG	2	6	1318441	1318446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4263	NC_016832	CAGAG	2	10	1318500	1318509	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4264	NC_016832	ATG	2	6	1318530	1318535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_016832	T	6	6	1318538	1318543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4266	NC_016832	AAT	2	6	1318559	1318564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4267	NC_016832	T	6	6	1318574	1318579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4268	NC_016832	CAT	2	6	1318582	1318587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4392	NC_016832	CT	3	6	1362750	1362755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4393	NC_016832	TC	3	6	1363377	1363382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4394	NC_016832	TTA	3	9	1363384	1363392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4395	NC_016832	GCAC	2	8	1363400	1363407	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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