MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 15464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016832	ATTG	2	8	1121324	1121331	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_016832	TTCC	2	8	1121599	1121606	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3503	NC_016832	GGT	2	6	1121642	1121647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_016832	ACG	2	6	1121655	1121660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_016832	TC	3	6	1121993	1121998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3506	NC_016832	TAC	2	6	1122020	1122025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_016832	AT	3	6	1122045	1122050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_016832	TC	4	8	1122142	1122149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3509	NC_016832	GAA	2	6	1122351	1122356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_016832	ATT	2	6	1122362	1122367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_016832	CAG	2	6	1122393	1122398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_016832	AT	3	6	1122431	1122436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_016832	TTG	2	6	1122448	1122453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_016832	TG	3	6	1122588	1122593	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_016832	AAG	2	6	1122606	1122611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_016832	ACGTTG	2	12	1122624	1122635	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3517	NC_016832	TTG	2	6	1123072	1123077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_016832	TTA	2	6	1123091	1123096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_016832	T	6	6	1123103	1123108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_016832	ATCA	2	8	1123136	1123143	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3521	NC_016832	CAG	2	6	1126438	1126443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_016832	GCG	2	6	1126472	1126477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_016832	ACA	2	6	1126595	1126600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_016832	ATT	2	6	1126611	1126616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_016832	TCA	2	6	1126654	1126659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_016832	TTAAA	2	10	1126668	1126677	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_016832	TAT	2	6	1126713	1126718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_016832	TCC	2	6	1127227	1127232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3529	NC_016832	A	7	7	1127241	1127247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_016832	ACA	2	6	1127273	1127278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_016832	CGG	2	6	1128993	1128998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_016832	CCT	2	6	1129974	1129979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3533	NC_016832	TTA	2	6	1129980	1129985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_016832	T	6	6	1130014	1130019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_016832	ATT	2	6	1130086	1130091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_016832	A	7	7	1130102	1130108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_016832	TG	3	6	1130114	1130119	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_016832	AAGG	2	8	1130194	1130201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_016832	GCA	2	6	1130270	1130275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_016832	TGT	2	6	1130397	1130402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_016832	GCC	2	6	1133627	1133632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3542	NC_016832	CGA	2	6	1133695	1133700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_016832	AGGG	2	8	1133742	1133749	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_016832	ATA	2	6	1135126	1135131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_016832	GC	3	6	1135287	1135292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3546	NC_016832	TA	3	6	1135304	1135309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_016832	ACA	2	6	1137347	1137352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_016832	CCG	2	6	1137364	1137369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3549	NC_016832	AAT	2	6	1137380	1137385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_016832	GCC	2	6	1138000	1138005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3551	NC_016832	GC	3	6	1140010	1140015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3552	NC_016832	ACT	2	6	1140745	1140750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_016832	ATA	2	6	1141453	1141458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_016832	AAAT	2	8	1141460	1141467	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_016832	TAAT	2	8	1141498	1141505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_016832	AAC	2	6	1141535	1141540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_016832	TGA	2	6	1141561	1141566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_016832	CGA	2	6	1141567	1141572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_016832	GA	3	6	1143299	1143304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_016832	T	8	8	1143322	1143329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_016832	AAAT	2	8	1144512	1144519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_016832	AAT	2	6	1144532	1144537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_016832	A	7	7	1144540	1144546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_016832	A	6	6	1144548	1144553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_016832	TTC	2	6	1144560	1144565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_016832	T	6	6	1144570	1144575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_016832	ATC	2	6	1146442	1146447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_016832	TAT	2	6	1146496	1146501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_016832	GCGCC	2	10	1146846	1146855	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3570	NC_016832	CAT	2	6	1146863	1146868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_016832	GCC	2	6	1147554	1147559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3572	NC_016832	GCG	2	6	1147564	1147569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_016832	GGC	2	6	1148131	1148136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_016832	TTC	2	6	1148194	1148199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_016832	GGC	2	6	1148235	1148240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_016832	GAG	2	6	1148280	1148285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_016832	AACC	2	8	1148299	1148306	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3578	NC_016832	A	6	6	1148364	1148369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_016832	AGT	2	6	1148387	1148392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_016832	TAA	2	6	1148408	1148413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_016832	AACC	2	8	1148587	1148594	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3582	NC_016832	T	6	6	1148622	1148627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_016832	AGG	2	6	1148752	1148757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_016832	CGC	2	6	1148979	1148984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3585	NC_016832	AAC	2	6	1149414	1149419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_016832	A	7	7	1149429	1149435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_016832	GT	3	6	1149451	1149456	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_016832	ATA	2	6	1149987	1149992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_016832	CAATT	2	10	1150030	1150039	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3590	NC_016832	GAAAT	2	10	1150056	1150065	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_016832	AG	3	6	1151726	1151731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_016832	AGCG	2	8	1151733	1151740	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3593	NC_016832	CGA	2	6	1151741	1151746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_016832	GCAA	2	8	1151749	1151756	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3595	NC_016832	TTC	2	6	1151809	1151814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_016832	ATG	2	6	1151850	1151855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_016832	GCA	2	6	1152648	1152653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_016832	TTG	2	6	1154206	1154211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_016832	CT	3	6	1154218	1154223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3600	NC_016832	CCT	2	6	1154234	1154239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3601	NC_016832	A	6	6	1154429	1154434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_016832	AAT	2	6	1154446	1154451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_016832	AGA	2	6	1154481	1154486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_016832	TAT	2	6	1158724	1158729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_016832	TTAACA	2	12	1158730	1158741	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3606	NC_016832	TAA	2	6	1158742	1158747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_016832	AT	3	6	1159749	1159754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_016832	AGAA	2	8	1161283	1161290	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_016832	ATAA	2	8	1161301	1161308	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_016832	CTA	2	6	1161703	1161708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_016832	AGCCAA	2	12	1163453	1163464	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_016832	T	7	7	1165005	1165011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_016832	GGCA	2	8	1165036	1165043	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3614	NC_016832	AT	3	6	1165102	1165107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_016832	AATT	2	8	1165120	1165127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_016832	GGC	2	6	1165153	1165158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_016832	CACCAG	2	12	1165339	1165350	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3618	NC_016832	CAG	2	6	1165369	1165374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_016832	TCGCTC	2	12	1165404	1165415	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3620	NC_016832	AG	3	6	1168130	1168135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_016832	TGT	2	6	1172584	1172589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_016832	TGT	2	6	1172605	1172610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_016832	GTTG	2	8	1172624	1172631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_016832	GC	3	6	1172633	1172638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3625	NC_016832	CGG	2	6	1172702	1172707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_016832	CCA	2	6	1172735	1172740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3627	NC_016832	GGA	2	6	1172844	1172849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_016832	GGT	2	6	1172862	1172867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_016832	GCGG	2	8	1172907	1172914	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3630	NC_016832	TCA	2	6	1172917	1172922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3632	NC_016832	GCGG	2	8	1173165	1173172	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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3897	NC_016832	GTA	2	6	1218105	1218110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3989	NC_016832	TGC	2	6	1248965	1248970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3995	NC_016832	CGG	2	6	1250471	1250476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3996	NC_016832	TA	3	6	1250569	1250574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3997	NC_016832	ATT	2	6	1250588	1250593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4000	NC_016832	TTTATG	2	12	1250694	1250705	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

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